EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-02084 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:13450806-13451696 
TF binding sites/motifs
Number: 57             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:13451672-13451682ATTCAATTTT-3.04
blmp-1MA0537.1chrIII:13451403-13451413AAATCGATGG+3.18
blmp-1MA0537.1chrIII:13451151-13451161CATCGATTTT-3.18
blmp-1MA0537.1chrIII:13451521-13451531TCTCAATTTT-4.6
blmp-1MA0537.1chrIII:13451032-13451042AAATTGAAAA+4.82
blmp-1MA0537.1chrIII:13450869-13450879TTTCATTTTT-5.14
ceh-22MA0264.1chrIII:13451634-13451644CTACTCCACC+3.51
ceh-22MA0264.1chrIII:13450918-13450928GTGGAGTAGC-3.51
ceh-48MA0921.1chrIII:13451405-13451413ATCGATGG+3.07
ceh-48MA0921.1chrIII:13451151-13451159CATCGATT-3.07
ceh-48MA0921.1chrIII:13451333-13451341TATCGAAA-3.29
ces-2MA0922.1chrIII:13451501-13451509TTAGGCAA+3.14
ces-2MA0922.1chrIII:13451054-13451062TGCCTAAT-3.14
ces-2MA0922.1chrIII:13451538-13451546TCATATAA+3.25
ces-2MA0922.1chrIII:13451017-13451025TATATGAT-3.25
ces-2MA0922.1chrIII:13451427-13451435TAAAATAA+3
ces-2MA0922.1chrIII:13451128-13451136TATTTTAT-3
daf-12MA0538.1chrIII:13451321-13451335AGCGTGTTTTTTTA+3.6
daf-12MA0538.1chrIII:13451319-13451333TAAGCGTGTTTTTT+3.73
daf-12MA0538.1chrIII:13451100-13451114AGCGCGCTTGCACG+4.86
daf-12MA0538.1chrIII:13451449-13451463GTGCAAGCGCGCTC-4.86
dsc-1MA0919.1chrIII:13451292-13451301TTAATTAAT+4.29
dsc-1MA0919.1chrIII:13451292-13451301TTAATTAAT-4.29
elt-3MA0542.1chrIII:13451519-13451526TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrIII:13451331-13451338TTTATCG+3.07
elt-3MA0542.1chrIII:13450867-13450874TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:13451037-13451044GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:13450986-13450993GATAAAA-4.31
eor-1MA0543.1chrIII:13451356-13451370GACTTTTTTTCTCT-3.21
eor-1MA0543.1chrIII:13451358-13451372CTTTTTTTCTCTAA-3.47
fkh-2MA0920.1chrIII:13451432-13451439TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:13451124-13451131TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:13451249-13451256TAAAAAT+3.19
fkh-2MA0920.1chrIII:13450988-13450995TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:13451329-13451336TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:13451568-13451575TTTTTAT-3.3
lim-4MA0923.1chrIII:13451223-13451231TCAATTAA+3.3
lim-4MA0923.1chrIII:13451292-13451300TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrIII:13451293-13451301TAATTAAT-3.75
pal-1MA0924.1chrIII:13451297-13451304TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrIII:13451571-13451578TTATTAT-3.63
pha-4MA0546.1chrIII:13451429-13451438AAATAAATA+3.76
pha-4MA0546.1chrIII:13451125-13451134ATTTATTTT-3.76
skn-1MA0547.1chrIII:13451201-13451215AAGTCAAGATAAAT+3.79
skn-1MA0547.1chrIII:13451348-13451362TTTATCTTGACTTT-3.79
skn-1MA0547.1chrIII:13450979-13450993ATATCATGATAAAA+4.76
sma-4MA0925.1chrIII:13451664-13451674ACCAGAAAAT-3.28
unc-62MA0918.1chrIII:13450896-13450907AAATGTCAGTT+3.77
unc-86MA0926.1chrIII:13451342-13451349TTTGCAT+3.09
unc-86MA0926.1chrIII:13451214-13451221TGCAAAT-3.09
vab-7MA0927.1chrIII:13451293-13451300TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrIII:13451293-13451300TAATTAA-3.22
zfh-2MA0928.1chrIII:13451223-13451233TCAATTAAAA-3.11
zfh-2MA0928.1chrIII:13451295-13451305ATTAATTTCA+3.2
zfh-2MA0928.1chrIII:13451288-13451298TGAATTAATT-3.36
zfh-2MA0928.1chrIII:13451291-13451301ATTAATTAAT+4.38
zfh-2MA0928.1chrIII:13451292-13451302TTAATTAATT-4.38
Enhancer Sequence
ATAGCTCAAA AACTCATATT CCCAGCAGAA AAACTGCGAA AATTCACTGA AAAATGTTTT 60
TTTTTTCATT TTTTGGGCTA AAAATACAAA AAATGTCAGT TTTTCATTAA AGGTGGAGTA 120
GCGCCAGTGG GGGAAATTGC TTTAAAACAC GCCTATGGTA CCACAATGAC CAAATATCAT 180
GATAAAAAAT TCAAAAAAAT TTTCTAAATT TTATATGATT TTTTGAAAAT TGAAAAAATC 240
TCAGTTTTTG CCTAATTCCA ATTTGAATTA CCGCCAATTG GAGTTGTTCG ATGGAGCGCG 300
CTTGCACGTT TTTAAATTTA TTTATTTTAT TTTTTTGTTA TTTTCCATCG ATTTTTAATG 360
TTTTTGGTGT ATTTTTGCTT GAATTTTAGA GAAAAAAGTC AAGATAAATG CAAATTTTCA 420
ATTAAAAAGC ACGCTTGCAG GCGTAAAAAT TACAAAGTAA CGATTTTAAA CGATTTCGAA 480
CCTGAATTAA TTAATTTCAC TGATTTACGC CTGTAAGCGT GTTTTTTTAT CGAAAATTTG 540
CATTTATCTT GACTTTTTTT CTCTAAAATT CAAGCAAAAA TACACCAAAA ACATTGAAAA 600
TCGATGGAAA ATAACAAAAA ATAAAATAAA TAAATTTAAA AACGTGCAAG CGCGCTCCAT 660
CGAACAACTC CAATTGGCGG TAATTCAAAT TGGAATTAGG CAAAAACTGA GATTTTCTCA 720
ATTTTCAAAA AATCATATAA AATTTAGAAA ATTTTTTGAA TTTTTTTATT ATGATATTCG 780
GTCATTGTGG TACCATAGGC GTGTTTTAAA GCAATTTCCC CACTGGCGCT ACTCCACCTT 840
TAAATATCTT ATTTAAAAAC CAGAAAATTC AATTTTTGCC TGGAAAAAGT 890