EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-02006 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:12493308-12493627 
TF binding sites/motifs
Number: 35             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:12493368-12493378CATCGATTTT-3.18
blmp-1MA0537.1chrIII:12493467-12493477AAAATGAAAA+5.14
ceh-48MA0921.1chrIII:12493368-12493376CATCGATT-3.07
ces-2MA0922.1chrIII:12493346-12493354TATTTTAT-3
daf-12MA0538.1chrIII:12493535-12493549TAAGCGTGTTTTTT+3.73
daf-12MA0538.1chrIII:12493446-12493460AAAAACACGCTTAC-3.73
daf-12MA0538.1chrIII:12493318-12493332AGCGCGCTTGCACG+4.86
dsc-1MA0919.1chrIII:12493504-12493513TTAATTAAT+4.05
dsc-1MA0919.1chrIII:12493504-12493513TTAATTAAT-4.05
dsc-1MA0919.1chrIII:12493508-12493517TTAATTAAT+4.29
dsc-1MA0919.1chrIII:12493508-12493517TTAATTAAT-4.29
eor-1MA0543.1chrIII:12493409-12493423TAGAGAAAAAGTCA+3.37
fkh-2MA0920.1chrIII:12493606-12493613AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:12493381-12493388TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:12493342-12493349TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:12493465-12493472TAAAAAT+3.19
lim-4MA0923.1chrIII:12493426-12493434TAATTGCA-3.01
lim-4MA0923.1chrIII:12493508-12493516TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrIII:12493505-12493513TAATTAAT-3.75
lim-4MA0923.1chrIII:12493509-12493517TAATTAAT-3.75
lim-4MA0923.1chrIII:12493504-12493512TTAATTAA+3.79
pal-1MA0924.1chrIII:12493513-12493520TAATTTC-3.07
pha-4MA0546.1chrIII:12493586-12493595ATTCAAACA+3.03
pha-4MA0546.1chrIII:12493343-12493352ATTTATTTT-3.76
vab-7MA0927.1chrIII:12493505-12493512TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrIII:12493509-12493516TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrIII:12493505-12493512TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrIII:12493509-12493516TAATTAA-3.22
zfh-2MA0928.1chrIII:12493563-12493573ATTAATTTTG+3.19
zfh-2MA0928.1chrIII:12493511-12493521ATTAATTTCA+3.2
zfh-2MA0928.1chrIII:12493560-12493570TGAATTAATT-3.31
zfh-2MA0928.1chrIII:12493503-12493513CTTAATTAAT+4.22
zfh-2MA0928.1chrIII:12493507-12493517ATTAATTAAT+4.38
zfh-2MA0928.1chrIII:12493508-12493518TTAATTAATT-4.38
zfh-2MA0928.1chrIII:12493504-12493514TTAATTAATT-4.5
Enhancer Sequence
TGTTCGATGG AGCGCGCTTG CACGATTTTA AATTTATTTA TTTTATTTTT TGTTATTTTC 60
CATCGATTTT TAATGTTTTC GGTGTATTTT TGCTTGAATT TTAGAGAAAA AGTCAAAATA 120
ATTGCAAATT TTCGATTAAA AAACACGCTT ACAGGCGTAA AAATGAAAAA GTGACGCTTT 180
TAAACGATTT CGGACCTTAA TTAATTAATT TCACTGATTT ACGCCTGTAA GCGTGTTTTT 240
TAATCGAAAA TTTGAATTAA TTTTGACTTT CCTCTAAAAT TCAAACAAAA ATACACCGAA 300
AACATTAAAA ATCGGTGGG 319