EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-02025 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:12657729-12659288 
TF binding sites/motifs
Number: 87             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:12659165-12659175ACTCAATTTT-3.02
blmp-1MA0537.1chrIII:12658847-12658857AAAATGATAC+3.46
blmp-1MA0537.1chrIII:12658984-12658994GAGAAGAAAA+3.4
blmp-1MA0537.1chrIII:12659004-12659014AAATTGATAA+3.86
blmp-1MA0537.1chrIII:12658320-12658330GGGTGGAAAA+3
blmp-1MA0537.1chrIII:12659052-12659062TTTCTTTTTC-4.91
ceh-22MA0264.1chrIII:12658697-12658707TTTAATTGGT-3.02
ceh-22MA0264.1chrIII:12658754-12658764GCACTTGTGA+3.49
ceh-22MA0264.1chrIII:12657846-12657856GTCAAGTGGC-6.12
ceh-48MA0921.1chrIII:12659256-12659264CTCAATAT+3.03
ceh-48MA0921.1chrIII:12658700-12658708AATTGGTT-3.09
ceh-48MA0921.1chrIII:12658682-12658690ATCAATAG+3.12
ces-2MA0922.1chrIII:12658678-12658686TTATATCA+3.19
ces-2MA0922.1chrIII:12658139-12658147TTATGAAA+3.25
ces-2MA0922.1chrIII:12658140-12658148TATGAAAT-3.43
ces-2MA0922.1chrIII:12659212-12659220TATTTAAT-3.54
ces-2MA0922.1chrIII:12658185-12658193TAAAATAA+3
daf-12MA0538.1chrIII:12658562-12658576ACACACACATTCCG-3.13
daf-12MA0538.1chrIII:12658560-12658574TGACACACACATTC-3.43
daf-12MA0538.1chrIII:12659019-12659033AGATTGTGTGTGTG+3.4
daf-12MA0538.1chrIII:12659021-12659035ATTGTGTGTGTGTG+3.93
daf-12MA0538.1chrIII:12659031-12659045TGTGTGTGTGATTG+3.93
daf-12MA0538.1chrIII:12659023-12659037TGTGTGTGTGTGTG+4.9
daf-12MA0538.1chrIII:12659029-12659043TGTGTGTGTGTGAT+6.28
daf-12MA0538.1chrIII:12659025-12659039TGTGTGTGTGTGTG+8.26
daf-12MA0538.1chrIII:12659027-12659041TGTGTGTGTGTGTG+8.26
dsc-1MA0919.1chrIII:12658698-12658707TTAATTGGT+3.29
dsc-1MA0919.1chrIII:12658698-12658707TTAATTGGT-3.29
elt-3MA0542.1chrIII:12658210-12658217TTTAGCA+3.07
elt-3MA0542.1chrIII:12658679-12658686TATATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrIII:12659015-12659022AATAAGA-3.25
elt-3MA0542.1chrIII:12658852-12658859GATACGA-3.45
elt-3MA0542.1chrIII:12659009-12659016GATAATA-3.81
elt-3MA0542.1chrIII:12657932-12657939TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:12658243-12658250TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:12658366-12658373GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:12658449-12658456GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:12658610-12658617GTTATCA+4.15
eor-1MA0543.1chrIII:12659235-12659249TAGAGAAGGAGCTA+3.11
fkh-2MA0920.1chrIII:12659194-12659201TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:12658152-12658159TGTTTTC-3.08
fkh-2MA0920.1chrIII:12658193-12658200AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:12658991-12658998AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:12658522-12658529TATACAT+3.24
fkh-2MA0920.1chrIII:12658190-12658197TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:12658001-12658008TGTATAC-3.45
fkh-2MA0920.1chrIII:12659223-12659230TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrIII:12658659-12658666TAAACAT+4.05
hlh-1MA0545.1chrIII:12658871-12658881AGCAATTGGG+3.38
hlh-1MA0545.1chrIII:12658331-12658341CACAGCTGTT+4.01
hlh-1MA0545.1chrIII:12658332-12658342ACAGCTGTTT-4.4
lim-4MA0923.1chrIII:12657903-12657911GCAATTAT+3.01
lim-4MA0923.1chrIII:12658968-12658976TAATTGCA-3.01
lim-4MA0923.1chrIII:12658581-12658589TCAATTAT+3.03
lim-4MA0923.1chrIII:12658674-12658682TCAATTAT+3.03
lim-4MA0923.1chrIII:12658699-12658707TAATTGGT-3.99
lin-14MA0261.1chrIII:12658456-12658461TGTTC-3.14
mab-3MA0262.1chrIII:12657982-12657994AAACGCAAGATA-3.76
pal-1MA0924.1chrIII:12658614-12658621TCATAAC+3.09
pal-1MA0924.1chrIII:12658786-12658793TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrIII:12657794-12657801TTATGAC-3.4
pal-1MA0924.1chrIII:12658626-12658633TAATAAA+3.63
pal-1MA0924.1chrIII:12658182-12658189CAATAAA+4.12
pha-4MA0546.1chrIII:12658656-12658665CTGTAAACA+3.15
pha-4MA0546.1chrIII:12659050-12659059ATTTTCTTT-3.17
pha-4MA0546.1chrIII:12658680-12658689ATATCAATA+3.45
sma-4MA0925.1chrIII:12658156-12658166TTCAGACAAT-3.26
sma-4MA0925.1chrIII:12657782-12657792TCCAGAAAAA-3.46
sma-4MA0925.1chrIII:12658474-12658484TTTTCTGGCT+3.52
sma-4MA0925.1chrIII:12658493-12658503TTTTCTGGAT+3.52
sma-4MA0925.1chrIII:12658652-12658662ATGTCTGTAA+3.7
unc-62MA0918.1chrIII:12657842-12657853ACTTGTCAAGT+3.82
unc-62MA0918.1chrIII:12658436-12658447AGTGACATGTA-4.26
unc-62MA0918.1chrIII:12658823-12658834TTTGACAGCTA-4.28
unc-62MA0918.1chrIII:12658669-12658680AGCTGTCAATT+4.69
unc-62MA0918.1chrIII:12658576-12658587AGCTGTCAATT+5.34
vab-7MA0927.1chrIII:12658923-12658930CAATGAG-3.09
vab-7MA0927.1chrIII:12658582-12658589CAATTAT-3.15
vab-7MA0927.1chrIII:12658675-12658682CAATTAT-3.15
vab-7MA0927.1chrIII:12658507-12658514TCATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrIII:12658136-12658143TCATTAT-3.35
vab-7MA0927.1chrIII:12658699-12658706TAATTGG-3.7
zfh-2MA0928.1chrIII:12659214-12659224TTTAATTTTT+3.01
zfh-2MA0928.1chrIII:12658342-12658352GGAATTAGTT-3.05
zfh-2MA0928.1chrIII:12658697-12658707TTTAATTGGT+3.39
zfh-2MA0928.1chrIII:12658075-12658085ACTAATTTTA+3
zfh-2MA0928.1chrIII:12657817-12657827AAAATTAGTT-3
Enhancer Sequence
AAAAAAAAAT TTCTTAAAAC ACCGAATTTC ACAATGAAAC TTCTTGTAAA CTTTCCAGAA 60
AAAAGTTATG ACGACTTGAA AATGGCCTAA AATTAGTTAA AATTTCAAAT TTGACTTGTC 120
AAGTGGCTGG AAACAATTCG TTTTGAAATC ACCGTCAAAT TTTGAATATA CTATGCAATT 180
ATCTTTGGTT TTCAACTCGA ATTTTTTTCA AATCTCGTCG TCCTTTGACT TTAAAATACC 240
TTAATCGAGT TGAAAACGCA AGATAATCAA ATTGTATACG CAAATTTGAA GGCGGATTTC 300
AAAAAAGTTA GTTTCCAGCC GCAAGACGGT CAAATTTCAA ATTTTAACTA ATTTTAGGTC 360
ATTTTTTGAG TCGACATAAC TTTTGTTTGA GAAGTTTTAA AGAAGTTTCA TTATGAAATT 420
CGGTGTTTTC AGACAATTTC GAGCCTAATA AAGCAATAAA ATAAAAAACA ACTACAAACA 480
TTTTAGCAGT CGAACTGAAC TTTTTCAGTG CATTTTTTTC ACTGGGCTTG TAAAATTGCT 540
CCAAATATAG TTTTTGTGCA GAATTTTTGA TAATCCCTAT AGACCTATAG GGGGTGGAAA 600
AACACAGCTG TTTGGAATTA GTTAAAGAAA AGCATTTGAA AAAATTAAAA AAAAAAATTT 660
CCAGAGTGTA AATCCACGTT TGGAGAAATT TTATGAGCAT CCGAAGTAGT GACATGTAGT 720
GAAAAAATGT TCAGTGTGAC CGCTATTTTC TGGCTCAAAC ACGGTTTTCT GGATTCCCTC 780
ATGAAAAATA CAGTATACAT GCTTTCCATG AAACATTGAG CTTGATCTTT GTGACACACA 840
CATTCCGAGC TGTCAATTAT GATGGCTCCT TCCGTCCCCG TGTTATCATA ACCCATATAA 900
TAAACTTATC TACCTATATA TATATGTCTG TAAACATGGT AGCTGTCAAT TATATCAATA 960
GAATGTAGTT TAATTGGTTT TCCAACGACG ACAAAAACTT TAAAACTATG CTTAAAATGT 1020
GACACGCACT TGTGATACCG TATGAAATCT GACACATTTA TGATTCCCAA AACCTGAAAA 1080
CCTACAGAAA AAAGTTTGAC AGCTAGCAGC TATTCAGGAA AATGATACGA GCCCCCAGTG 1140
CCAGCAATTG GGGGTTACTG TACTCCCAGG AAAAACACAA ACTTTTTTAG GGATCAATGA 1200
GCATATTAAA TTGGGTTAAA GCACCAATGA TTATCAGAAT AATTGCAGAG TACGGGAGAA 1260
GAAAAACAAA ATACAAAATT GATAATAATA AGATTGTGTG TGTGTGTGTG TGATTGACAT 1320
TATTTTCTTT TTCGAATGAA AATGTGTAGA TTTTAAAACG CTCAAAATAT TTAAATATAT 1380
TTTTGATCGA ATTCTTGAAT TTTCTATGAG ATTTATACCT GCTCGGGAAT CAAAAGACTC 1440
AATTTTTAGG ACTTTTTAAA AAAAATGTTT TCAAATATTT AGTTATTTAA TTTTTTTTTA 1500
CTATCATAGA GAAGGAGCTA TATTATACTC AATATGGGCA AAAAAACATT TTCTAAATT 1559