EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-02052 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:13045410-13046324 
TF binding sites/motifs
Number: 48             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:13046236-13046246CATCTATTTC-3.32
blmp-1MA0537.1chrIII:13045756-13045766CTTCATTTTC-4.11
ces-2MA0922.1chrIII:13045687-13045695TTTTGTAA+3.19
ces-2MA0922.1chrIII:13046294-13046302TATGAAAT-3.43
ces-2MA0922.1chrIII:13045763-13045771TTCGTAAT-3.55
ces-2MA0922.1chrIII:13045612-13045620TAAAATAA+3
ces-2MA0922.1chrIII:13045556-13045564TAACATAA+4.27
dsc-1MA0919.1chrIII:13046306-13046315CCAATTAGA+3.52
dsc-1MA0919.1chrIII:13046306-13046315CCAATTAGA-3.52
dsc-1MA0919.1chrIII:13046214-13046223CTAATTACA+3.58
dsc-1MA0919.1chrIII:13046214-13046223CTAATTACA-3.58
efl-1MA0541.1chrIII:13045794-13045808ACATGCGGCAAATT+3.89
efl-1MA0541.1chrIII:13045992-13046006GTGTGCGGCAAATT+4.27
elt-3MA0542.1chrIII:13046190-13046197GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrIII:13045640-13045647TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrIII:13046106-13046113TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:13046223-13046230GATAAAA-3
eor-1MA0543.1chrIII:13045859-13045873TTCTGATTTTCTCT-4.37
fkh-2MA0920.1chrIII:13046157-13046164TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:13045570-13045577TAAACAT+3.81
lim-4MA0923.1chrIII:13045468-13045476ACAATTAA+3.28
lim-4MA0923.1chrIII:13046214-13046222CTAATTAC+3.34
lim-4MA0923.1chrIII:13046215-13046223TAATTACA-3.77
lim-4MA0923.1chrIII:13046306-13046314CCAATTAG+4.06
lin-14MA0261.1chrIII:13045479-13045484TGTTC-3.62
pal-1MA0924.1chrIII:13045679-13045686TAATGAT-3.26
pal-1MA0924.1chrIII:13045469-13045476CAATTAA+3.42
pal-1MA0924.1chrIII:13045567-13045574TAATAAA+3.63
pal-1MA0924.1chrIII:13045609-13045616TAATAAA+3.63
pha-4MA0546.1chrIII:13046241-13046250ATTTCCATT-3.09
pha-4MA0546.1chrIII:13045567-13045576TAATAAACA+3.34
pha-4MA0546.1chrIII:13046092-13046101AAATAAATA+3.76
pha-4MA0546.1chrIII:13045917-13045926GAGCAAATC+3
skn-1MA0547.1chrIII:13045751-13045765AAAATCTTCATTTT-4.47
sma-4MA0925.1chrIII:13045453-13045463ACTAGACCGT-3.03
unc-86MA0926.1chrIII:13045665-13045672TATGAAT+3.58
unc-86MA0926.1chrIII:13046315-13046322TATTCAT+3.87
unc-86MA0926.1chrIII:13045980-13045987TAGGCAT+4.1
vab-7MA0927.1chrIII:13046215-13046222TAATTAC-3.02
vab-7MA0927.1chrIII:13045469-13045476CAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrIII:13045679-13045686TAATGAT-3.43
vab-7MA0927.1chrIII:13046215-13046222TAATTAC+4.31
zfh-2MA0928.1chrIII:13045660-13045670CAAATTATGA-3.01
zfh-2MA0928.1chrIII:13045468-13045478ACAATTAAGA-3.08
zfh-2MA0928.1chrIII:13045647-13045657GTTAATTTTC+3.1
zfh-2MA0928.1chrIII:13046306-13046316CCAATTAGAT-3.21
zfh-2MA0928.1chrIII:13046213-13046223CCTAATTACA+3.66
zfh-2MA0928.1chrIII:13046214-13046224CTAATTACAG-3.71
Enhancer Sequence
AATTTCGAAA AATCTGGATT TTTTGATTTG ATTGAATAGC AAGACTAGAC CGTCTAAAAC 60
AATTAAGAGT GTTCAAAAAT TTTAGTCAAA GTTATGGTAA ATTGTTAAAT TTTTCAAAAA 120
TGTGGACATT TTGAGAAATT TCAAAATAAC ATAAAGATAA TAAACATGTG GAAAATAATT 180
TTTCAAACCA TTTCTAAAAT AATAAAATAA AATCTAAACT ATTGTGGCTT TTTAACAGTT 240
AATTTTCAAA CAAATTATGA ATAGTTTTTT AATGATATTT TGTAAATTTA GCACAGTTTT 300
AAAAAATTCA AAACTGCAAA AAAAAAAAGT TTAAGTTGTC TAAAATCTTC ATTTTCGTAA 360
TCATTCAGTC ATTCCACATC AGGGACATGC GGCAAATTTG GCGAATTTGC CGAATTTGCC 420
GAACTTGGTA CGTTGGTGAC CTACAGGTTT TCTGATTTTC TCTGTGTCCC CCCTTTCGGT 480
GTGTCCATGC CTGGCCGATG GGAGGCAGAG CAAATCGGGA AGACTGTAGG ATGCTATGTG 540
CCAAGTTATA GATATAGATC GTACTATAGA TAGGCATCAG GGGTGTGCGG CAAATTTCCC 600
GAATTTGCCG TTTGTCAAGC TCGGCAAATT TTGAGATGTG TCGCACACCT TTGTTCTACA 660
TGTACGAAAA TTTAAATTTT AAAAATAAAT ATAGCTTTTT TCAATGCCAA AAGACTCGAA 720
ATATAACCAA ATAAACGAAG TTTGTTATAA AAATTCTTTA AAATGTCTTA AATTTTTTTT 780
GACAAAAAAT TCCAAATTTC GAGCCTAATT ACAGATAAAA TCTCCCCATC TATTTCCATT 840
TAAACTGCTA CAAAAATTTT TGAGAAAGTG CAATAAGTTC TCGTTATGAA ATTTGGCCAA 900
TTAGATATTC ATAG 914