EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-02594 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIV:9229751-9231119 
TF binding sites/motifs
Number: 78             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIV:9230623-9230633AAATAGAATT+3.01
blmp-1MA0537.1chrIV:9230380-9230390TTTCTTCTCC-3.01
blmp-1MA0537.1chrIV:9230161-9230171GAAACGAATA+3.03
blmp-1MA0537.1chrIV:9230521-9230531AAATTGATTA+3.05
blmp-1MA0537.1chrIV:9230402-9230412AAAGCGATTG+3.1
blmp-1MA0537.1chrIV:9230383-9230393CTTCTCCTCC-3.2
blmp-1MA0537.1chrIV:9230776-9230786GAGAGGAAGA+3
blmp-1MA0537.1chrIV:9229759-9229769AAATCGAAAA+4.3
blmp-1MA0537.1chrIV:9229798-9229808AAATCGAAAA+4.3
blmp-1MA0537.1chrIV:9229810-9229820TTTCGTTTTC-4.49
blmp-1MA0537.1chrIV:9229790-9229800AAAACGAAAA+4.55
blmp-1MA0537.1chrIV:9229816-9229826TTTCCCTTTC-5.19
ceh-22MA0264.1chrIV:9230235-9230245TACAATTGGT-3.02
ceh-22MA0264.1chrIV:9230749-9230759CCACTTGTGT+3.47
ceh-22MA0264.1chrIV:9230931-9230941CCACTTAAAA+4.36
ceh-48MA0921.1chrIV:9230522-9230530AATTGATT-3.03
ceh-48MA0921.1chrIV:9230540-9230548ACCAATAA+3.29
ceh-48MA0921.1chrIV:9230272-9230280TATCGGAC-3.62
ces-2MA0922.1chrIV:9230517-9230525TACAAAAT-3.19
ces-2MA0922.1chrIV:9229901-9229909TGTATAAT-4.13
che-1MA0260.1chrIV:9230162-9230167AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrIV:9230370-9230375GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrIV:9231016-9231030GAGCAGACGCATAA-3.62
daf-12MA0538.1chrIV:9230402-9230416AAAGCGATTGGTCG+3.76
efl-1MA0541.1chrIV:9230826-9230840ATTTCCCGGACAAA-3.08
elt-3MA0542.1chrIV:9230537-9230544TTTACCA+3.02
elt-3MA0542.1chrIV:9230242-9230249GGTAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrIV:9230063-9230070TGTATCA+3.07
elt-3MA0542.1chrIV:9230652-9230659TTAATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrIV:9229913-9229920CTCATCA+3.35
elt-3MA0542.1chrIV:9230700-9230707CTTACCA+3.35
elt-3MA0542.1chrIV:9230442-9230449GAGAAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrIV:9230501-9230508GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrIV:9230109-9230123TTCTGTTTCGCTCA-3.37
eor-1MA0543.1chrIV:9230774-9230788CAGAGAGGAAGATC+3.43
eor-1MA0543.1chrIV:9230107-9230121TTTTCTGTTTCGCT-3.53
eor-1MA0543.1chrIV:9230381-9230395TTCTTCTCCTCCAG-3.65
fkh-2MA0920.1chrIV:9230205-9230212TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrIV:9230529-9230536TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrIV:9230131-9230138AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIV:9230040-9230047TATACAT+3.12
fkh-2MA0920.1chrIV:9230249-9230256TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrIV:9230758-9230765TATACAG+3.15
fkh-2MA0920.1chrIV:9230150-9230157TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrIV:9230535-9230542TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrIV:9230818-9230825TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrIV:9230756-9230763TGTATAC-3.33
fkh-2MA0920.1chrIV:9230211-9230218TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIV:9230513-9230520TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrIV:9230634-9230641TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrIV:9230979-9230986TCAACAC+3.57
lim-4MA0923.1chrIV:9230343-9230351GCAATTAT+3.17
lim-4MA0923.1chrIV:9230719-9230727GTAATCAG+3.19
lim-4MA0923.1chrIV:9229780-9229788TCAATTAA+3.3
lin-14MA0261.1chrIV:9230842-9230847AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrIV:9230736-9230741AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrIV:9231008-9231013AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrIV:9229971-9229976AACAC+3.62
pal-1MA0924.1chrIV:9229954-9229961TTATGGT-3.21
pal-1MA0924.1chrIV:9229917-9229924TCATTAA+3.26
pal-1MA0924.1chrIV:9230671-9230678TTATGAC-3.79
pha-4MA0546.1chrIV:9230755-9230764GTGTATACA+3.01
pha-4MA0546.1chrIV:9230635-9230644TTTTACTTA-3.15
pha-4MA0546.1chrIV:9230206-9230215ATTTATAAA-3.29
pha-4MA0546.1chrIV:9230976-9230985GAATCAACA+3.42
pha-4MA0546.1chrIV:9230530-9230539ATTTATTTT-3.76
skn-1MA0547.1chrIV:9229910-9229924GTTCTCATCATTAA-3.93
skn-1MA0547.1chrIV:9230661-9230675AAAAGCTGATTTAT+4.24
sma-4MA0925.1chrIV:9230390-9230400TCCAGACTGA-3.4
sma-4MA0925.1chrIV:9230173-9230183TTGTCTGTGG+3.76
snpc-4MA0544.1chrIV:9230795-9230806AGTCGGCGGCC+4.15
snpc-4MA0544.1chrIV:9230324-9230335GTAGCCGACAA-4.51
unc-86MA0926.1chrIV:9230040-9230047TATACAT+3.07
vab-7MA0927.1chrIV:9229917-9229924TCATTAA+3.43
zfh-2MA0928.1chrIV:9229959-9229969GTTAATTTTC+3.07
zfh-2MA0928.1chrIV:9229780-9229790TCAATTAAAA-3.11
zfh-2MA0928.1chrIV:9230145-9230155ATTAATTTTT+3.16
zfh-2MA0928.1chrIV:9230142-9230152AAAATTAATT-3.16
Enhancer Sequence
ACAAAAAAAA ATCGAAAAAC GACGCTTTTT CAATTAAAAA AAACGAAAAA TCGAAAAGTT 60
TTCGTTTTCC CTTTCTTGAA AATTTGAAAA TTCGATTTTT CAAAAATTAG CTTAAAATTT 120
TGGTCATTGT TCTTCTTTTT AGAAAAAATT TGTATAATTG TTCTCATCAT TAAGAACAAA 180
ATTAGATTTT AAAAACCCAT ATTTTATGGT TAATTTTCTG AACACTTTTT TTTGATTTAA 240
AAAAATTTGA AAAATCGGAA ATTTTCGGTT TTCGTACTCC AATATAATAT ATACATCGAA 300
AATTTGAAAA ATTGTATCAA ATAAGGACAT TTTTGAATTT TTTTCGATTT ACGATTTTTT 360
CTGTTTCGCT CAAAGAACCA AAAACAAATT TAAAATTAAT TTTTACAGCA GAAACGAATA 420
TATTGTCTGT GGTAACCTTG CCCAGTTTTG AAGTTATTTA TAAAAAAAAA ACTAAAATCA 480
CTTTTACAAT TGGTAAAATA AAAACTTTTA AAAAATCGGA TTATCGGACG CCGAGCCAGG 540
AATTGCTCCG ATGCCGAGTT GAAGGGTGGC TCCGTAGCCG ACAAGGTTCT CCGCAATTAT 600
TTTTCCGATT CTTTGCTCGG TTTCCGACAT TTCTTCTCCT CCAGACTGAC GAAAGCGATT 660
GGTCGATCCG TTTGAACCAT TGCAGCGAAA TGAGAAGAAT GGACAGTAGT GTGACCGCGA 720
CTACGGGGCA TTGTGCTGTT GGCGAGGGCT GAAAAAACAT TTTTTTTACA AAATTGATTA 780
TTTATTTTTA CCAATAATCT TTTTGGCACT AGTCGCTGCT GCCAGTGTCG TGTCAATGTC 840
GACTCCAAGT GTACAGAATC CAAGCTCATC TGAAATAGAA TTTTTTTTAC TTATAAAGTT 900
TTTAATCACA AAAAGCTGAT TTATGACGAC TTAAAGCAAA TTTCAAATTC TTACCAGGTG 960
GCGAGACAGT AATCAGTGCA AAATGAACAT TCAGAGTTCC ACTTGTGTAT ACAGAGGGAA 1020
CTTCAGAGAG GAAGATCGGA GTGTAGTCGG CGGCCCCCAA TTTAACATTT TTACGATTTC 1080
CCGGACAAAT GAACAGGCTG TTGTTTTGAA TTTTTCCTGA AAGAAGTAAA TTTAAAAATT 1140
TTAATATCCG TGATATTTAG GGTCGAATTG TGGACAATTT CCACTTAAAA TTAGATGAGA 1200
CATTCGGATA CTGTTGAGAT TCGCCGAATC AACACGACCA CGAAATGCTT CGAGAAGAAC 1260
ATTTGGAGCA GACGCATAAT TCATCAGAAT CTGAAATGAT CTGGATTTTA GGGATGTTTT 1320
TTTTTTGATT TTATAGGTTT TGCTACTCTT CATTTCGTGC CTCCTTTC 1368