EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-02541 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIV:8256851-8257666 
TF binding sites/motifs
Number: 47             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIV:8257355-8257365TATCATTTTT-4.03
ceh-48MA0921.1chrIV:8257342-8257350TTCGATAT+3.07
ceh-48MA0921.1chrIV:8257538-8257546ACCGATAA+4.8
ces-2MA0922.1chrIV:8257116-8257124GTACGCAA+3.07
ces-2MA0922.1chrIV:8257248-8257256TTATAAAA+3.18
ces-2MA0922.1chrIV:8256988-8256996TTTATAAT-3.18
ces-2MA0922.1chrIV:8257000-8257008TTTATAAT-3.18
daf-12MA0538.1chrIV:8257118-8257132ACGCAAACACCGAC-3.22
dsc-1MA0919.1chrIV:8257003-8257012ATAATTAAA+3.05
dsc-1MA0919.1chrIV:8257003-8257012ATAATTAAA-3.05
elt-3MA0542.1chrIV:8256960-8256967TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrIV:8257277-8257284GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrIV:8257541-8257548GATAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrIV:8257353-8257360ATTATCA+3.81
eor-1MA0543.1chrIV:8257388-8257402CAGAGATACACACA+3.93
fkh-2MA0920.1chrIV:8257543-8257550TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrIV:8257603-8257610TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrIV:8257283-8257290AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIV:8256954-8256961TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIV:8256912-8256919TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIV:8257251-8257258TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIV:8256986-8256993TTTTTAT-3.3
lim-4MA0923.1chrIV:8257003-8257011ATAATTAA+3.37
lim-4MA0923.1chrIV:8256931-8256939CTAATCAA+3.41
lim-4MA0923.1chrIV:8257305-8257313TGATTAGG-3.41
lim-4MA0923.1chrIV:8257004-8257012TAATTAAA-3
lin-14MA0261.1chrIV:8257474-8257479AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrIV:8256895-8256900TGTTC-3.01
mab-3MA0262.1chrIV:8257164-8257176TTTTGCAACATC-4.7
pal-1MA0924.1chrIV:8257004-8257011TAATTAA+3.54
pal-1MA0924.1chrIV:8257638-8257645TTATTAT-3.63
pha-4MA0546.1chrIV:8257118-8257127ACGCAAACA+3.18
pha-4MA0546.1chrIV:8257323-8257332ATTTGTATT-3.67
skn-1MA0547.1chrIV:8257218-8257232AAATAATGACGAAT+3.07
skn-1MA0547.1chrIV:8257350-8257364AATATTATCATTTT-3.15
skn-1MA0547.1chrIV:8257270-8257284TAATCATGACAAAA+5.09
skn-1MA0547.1chrIV:8256960-8256974TTTGTCATGATTAT-5.09
sma-4MA0925.1chrIV:8257371-8257381CTTTCTGGTT+3.39
unc-86MA0926.1chrIV:8257053-8257060TTTGCAT+3.09
unc-86MA0926.1chrIV:8257141-8257148TATTCAT+3.68
vab-7MA0927.1chrIV:8256932-8256939TAATCAA+3.13
vab-7MA0927.1chrIV:8257305-8257312TGATTAG-3.13
vab-7MA0927.1chrIV:8257221-8257228TAATGAC+3
vab-7MA0927.1chrIV:8257004-8257011TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrIV:8257002-8257012TATAATTAAA+3.29
zfh-2MA0928.1chrIV:8257153-8257163CAAATTAAAT-3.38
zfh-2MA0928.1chrIV:8257003-8257013ATAATTAAAT-3.72
Enhancer Sequence
AGGGTCTTTT AATTTTTTGA GCATAGAAAA TCATGAAAGC TGCCTGTTCC TTGGAAAAAA 60
ATAAAAAATA AATTTTAGGC CTAATCAAAT TTTTTCCGGA TATTGTTTTT TTGTCATGAT 120
TATATGTTTT TAAATTTTTT ATAATGTGTT TTATAATTAA ATTCGCTATT ATTTCCATCG 180
TAATGTCCTT TTCGAGGCAG AATTTGCATT AAATTTCATT GAAAGTTTCG TGCGTCAAAT 240
AGGATGCTTC ATACGCAAAC GTAAAGTACG CAAACACCGA CCGTATACCG TATTCATCGA 300
AACAAATTAA ATTTTTTGCA ACATCTATTT TTCAGCTCGA ACTGTTAAAT TTTGCTTGAA 360
ATGAAGGAAA TAATGACGAA TTTTGTTATA AAACACATTA TAAAAAATTT AGAAACATAT 420
AATCATGACA AAAAAACAAT ATCCGGAGGA AATTTGATTA GGACTAAAAT TTATTTGTAT 480
TTGTTCCATT TTTCGATATA ATATTATCAT TTTTGTTCAA CTTTCTGGTT CAAAATACAG 540
AGATACACAC AATGGACATG AAATGATCAC TTTTCAGGAA ATATTTTAGG CCAGATACGT 600
CTATTTCGAT CCAGGATACA AGGAACAGGC AGCTTTCATG ATTTTCTATG CTCAAAAAAT 660
TAAAAGACCC TATGCTCAAC TTGAAAAACC GATAAAAATA GTCAAATGAC CTCAATTCCA 720
TGAAGAAATT CTTGTTGAGA GATATTACTG TTTGTTGAAT GTCGATCATA CTCGTGCGAA 780
CTAAGTTTTA TTATAGCCTT CGATGAGGCT GGCCG 815