EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01888 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:10955345-10957880 
TF binding sites/motifs
Number: 117             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:10956486-10956496AGAAGGATAT+3.04
blmp-1MA0537.1chrIII:10957210-10957220GGAATGAGAT+3.12
blmp-1MA0537.1chrIII:10955935-10955945GAAATGAGGG+3.45
blmp-1MA0537.1chrIII:10957255-10957265AGGTTGAAAA+3.45
blmp-1MA0537.1chrIII:10957136-10957146AAGGAGAGAC+3.5
blmp-1MA0537.1chrIII:10957190-10957200CTTCTTTCTT-3.63
blmp-1MA0537.1chrIII:10955496-10955506AAATTGAAAT+3.85
blmp-1MA0537.1chrIII:10955665-10955675AGGGTGAAAA+3.8
blmp-1MA0537.1chrIII:10957018-10957028GAAAAGAAAA+4.09
blmp-1MA0537.1chrIII:10956362-10956372AAAACGAAAA+4.55
blmp-1MA0537.1chrIII:10957804-10957814TCTCACTCTC-4.58
blmp-1MA0537.1chrIII:10957695-10957705AGAGAGAAAA+4.62
blmp-1MA0537.1chrIII:10955655-10955665AAATAGAAAA+4.67
ceh-22MA0264.1chrIII:10957771-10957781TTCGAGTAGG-3.81
ceh-22MA0264.1chrIII:10957424-10957434CTCAAGTGGG-4.8
ceh-48MA0921.1chrIII:10956405-10956413TTCAATAA+3.49
ceh-48MA0921.1chrIII:10955571-10955579TTCGATAG+3.54
ces-2MA0922.1chrIII:10956398-10956406GGCGTAAT-3.07
ces-2MA0922.1chrIII:10955834-10955842TTATATTA+3.12
che-1MA0260.1chrIII:10955892-10955897AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrIII:10957083-10957088AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrIII:10956926-10956931AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrIII:10957577-10957582AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrIII:10956741-10956746GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrIII:10955644-10955649AAGCC+3.7
che-1MA0260.1chrIII:10956541-10956546GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrIII:10956286-10956300CAACACACAAGTCC-3.05
daf-12MA0538.1chrIII:10956695-10956709TCTGCGTGTGTTCT+3.11
daf-12MA0538.1chrIII:10956267-10956281TAAAAACCACACAC-3.51
daf-12MA0538.1chrIII:10956697-10956711TGCGTGTGTTCTCC+3.84
efl-1MA0541.1chrIII:10955541-10955555ATTTTCCGTCATAA-3.14
efl-1MA0541.1chrIII:10956251-10956265TTAAGCGGAAATTT+3.27
efl-1MA0541.1chrIII:10956705-10956719TTCTCCCGCATTTT-3.28
efl-1MA0541.1chrIII:10955952-10955966TATAGCGGAAAAAA+3.33
efl-1MA0541.1chrIII:10956635-10956649TTTTCGCCCGAAAA-3.33
efl-1MA0541.1chrIII:10956806-10956820CTTTCGCGGCCACC-3.56
efl-1MA0541.1chrIII:10956741-10956755GTTTCGCGCCGCAC-3.78
efl-1MA0541.1chrIII:10956624-10956638AAATGCGGGAATTT+3.95
efl-1MA0541.1chrIII:10957394-10957408CCGGGCGGGGAATT+4.26
elt-3MA0542.1chrIII:10956874-10956881TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrIII:10955379-10955386TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrIII:10957073-10957080GTTATCA+3.2
elt-3MA0542.1chrIII:10957013-10957020GAAAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrIII:10957802-10957809CTTCTCA+3.35
elt-3MA0542.1chrIII:10957557-10957564TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:10955530-10955537GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:10957716-10957723GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:10956265-10956272GATAAAA-4.31
eor-1MA0543.1chrIII:10956025-10956039GAAATAGGCAAAAA+3.23
eor-1MA0543.1chrIII:10957690-10957704AGCAGAGAGAGAAA+3.29
eor-1MA0543.1chrIII:10956948-10956962TAGAGAACAAAAAA+3.43
eor-1MA0543.1chrIII:10957698-10957712GAGAAAAAAAAACG+3.44
eor-1MA0543.1chrIII:10957011-10957025GTGAAAAGAAAAGA+3.5
eor-1MA0543.1chrIII:10957016-10957030AAGAAAAGAAAAAA+3.75
eor-1MA0543.1chrIII:10957803-10957817TTCTCACTCTCCAC-3.92
eor-1MA0543.1chrIII:10957692-10957706CAGAGAGAGAAAAA+4.45
eor-1MA0543.1chrIII:10957696-10957710GAGAGAAAAAAAAA+4.46
eor-1MA0543.1chrIII:10957694-10957708GAGAGAGAAAAAAA+4.6
fkh-2MA0920.1chrIII:10955611-10955618AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:10957789-10957796AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:10957299-10957306TCTACAA+3.02
fkh-2MA0920.1chrIII:10955652-10955659TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:10955526-10955533TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:10957566-10957573TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:10956961-10956968AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:10957613-10957620AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:10956267-10956274TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrIII:10956414-10956421TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:10957310-10957317TAAAAAC+3.26
fkh-2MA0920.1chrIII:10956830-10956837TCAACAT+3.51
hlh-1MA0545.1chrIII:10956963-10956973AACAAGTGAG+3.13
hlh-1MA0545.1chrIII:10957042-10957052GCAGATGGTG-3.21
hlh-1MA0545.1chrIII:10957041-10957051GGCAGATGGT+3.24
hlh-1MA0545.1chrIII:10957385-10957395CACAGGTGCC+3.44
hlh-1MA0545.1chrIII:10957836-10957846ATCAGTTGGT+3.4
hlh-1MA0545.1chrIII:10956099-10956109GGCAGATGTC+3.54
hlh-1MA0545.1chrIII:10957837-10957847TCAGTTGGTG-3.62
hlh-1MA0545.1chrIII:10956330-10956340GCAGCTGATG-3.7
hlh-1MA0545.1chrIII:10955360-10955370AACAAATGAC+3.97
hlh-1MA0545.1chrIII:10956329-10956339AGCAGCTGAT+4.76
lim-4MA0923.1chrIII:10957060-10957068TAATGAGA-3.25
lin-14MA0261.1chrIII:10955512-10955517TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrIII:10957754-10957759TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrIII:10955716-10955721AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrIII:10956477-10956482TGTTC-3.62
lin-14MA0261.1chrIII:10956703-10956708TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrIII:10955593-10955605ATTTGAAACATG-3.44
mab-3MA0262.1chrIII:10955967-10955979TTAGGCAACTTT-3.63
mab-3MA0262.1chrIII:10955354-10955366CATCGCAACAAA-4.52
mab-3MA0262.1chrIII:10955401-10955413ATGTTGCAAATT+6.17
pal-1MA0924.1chrIII:10957569-10957576TTATGGT-3.21
pal-1MA0924.1chrIII:10955549-10955556TCATAAA+3.79
pal-1MA0924.1chrIII:10956355-10956362TAACAAA+3
pha-4MA0546.1chrIII:10957307-10957316AAGTAAAAA+3.25
pha-4MA0546.1chrIII:10956067-10956076GGGCAAACA+3.82
skn-1MA0547.1chrIII:10955663-10955677AAAGGGTGAAAAGT+3.73
skn-1MA0547.1chrIII:10955386-10955400ATTTGAAGAAAAAA+3.81
skn-1MA0547.1chrIII:10957253-10957267AAAGGTTGAAAAAC+4.11
sma-4MA0925.1chrIII:10957737-10957747TCTAGACGCA-3.23
sma-4MA0925.1chrIII:10957441-10957451ATGTCTATGA+3.28
sma-4MA0925.1chrIII:10957734-10957744AAGTCTAGAC+3.2
sma-4MA0925.1chrIII:10956561-10956571GCCAGACGCC-3.55
sma-4MA0925.1chrIII:10956898-10956908TCTAGACAAA-3.87
sma-4MA0925.1chrIII:10956320-10956330ACCAGACAGA-4.41
unc-62MA0918.1chrIII:10957868-10957879AGTGACAAATA-3.07
unc-62MA0918.1chrIII:10957226-10957237CGTGACAGGGG-3.83
unc-62MA0918.1chrIII:10955534-10955545AAATGTCATTT+3.85
unc-62MA0918.1chrIII:10957792-10957803ACATGTCAATC+3.97
unc-62MA0918.1chrIII:10956102-10956113AGATGTCAAGT+3.99
unc-62MA0918.1chrIII:10957815-10957826ACATGTCACCC+4.25
unc-86MA0926.1chrIII:10957149-10957156TAGTAAT+3.04
unc-86MA0926.1chrIII:10956726-10956733TCTGCAT+3.18
unc-86MA0926.1chrIII:10955837-10955844TATTAAT+3.47
unc-86MA0926.1chrIII:10955700-10955707TGAATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrIII:10957352-10957359TAGGCAT+4.1
vab-7MA0927.1chrIII:10955704-10955711TAATTGA+3.15
vab-7MA0927.1chrIII:10957060-10957067TAATGAG-3.88
Enhancer Sequence
CGTAAAATTC ATCGCAACAA ATGACCAAAA CAATTTTAAC AATTTGAAGA AAAAAAATGT 60
TGCAAATTTT TTTTTGTGAA ATTCTCCAAT TTTTTGGTTG AACTTCACTG ATTTTTCTGA 120
AAAACTGAAG AAAAAAGTGG GGAAAATCTG AAAATTGAAA TTTCAGCTGT TCGATTTTTT 180
TTGTTGAAAA AATGTCATTT TCCGTCATAA AATCTTGACG TTGATATTCG ATAGTTCTGC 240
TATTTGAAAT TTGAAACATG GCACTGAAAA CATTTTTTTC TTTAAATTTG CAGGCCCGGA 300
AGCCCCATAA AAATAGAAAA AGGGTGAAAA GTCTAAAGTT AGAATATTAA AACAATGAAT 360
AATTGATGGT GAACACCCCC TGAAGCTCTC TCTGAGCAGA CTCATAGAGT TTCAGTCTTT 420
AAAAATATGA CGTGAGCCAG GGAGCCGACG GATATTAAAA GGATAAGCTG GGCTCTCTCA 480
GAAGAAAAAT TATATTAATC ACAAAAGAAG GACGGATGGC ACCTACGTAA GTAAATCAGA 540
ACGGGAGAAA CGTCATTTTG AAAAATTTTG AATTTAAATA AAACCAGCTG GAAATGAGGG 600
GAAAATCTAT AGCGGAAAAA ACTTAGGCAA CTTTGAAGAA TCAGGAAAGA TTCGGGGAGC 660
TCCGAAGCAA AATTGGGCAA GAAATAGGCA AAAACGGGCA AAGTTGGGTG ATTTTGAAAA 720
TCGGGCAAAC ATTGGGCAAA GTTGGGCAAA TCCAGGCAGA TGTCAAGTAA CAGAATAGAT 780
GCGGGTAGTT CCAAATCAAA ATGGGCAAAA AATACAAAAT TGGGCAAAAC GGGCAAAAAA 840
TGGACAAATT TTCAGAAATT CATCCCCTAT ATCTCCCAAC CTTTAAAAAC TATTTCCGAT 900
TGAGTTTTAA GCGGAAATTT GATAAAAACC ACACACCAGT CCAACACACA AGTCCTGAAT 960
ACCCGCACAA ATTGGACCAG ACAGAGCAGC TGATGAGTTG TTGTAAGAAG TAACAAAAAA 1020
ACGAAAAACG AACAAAAAGT GAGCAGGAAC AATGGCGTAA TTCAATAATT GTTTTCGGTT 1080
TTCCTTACCC CGGAAATTCT TGGAATTTGT CAGGTGGGTG GGGTGGGAGC GGTGTTCAAA 1140
GAGAAGGATA TTGGAGGAAA AATAACAGAT TTTTTGCAGA AAATCGGTAG GCCTAGGCTT 1200
CCATGGGAGG TAGGACGCCA GACGCCTGCC TCCAACCTCA CGTGGTGCCA GGCTGTCCCA 1260
TTACGGTTTG ATCTACAAAA AATGCGGGAA TTTTCGCCCG AAAAAATGTG ACGTCAGCAC 1320
GTTCTTAACC ATGCAAAATC AGTTTAAAAC TCTGCGTGTG TTCTCCCGCA TTTTTTGTAG 1380
ATCTGCATTT TTTAGGGTTT CGCGCCGCAC TATACAGGAG GTGAGCCTTG CGGTGCGAGG 1440
CAGGCGGAGG TCGCCGCAAG ACTTTCGCGG CCACCTACCG AGAGATCAAC ATTGAAAAGT 1500
TCAAAAAACG TTCTTGTTTC TTTGGTTTTT TTCTCAATTT ATAAAAAGTT TGATCTAGAC 1560
AAATTCCATT TTTTCCGTGG GAAACCTACG CAATACAAGA CTATAGAGAA CAAAAAAAAA 1620
CAAGTGAGAA CGTTATTTTT AGTAATATAT GAGCCCCGGG AAACAGGTGA AAAGAAAAGA 1680
AAAAATTGGC AAAGTAGGCA GATGGTGATG TATTTTAATG AGATATCAGT TATCAGTGAA 1740
GCGAAGATTT TTCACGAATC ACCGAGCTTC GGACGGTGTT TTTCGATGCA AAAGGAGAGA 1800
CCTATAGTAA TAGTCACATG TGGTGGGTTA CTATTCTTGA AAGTTCTTCT TTCTTCGTGA 1860
CGTCAGGAAT GAGATCAGGA GCGTGACAGG GGCTGAAACT AGATTCAAAA AGGTTGAAAA 1920
ACTGGTTAAA AACTTGTTTC CAAGGGCACC ACAGTCTACA AAAAGTAAAA ACCATCCCCG 1980
GGAATCGAAC CCTGGTCTTA TGTGTCATAG GCATCCATCT ACCCAGTTAA ACCACTTGGA 2040
CACAGGTGCC CGGGCGGGGA ATTGCGGTGC CCCCGGTAGC TCAAGTGGGT AGAGGAATGT 2100
CTATGACGCA CACGACCGGG GTTCGATTCC CACAGTGGAC ATTTAGTTTT TGCTGGCTCA 2160
GATTGCTCAG ATGAAACTGG TTTTAAGCTG AAAAATATTT AAAACGATTT TTTTTTTCAA 2220
ATTTTTATGG TGAAACCTTT AGTAACAGGA TTTTTTTCGA AACTATCAAA AACAAGAAAG 2280
TGTGGCATAG AGGACTTCCA GTCGAGTTAC CACTAAAATC CACGTCATTC CACACCTAAA 2340
AACGGAGCAG AGAGAGAAAA AAAAACGTCA TGAAAAAAAC CAGAGCTGAA AGTCTAGACG 2400
CATTATTTCT GTTCCAGCGA GTGGTTTTCG AGTAGGACAC CCCGAAAACA TGTCAATCTT 2460
CTCACTCTCC ACATGTCACC CCGTAAATCA CATCAGTTGG TGAAGGAGGA TTGATGACCA 2520
CCGAGTGACA AATAG 2535