EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-02373 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIV:3316773-3317900 
TF binding sites/motifs
Number: 61             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIV:3317008-3317018ACTCAATCTT-3.11
blmp-1MA0537.1chrIV:3317263-3317273CCTCGTCTTT-3.17
blmp-1MA0537.1chrIV:3316988-3316998ATTCAATTTT-3.45
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIV:3316882-3316895TTAGTTCCATTAA+3.67
ceh-22MA0264.1chrIV:3317812-3317822TTCAAGAGGA-3.82
ceh-22MA0264.1chrIV:3317808-3317818CTACTTCAAG+3.91
ces-2MA0922.1chrIV:3317230-3317238TCCATAAT-3.32
ces-2MA0922.1chrIV:3317229-3317237TTCCATAA+3.46
che-1MA0260.1chrIV:3317532-3317537AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrIV:3317244-3317249GTTTC-3.06
daf-12MA0538.1chrIV:3317861-3317875ACCAAGACGCGCTC-3.84
dsc-1MA0919.1chrIV:3316891-3316900TTAATTATA+3.33
dsc-1MA0919.1chrIV:3316891-3316900TTAATTATA-3.33
dsc-1MA0919.1chrIV:3316808-3316817TTAATTAAT+3.84
dsc-1MA0919.1chrIV:3316808-3316817TTAATTAAT-3.84
efl-1MA0541.1chrIV:3317511-3317525ACTGGGCGCCAGCA-3.48
efl-1MA0541.1chrIV:3317512-3317526CTGGGCGCCAGCAT+3.75
elt-3MA0542.1chrIV:3317286-3317293TTTATCC+3.02
elt-3MA0542.1chrIV:3317204-3317211TTTATCA+3.21
elt-3MA0542.1chrIV:3317735-3317742GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrIV:3317652-3317666GTCTTTTTCGCTAC-3.18
eor-1MA0543.1chrIV:3317716-3317730GTCTTTTTCGCTAC-3.18
eor-1MA0543.1chrIV:3317780-3317794GTCTTTTTCGCTAC-3.18
eor-1MA0543.1chrIV:3317269-3317283CTTTATGTTTCCTA-3.27
eor-1MA0543.1chrIV:3317261-3317275CCCCTCGTCTTTAT-3.35
fkh-2MA0920.1chrIV:3317053-3317060TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIV:3317087-3317094TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIV:3317856-3317863TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrIV:3317284-3317291TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrIV:3317351-3317358TAAATAA+3.21
fkh-2MA0920.1chrIV:3317168-3317175TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrIV:3317090-3317097TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrIV:3317215-3317222TGTTGAT-3.66
lim-4MA0923.1chrIV:3316891-3316899TTAATTAT+3.12
lim-4MA0923.1chrIV:3316892-3316900TAATTATA-3.37
lim-4MA0923.1chrIV:3316808-3316816TTAATTAA+3.59
lim-4MA0923.1chrIV:3316809-3316817TAATTAAT-3.75
lin-14MA0261.1chrIV:3317037-3317042TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrIV:3317141-3317146TGTTC-3.14
mab-3MA0262.1chrIV:3317273-3317285ATGTTTCCTAGT+3.48
mab-3MA0262.1chrIV:3317676-3317688AATAGCTACATT-3.55
mab-3MA0262.1chrIV:3317740-3317752AATAGCTACATT-3.55
pal-1MA0924.1chrIV:3317066-3317073TTATTGT-3.46
pal-1MA0924.1chrIV:3317093-3317100TTATTGT-3.46
pal-1MA0924.1chrIV:3316892-3316899TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrIV:3317596-3317605TGGCAAACA+3.43
pha-4MA0546.1chrIV:3317348-3317357TAGTAAATA+3.59
skn-1MA0547.1chrIV:3317484-3317498TTTGTCAGCATAAG-4.16
sma-4MA0925.1chrIV:3317310-3317320TTTTCTAGAT+3.05
sma-4MA0925.1chrIV:3317547-3317557AATAGACAAA-3.08
unc-62MA0918.1chrIV:3317562-3317573ATTGACAGCAT-3.59
unc-86MA0926.1chrIV:3316898-3316905TATTCAT+3.87
vab-7MA0927.1chrIV:3316809-3316816TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrIV:3316809-3316816TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrIV:3316892-3316899TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrIV:3317025-3317035AAAATTAAGA-3.03
zfh-2MA0928.1chrIV:3316891-3316901TTAATTATAT-3.37
zfh-2MA0928.1chrIV:3316807-3316817TTTAATTAAT+3.84
zfh-2MA0928.1chrIV:3316890-3316900ATTAATTATA+3.99
zfh-2MA0928.1chrIV:3317191-3317201TTTAATTTTT+3
zfh-2MA0928.1chrIV:3316808-3316818TTAATTAATC-4.31
Enhancer Sequence
ACCGTCATTT TTTTGTTGTT GTTTTGACCC AATTTTTAAT TAATCTGTTT TTTTTCTTTT 60
TGTTAAGCAT GTTGTAGATT TCTCAAGTTG TTAAGTTCTT AACCGAGTTT TAGTTCCATT 120
AATTATATTC ATTCCCAGTG TTTTTTTCGA GACGGTTCAA AAAGCCTTTA GCATTATACC 180
GGTATTTCAC AACGCCATCT CCCCATTCCT TTGACATTCA ATTTTAAAAT TCCCCACTCA 240
ATCTTTCATT CGAAAATTAA GAACTGTTCC AACTATAGTT TGTTTTTTTT GTTTTATTGT 300
TAAAGGCAGT TCTTTGTTTT TTATTGTTCT AGATGTTGTT AGTTTTTTAG ATTTTTTGTA 360
TTTTTTGATG TTCAGAAAGA CAATCTGACT TGTTTTGTTT TCCACCCATA ACCATCTCTT 420
TAATTTTTTG GTTTATCATA TTTGTTGATC TCCACATTCC ATAATTTACC CGTTTCACTT 480
CACTCATTCC CCTCGTCTTT ATGTTTCCTA GTTTTTATCC CCATTCATTG TAAGGGTTTT 540
TCTAGATGAA TCGGATTAAA AAAAACTCAT ATTTATAGTA AATAAAGCCA AAAGAGCTCG 600
AAATTTGGTA TTGTGCTCTT TTTGGAGCAC GAAATCCGCA GAAAAAAATT TTGCCAGCAT 660
AAGAATATTT TTCAAAACGG GCCAATTTTC TTGTATTCTT ATGCTGACTT CTTTGTCAGC 720
ATAAGAAGAT TTCAATGTAC TGGGCGCCAG CATAAGAAGA AACGACAGCA TAAGAATAGA 780
CAAAAAACCA TTGACAGCAT AAGAAGACGT CAGCATAAGA ATATGGCAAA CACTTTTTGA 840
CTACTGGATT TTTGACTACA TTGCTTTTTG ACTACGAGTG TCTTTTTCGC TACTGACCGA 900
AAAAATAGCT ACATTCGCAC TTTTGTCTTT TTGACTACTG AATGTCTTTT TCGCTACTGA 960
CTGAAAAAAT AGCTACATTC GCACTTTTGT CTTTTTGACT ACTGAATGTC TTTTTCGCTA 1020
CTGACTGAAA AATAGCTACT TCAAGAGGAC TACATTCGCA CTTTTGACTT TTTGACTACC 1080
ACATAAAAAC CAAGACGCGC TCCGACCGAC TGGCGTTTTC CAAAACT 1127