EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-02043 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:12899261-12899900 
TF binding sites/motifs
Number: 41             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:12899290-12899300TATCATCCTT-3.12
blmp-1MA0537.1chrIII:12899455-12899465AGGAGGAAAA+3.42
ceh-48MA0921.1chrIII:12899438-12899446ACCAATAT+3.07
ceh-48MA0921.1chrIII:12899390-12899398TATCGGCT-3.41
ceh-48MA0921.1chrIII:12899357-12899365GCCGATAT+3.56
ceh-48MA0921.1chrIII:12899845-12899853GCCGATTA+3
ces-2MA0922.1chrIII:12899595-12899603TACGAAAT-3.46
ces-2MA0922.1chrIII:12899594-12899602TTACGAAA+3.55
dsc-1MA0919.1chrIII:12899698-12899707TTAATTATT+3.33
dsc-1MA0919.1chrIII:12899698-12899707TTAATTATT-3.33
fkh-2MA0920.1chrIII:12899560-12899567TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:12899731-12899738TGTTGAC-3.55
fkh-2MA0920.1chrIII:12899335-12899342TGTTGAT-3.66
hlh-1MA0545.1chrIII:12899726-12899736GCATCTGTTG-4.53
hlh-1MA0545.1chrIII:12899830-12899840AACAGTTGAC+5.11
lim-4MA0923.1chrIII:12899591-12899599TCATTACG-3.04
lim-4MA0923.1chrIII:12899409-12899417TTAATCAA+3.05
lim-4MA0923.1chrIII:12899338-12899346TGATTAAG-3.05
lim-4MA0923.1chrIII:12899699-12899707TAATTATT-3.57
lim-4MA0923.1chrIII:12899698-12899706TTAATTAT+3
lin-14MA0261.1chrIII:12899616-12899621AACAT+3.14
mab-3MA0262.1chrIII:12899496-12899508ATAGGCAAAATT-3.96
pal-1MA0924.1chrIII:12899419-12899426AAATTAA+3.07
pal-1MA0924.1chrIII:12899591-12899598TCATTAC-3.17
pal-1MA0924.1chrIII:12899557-12899564CCATAAA+3.21
pal-1MA0924.1chrIII:12899699-12899706TAATTAT-3.54
pal-1MA0924.1chrIII:12899449-12899456CAATAAA+4.12
pal-1MA0924.1chrIII:12899299-12899306TTATTGC-4.12
pha-4MA0546.1chrIII:12899336-12899345GTTGATTAA-3.26
pha-4MA0546.1chrIII:12899363-12899372ATGTAACCA+3
skn-1MA0547.1chrIII:12899288-12899302ATTATCATCCTTTA-5.25
unc-62MA0918.1chrIII:12899876-12899887AACTGTCTCCA+3.43
unc-86MA0926.1chrIII:12899445-12899452TATGCAA+3.11
unc-86MA0926.1chrIII:12899303-12899310TGCATAT-3.11
unc-86MA0926.1chrIII:12899753-12899760TGGATAT-3.14
vab-7MA0927.1chrIII:12899591-12899598TCATTAC-3.29
vab-7MA0927.1chrIII:12899699-12899706TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrIII:12899327-12899337TTTAATTTTG+3.04
zfh-2MA0928.1chrIII:12899418-12899428GAAATTAAAT-3.07
zfh-2MA0928.1chrIII:12899698-12899708TTAATTATTC-3.5
zfh-2MA0928.1chrIII:12899697-12899707TTTAATTATT+3.64
Enhancer Sequence
CATTGGTCCG AAATTGACTT TTTCGGAATT ATCATCCTTT ATTGCATATT TTGGTAGTTT 60
ATCTCATTTA ATTTTGTTGA TTAAGGTACA TTTAAAGCCG ATATGTAACC AAAAATGGTC 120
AAAATTACCT ATCGGCTTTA AATGTACCTT AATCAACGAA ATTAAATGAG ATAAACTACC 180
AATATATGCA ATAAAGGAGG AAAAAGTCAA CTTCGGACCA ATGTGACACC GAAAAATAGG 240
CAAAATTCAA GATTTTTAGC TAAAATCAGT GTAATTTTTT TCGAAATTTT GAACGACCAT 300
AAAAAACTTT TGGAAATTTT TTGACAATTT TCATTACGAA ATTCGTTCAT TTGAGAACAT 360
TTTGGGTCTA TACGTTCAAA ATCGTCCAAA CCGTTAGTCA CCCTTTAAGG CTGTTTTAGC 420
CGAAGTCTAA AGGTTTTTTA ATTATTCAAA GCTTTCAAAA GTCAGGCATC TGTTGACGCC 480
TGCTTCTAGC TATGGATATT AGAAGAGTGG ATTTGCCCAT CTGTATGATA TTTGAGACAG 540
GCAGGGCCTC CCACTGCGGT GTTTAGCACA ACAGTTGACA CAAAGCCGAT TAGTCGCCAT 600
CTTTTGTCGT CGAAGAACTG TCTCCAGGGA AAACAGACG 639