EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-02080 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:13368347-13369847 
TF binding sites/motifs
Number: 109             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:13368571-13368581ACTCAATTTT-3.02
blmp-1MA0537.1chrIII:13369379-13369389AGAGAGAATA+3.41
blmp-1MA0537.1chrIII:13369540-13369550AGAGAGAATA+3.41
blmp-1MA0537.1chrIII:13369704-13369714AGAGAGAATA+3.41
blmp-1MA0537.1chrIII:13368369-13368379AAAAAGAAGT+3.44
blmp-1MA0537.1chrIII:13369189-13369199TTTCTACTTC-3.73
blmp-1MA0537.1chrIII:13368609-13368619TTTCAACTTT-3.81
blmp-1MA0537.1chrIII:13369375-13369385AAAAAGAGAG+4.76
blmp-1MA0537.1chrIII:13369536-13369546AAAAAGAGAG+4.76
blmp-1MA0537.1chrIII:13369700-13369710AAAAAGAGAG+4.76
blmp-1MA0537.1chrIII:13368995-13369005AAAATGAAAA+5.14
blmp-1MA0537.1chrIII:13369377-13369387AAAGAGAGAA+5.33
blmp-1MA0537.1chrIII:13369538-13369548AAAGAGAGAA+5.33
blmp-1MA0537.1chrIII:13369702-13369712AAAGAGAGAA+5.33
ceh-48MA0921.1chrIII:13368869-13368877CTCAATAT+3.03
ceh-48MA0921.1chrIII:13368874-13368882TATTGATC-3.74
ces-2MA0922.1chrIII:13369256-13369264TTACTTAA+3.85
che-1MA0260.1chrIII:13369243-13369248GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrIII:13369301-13369315GAGCCAACACACAC-3.23
daf-12MA0538.1chrIII:13369467-13369481CAACTCACACATAT-3.57
daf-12MA0538.1chrIII:13369303-13369317GCCAACACACACTT-3.69
daf-12MA0538.1chrIII:13369305-13369319CAACACACACTTAT-4.4
dsc-1MA0919.1chrIII:13369321-13369330ATAATTACA+3.06
dsc-1MA0919.1chrIII:13369483-13369492ATAATTACA+3.06
dsc-1MA0919.1chrIII:13369647-13369656ATAATTACA+3.06
dsc-1MA0919.1chrIII:13369812-13369821ATAATTACA+3.06
dsc-1MA0919.1chrIII:13369321-13369330ATAATTACA-3.06
dsc-1MA0919.1chrIII:13369483-13369492ATAATTACA-3.06
dsc-1MA0919.1chrIII:13369647-13369656ATAATTACA-3.06
dsc-1MA0919.1chrIII:13369812-13369821ATAATTACA-3.06
elt-3MA0542.1chrIII:13369018-13369025GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrIII:13368902-13368909TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:13368391-13368398GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:13368682-13368689GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:13369373-13369380GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrIII:13368497-13368511AAAAGTGGCAAACA+3.28
eor-1MA0543.1chrIII:13369374-13369388AAAAAAGAGAGAAT+3.36
eor-1MA0543.1chrIII:13368658-13368672AAAAAAAAGACAGA+3.3
eor-1MA0543.1chrIII:13369372-13369386TGAAAAAAGAGAGA+3.43
eor-1MA0543.1chrIII:13368656-13368670CAAAAAAAAAGACA+3.44
fkh-2MA0920.1chrIII:13368429-13368436TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:13368719-13368726TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:13369318-13369325TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:13369480-13369487TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:13369644-13369651TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:13369809-13369816TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:13368407-13368414AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:13369530-13369537TGTTTAA-3.28
fkh-2MA0920.1chrIII:13369694-13369701TGTTTAA-3.28
fkh-2MA0920.1chrIII:13368640-13368647TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:13368935-13368942TAAAAAA+3.3
lim-4MA0923.1chrIII:13368580-13368588TGATTGCC-3.16
lim-4MA0923.1chrIII:13369322-13369330TAATTACA-3.22
lim-4MA0923.1chrIII:13369484-13369492TAATTACA-3.22
lim-4MA0923.1chrIII:13369648-13369656TAATTACA-3.22
lim-4MA0923.1chrIII:13369813-13369821TAATTACA-3.22
lim-4MA0923.1chrIII:13368377-13368385GTCATTAG+3.24
lim-4MA0923.1chrIII:13368963-13368971GTCATTAG+3.24
lin-14MA0261.1chrIII:13368886-13368891AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrIII:13368415-13368427AAGTTGCCTAAA+3.55
mab-3MA0262.1chrIII:13368790-13368802AATGGCAAAAAT-3.76
pal-1MA0924.1chrIII:13369322-13369329TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrIII:13369484-13369491TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrIII:13369648-13369655TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrIII:13369813-13369820TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrIII:13368808-13368815TTATGGC-3.51
pal-1MA0924.1chrIII:13369114-13369121TTATGGC-3.51
pal-1MA0924.1chrIII:13368580-13368587TGATTGC-3
pha-4MA0546.1chrIII:13369641-13369650TTATAAATA+3.29
pha-4MA0546.1chrIII:13369806-13369815TTATAAATA+3.29
pha-4MA0546.1chrIII:13369325-13369334TTACAAACA+3.32
pha-4MA0546.1chrIII:13369477-13369486ATATAAATA+3.46
pha-4MA0546.1chrIII:13369384-13369393GAATAAATA+3.78
pha-4MA0546.1chrIII:13369545-13369554GAATAAATA+3.78
pha-4MA0546.1chrIII:13369709-13369718GAATAAATA+3.78
pha-4MA0546.1chrIII:13369301-13369310GAGCCAACA+4.13
pha-4MA0546.1chrIII:13369627-13369636GAGCCAACA+4.13
pha-4MA0546.1chrIII:13369792-13369801GAGCCAACA+4.13
skn-1MA0547.1chrIII:13368607-13368621TTTTTCAACTTTTA-3.63
skn-1MA0547.1chrIII:13368505-13368519CAAACATGACAATT+3.97
unc-62MA0918.1chrIII:13368663-13368674AAAGACAGATT-3.12
unc-62MA0918.1chrIII:13369462-13369473TGAGACAACTC-3.26
unc-62MA0918.1chrIII:13368509-13368520CATGACAATTT-3.37
unc-62MA0918.1chrIII:13368799-13368810AATGACAATTT-3.53
unc-86MA0926.1chrIII:13368914-13368921TAGTAAT+3.04
unc-86MA0926.1chrIII:13368735-13368742TTCATAT-3.87
vab-7MA0927.1chrIII:13369164-13369171TAGTTAG-3.05
vab-7MA0927.1chrIII:13369322-13369329TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrIII:13369484-13369491TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrIII:13369648-13369655TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrIII:13369813-13369820TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrIII:13368378-13368385TCATTAG-3.48
vab-7MA0927.1chrIII:13368964-13368971TCATTAG-3.48
vab-7MA0927.1chrIII:13369322-13369329TAATTAC+3.6
vab-7MA0927.1chrIII:13369484-13369491TAATTAC+3.6
vab-7MA0927.1chrIII:13369648-13369655TAATTAC+3.6
vab-7MA0927.1chrIII:13369813-13369820TAATTAC+3.6
zfh-2MA0928.1chrIII:13368440-13368450GGTAATTTGT+3.08
zfh-2MA0928.1chrIII:13368551-13368561GTTAATTTTG+3.15
zfh-2MA0928.1chrIII:13368848-13368858GTTAATTTTG+3.15
zfh-2MA0928.1chrIII:13369154-13369164GTTAATTTTT+3.1
zfh-2MA0928.1chrIII:13369321-13369331ATAATTACAA-3.21
zfh-2MA0928.1chrIII:13369483-13369493ATAATTACAA-3.21
zfh-2MA0928.1chrIII:13369647-13369657ATAATTACAA-3.21
zfh-2MA0928.1chrIII:13369812-13369822ATAATTACAA-3.21
zfh-2MA0928.1chrIII:13369320-13369330AATAATTACA+3.43
zfh-2MA0928.1chrIII:13369482-13369492AATAATTACA+3.43
zfh-2MA0928.1chrIII:13369646-13369656AATAATTACA+3.43
zfh-2MA0928.1chrIII:13369811-13369821AATAATTACA+3.43
Enhancer Sequence
CACAAAAAAA AATTTCCCAA AAAAAAAGAA GTCATTAGGT GGCTGAAAAA AAATTTGGCA 60
AAAACAAAAA GTTGCCTAAA TTTGTTGAAA ACGGGTAATT TGTATAAGAA GAATTTAGAA 120
AATCTAGGTT TAACCCATCA AAAACTATTA AAAAGTGGCA AACATGACAA TTTAAGGCAA 180
AAACTAACCA ACTCCTCTAA AATGGTTAAT TTTGTAGTTA GAGGACTCAA TTTTGATTGC 240
CAAACACTAT AAAATTGCCC TTTTTCAACT TTTAGTGATT TCGAACGTTT TCATAAAAAA 300
ATTTTTTGCC AAAAAAAAAG ACAGATTAGA TGGCTGAAAA AAAATGGGCA AAAATAAAAA 360
GTTGCTTAAA TTTGTTGAAA ACGGGTAATT CATATATGAA GAATTTAGAA AAACTAGGTT 420
TAACCCATCA AAAACTATTG AAAAATGGCA AAAATGACAA TTTATGGCAA AAACTTACAA 480
TTTTGAAACT TCTCTAAAAT GGTTAATTTT GTAGTTAGAC GACTCAATAT TGATCTCCGA 540
ACACTACAAT TGATTTTTTT CATTTTATAG TAATTTCAAA CGTTTTCATA AAAAACTTTT 600
GCCCAAAAAA AGGGCAGTCA TTAGATGACT GAAAAATCAA AATGGGCAAA AATGAAAAGT 660
TGGCAAATTT TGTTAAAACG GGTGATTCAT TTATGGAGAA TTCAGAAAAT CTGGGTTTGA 720
TCCATCAAAA ACTATTAAAA AGTGGCAAAA GTGGCAAAAT TGGCATTTTA TGGCGAAAAT 780
GCACAATTTT GAAACTTCTC TAAGATGGTT AATTTTTTAG TTAGAGGACT CAAATTGCCC 840
TTTTTCTACT TCTAGTAGTT TCAGAAAAAT TATTTTTTTG CCTAAAAAAA AACTAGGTTT 900
CCGCTGATAT TACTTAAATT TTCGAAAAAA AATCTGTTTT TTAGAATTGA CTCTGAGCCA 960
ACACACACTT ATAAATAATT ACAAACATTA TATTTTTGAG TCCTCTATAC ACTGAAATAT 1020
ATGTTTGAAA AAAGAGAGAA TAAATATGTC AAAAATCGAA TTTCTACGAA CTTTTTGAAA 1080
TTTTCGAAAA AAAAACTGTT TTTTAGAATT GACTCTGAGA CAACTCACAC ATATAAATAA 1140
TTACAAGCAT TATATTTTTG AGTCCTCTAT TCACTGAAAT ACATGTTTAA AAAAGAGAGA 1200
ATAAATATGT CAAAAATCGA ATTTTTTCTA CGAACTTTTT GAAATTTTCG AAAAAAAATC 1260
TGTTTTTTAG AATTGACTCT GAGCCAACAC ACATTTATAA ATAATTACAA GCATTATATT 1320
TTTGAGTCCT CTATTCACTG AAATACATGT TTAAAAAAGA GAGAATAAAT ATGTCAAAAA 1380
TCGAATTTTT TCTACGAACT TTTTGAAATT TTCGAAAAAA AAATCTGTTT TTTGGAATTG 1440
ACTCTGAGCC AACACACATT TATAAATAAT TACAAGCATT ATATTTTTGA GTCCTCTATT 1500