EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-02070 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:13216091-13217608 
TF binding sites/motifs
Number: 81             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:13216740-13216750ACTCATTTTC-3.05
blmp-1MA0537.1chrIII:13217200-13217210ATTCTTTTTT-3.09
blmp-1MA0537.1chrIII:13217079-13217089AAAATGAATT+3.12
blmp-1MA0537.1chrIII:13216774-13216784CTTCTTTTCT-3.13
blmp-1MA0537.1chrIII:13216762-13216772TCTCTTTTAT-3.22
blmp-1MA0537.1chrIII:13217578-13217588CCTCTCCTTT-3.52
blmp-1MA0537.1chrIII:13217419-13217429CCTCCATTTT-3.64
blmp-1MA0537.1chrIII:13217580-13217590TCTCCTTTCT-3.81
blmp-1MA0537.1chrIII:13216334-13216344AAAATGATAG+4.03
blmp-1MA0537.1chrIII:13216758-13216768TTTCTCTCTT-4.67
blmp-1MA0537.1chrIII:13216760-13216770TCTCTCTTTT-5.33
blmp-1MA0537.1chrIII:13216691-13216701TTTCACTTTT-6.08
ceh-22MA0264.1chrIII:13217024-13217034TTTAAGTGTA-3.6
ceh-48MA0921.1chrIII:13216560-13216568GCCAATAA+3.36
ceh-48MA0921.1chrIII:13216377-13216385ATCGATAA+3.97
ceh-48MA0921.1chrIII:13216376-13216384TATCGATA-3.97
ces-2MA0922.1chrIII:13216162-13216170TTAAACAA+3.04
ces-2MA0922.1chrIII:13216213-13216221TTGCGCAA+3.07
ces-2MA0922.1chrIII:13216493-13216501TGCGCAAT-3.07
ces-2MA0922.1chrIII:13216264-13216272TTCTATAA+3.19
che-1MA0260.1chrIII:13216773-13216778GCTTC-3.7
dsc-1MA0919.1chrIII:13217548-13217557TTAATAAGT+3.16
dsc-1MA0919.1chrIII:13217548-13217557TTAATAAGT-3.16
dsc-1MA0919.1chrIII:13216644-13216653CAAATTAAT+3.19
dsc-1MA0919.1chrIII:13216644-13216653CAAATTAAT-3.19
efl-1MA0541.1chrIII:13216942-13216956TTTCCCGCCAATTT+3.48
efl-1MA0541.1chrIII:13216227-13216241TGACGCGCAAAATA+3.67
efl-1MA0541.1chrIII:13216636-13216650ATTTCCCGCAAATT-4.58
efl-1MA0541.1chrIII:13216941-13216955ATTTCCCGCCAATT-6.11
elt-3MA0542.1chrIII:13216355-13216362TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrIII:13217104-13217111TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrIII:13217398-13217405TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrIII:13217065-13217072GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrIII:13216374-13216381TTTATCG+3.07
elt-3MA0542.1chrIII:13216859-13216866GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrIII:13217350-13217357TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrIII:13216603-13216610CTTATCT+3.31
elt-3MA0542.1chrIII:13216782-13216789CTAATCA+3.58
elt-3MA0542.1chrIII:13217221-13217228TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:13217293-13217300TTTATCA+4.31
eor-1MA0543.1chrIII:13216757-13216771TTTTCTCTCTTTTA-3.36
eor-1MA0543.1chrIII:13216755-13216769GCTTTTCTCTCTTT-3.48
eor-1MA0543.1chrIII:13216751-13216765TTCCGCTTTTCTCT-3.54
eor-1MA0543.1chrIII:13216713-13216727CTCGTGTTCTCTTG-3.83
fkh-2MA0920.1chrIII:13216124-13216131TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:13217291-13217298TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:13216921-13216928TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:13217100-13217107TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:13216923-13216930TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrIII:13217150-13217157TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:13216118-13216125TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:13217003-13217010TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:13216163-13216170TAAACAA+3.48
fkh-2MA0920.1chrIII:13216669-13216676TCAACAT+3.51
lim-4MA0923.1chrIII:13216158-13216166TTCATTAA+3.07
lin-14MA0261.1chrIII:13216520-13216525TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrIII:13216717-13216722TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrIII:13216489-13216501ATGTTGCGCAAT+4.01
mab-3MA0262.1chrIII:13216213-13216225TTGCGCAACATA-4.01
pal-1MA0924.1chrIII:13216796-13216803TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrIII:13217457-13217464TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrIII:13216768-13216775TTATGGC-3.51
pal-1MA0924.1chrIII:13216127-13216134TTATTAT-3.63
pha-4MA0546.1chrIII:13216353-13216362ATTTTCTCA-3.06
pha-4MA0546.1chrIII:13216666-13216675AAATCAACA+3.57
pha-4MA0546.1chrIII:13216558-13216567AAGCCAATA+3.93
skn-1MA0547.1chrIII:13216529-13216543AATATCTTGATTTC-3.84
skn-1MA0547.1chrIII:13217293-13217307TTTATCAGGAATTT-4.09
sma-4MA0925.1chrIII:13216189-13216199TACAGAAACT-3.28
sma-4MA0925.1chrIII:13217242-13217252TTCAGACAAA-3.34
sma-4MA0925.1chrIII:13217495-13217505TTTTCTGGGT+3.41
unc-86MA0926.1chrIII:13216207-13216214TGCGTAT-3.29
unc-86MA0926.1chrIII:13216273-13216280TGACTAC-3.42
zfh-2MA0928.1chrIII:13217109-13217119CATAATTTGT+3.01
zfh-2MA0928.1chrIII:13216794-13216804CTTAATTTCC+3.12
zfh-2MA0928.1chrIII:13216385-13216395ATTAATTTTT+3.16
zfh-2MA0928.1chrIII:13216647-13216657ATTAATTTTT+3.16
zfh-2MA0928.1chrIII:13216382-13216392TAAATTAATT-3.28
zfh-2MA0928.1chrIII:13217455-13217465ATTAATTTCT+3.2
zfh-2MA0928.1chrIII:13216644-13216654CAAATTAATT-3.51
zfh-2MA0928.1chrIII:13217452-13217462CGAATTAATT-3.63
Enhancer Sequence
CTTTTTTTTT GTAGTTTCAA GATTTATTTT TTATTTTTAT TATAATATTT AAAACACCCT 60
TTAAAAATTC ATTAAACAAA AAAAAACATT ATTACGGGTA CAGAAACTTC AGAGAATGCG 120
TATTGCGCAA CATATTTGAC GCGCAAAATA TCTCGTAGCG AAAACTACAG TAATTCTATA 180
AATGACTACT GTAGCGCTTG TGTCGATTTA CGGGCTTGAT TTTGGAAATG AGTTTATTTT 240
CGAAAAATGA TAGCGATATA TTATTTTCTC ATACAAAAAA TATTTTATCG ATAAATTAAT 300
TTTTAAATCA CTTAAAAATT GAGCCCGTAA ATCGACGCTA CAGTAGACAT TTAAAGAATT 360
ACTGTAGTTT TCGCTACGAG ATATTTTGCT CGTCAAATAT GTTGCGCAAT GCGCATTCTC 420
AGAAATTTCT GTTCCGGTAA TATCTTGATT TCAAATGTCC CAATTTTAAG CCAATAAATC 480
TAAAAACCCA CAGATTAAGT CACGAGATAA CTCTTATCTA TTTATGAAGA TCCTATTAAA 540
TCAGAATTTC CCGCAAATTA ATTTTTTTTT CGCTTAAATC AACATAAATC TGCGGATCCC 600
TTTCACTTTT AATGTCTAAC ATCTCGTGTT CTCTTGGAAT CCGGGTCAAA CTCATTTTCC 660
TTCCGCTTTT CTCTCTTTTA TGGCTTCTTT TCTAATCATT TCACTTAATT TCCAAATCTG 720
TCGCGGTTTT TCTGATTTTT GTGGAACTTT CCGTCACATT TTTTTTCTGA CAAAATTTGA 780
AATTCTCCAA AAATTATGTT TTATGAAAAT ATTAGAATTT CCCACCAAAT TGTTTTTATT 840
GGAAATTACA ATTTCCCGCC AATTTTTTTG TTGGAAGTTT GAATTTCGAG CTAAAAAATT 900
TTTTTTGAGA ATTTTTTATT AAAAAAAAAA ATTTTTAAGT GTAATCTCGA AGTTCAGACC 960
AAAAACTTCA TTTTGAGAAA ATTTAAAAAA AATGAATTAT CAGCCGAATT GTTTTTCTCA 1020
TAATTTGTAA ATTTCCCCCT ACATAGCAAT TGCAATACTT GTTTTCAGAA AATTTGAATT 1080
TCCCACCAAG AAATTTTTTT TTTCTGAGAA TTCTTTTTTT TTTAAAGAAT TTTTTCAGTG 1140
TAAATTCGAA GTTCAGACAA AACACTTATT TTTGAGACAA TTTTAGTTTA CTGGCAAAAA 1200
TTTTTATCAG GAATTTTGAA ATTTCAAATT TCTCGTCAGA AATGGTTTGG AAGGAAAATT 1260
TTAACATCCT GCCAAAATTA GAAAATTTGA ATTTTTCACG AAACATTTTT CTCAGAAAAC 1320
TCGAACTCCC TCCATTTTCT GAACCTATTT GAATTCCTCA CCGAATTAAT TTCTCTTTGA 1380
AATTTTGAAA TTCCCACCAA ATTTTTTTCT GGGTGTTTTA AAAAGTATAG AATACCCAAA 1440
TAAAGTGGCA GTGATAGTTA ATAAGTATCT ATTCAAATGT ATCAAATCCT CTCCTTTCTC 1500
AAACTAATCA CATCTCA 1517