EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01863 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:10544444-10547116 
TF binding sites/motifs
Number: 117             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:10546597-10546607AAAAGGAATC+3.05
blmp-1MA0537.1chrIII:10546737-10546747TGAGCGAAAA+3.07
blmp-1MA0537.1chrIII:10545061-10545071ACTCTTTCTC-3.15
blmp-1MA0537.1chrIII:10546479-10546489GAAGAGATGG+3.25
blmp-1MA0537.1chrIII:10546786-10546796AGAGCGAAAT+3.57
blmp-1MA0537.1chrIII:10545716-10545726AAAGAGAGTA+3.65
blmp-1MA0537.1chrIII:10546076-10546086TTTCCTTTTT-3.82
blmp-1MA0537.1chrIII:10546096-10546106AAATAGAGAG+4.51
blmp-1MA0537.1chrIII:10545714-10545724AAAAAGAGAG+4.76
blmp-1MA0537.1chrIII:10547048-10547058AAAATGAAAA+5.14
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:10546598-10546611AAAGGAATCTAAT-4.5
ceh-22MA0264.1chrIII:10545178-10545188GTTAAGTGGA-3.77
ceh-22MA0264.1chrIII:10544518-10544528GCCCTTAAAA+3
ceh-48MA0921.1chrIII:10547069-10547077TATTGATG-3.03
ces-2MA0922.1chrIII:10546866-10546874TGTGTGAT-3.06
ces-2MA0922.1chrIII:10544478-10544486TTCCGCAA+3.07
ces-2MA0922.1chrIII:10545238-10545246TTATGTAG+3.39
ces-2MA0922.1chrIII:10544805-10544813TATATAAT-3.3
ces-2MA0922.1chrIII:10546170-10546178GACGTAAT-3.59
ces-2MA0922.1chrIII:10545324-10545332TAAAATAA+3
che-1MA0260.1chrIII:10545707-10545712AAGCC+3.7
che-1MA0260.1chrIII:10544672-10544677GCTTC-3.7
che-1MA0260.1chrIII:10545632-10545637GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrIII:10544950-10544964TAACAAACAAATTC-3.03
daf-12MA0538.1chrIII:10545311-10545325AAGCACTCAGACAT-3.11
daf-12MA0538.1chrIII:10544975-10544989TGAGAGTTTGGTGG+3.12
daf-12MA0538.1chrIII:10546021-10546035TAGCATACACACAC-3.54
daf-12MA0538.1chrIII:10544843-10544857GAGAAAACACATTC-3.72
daf-12MA0538.1chrIII:10544971-10544985GGTGTGAGAGTTTG+3.8
daf-12MA0538.1chrIII:10546004-10546018CTCCACACACACTA-3.96
dsc-1MA0919.1chrIII:10546616-10546625TTAATTGAC+3.46
dsc-1MA0919.1chrIII:10546616-10546625TTAATTGAC-3.46
dsc-1MA0919.1chrIII:10545759-10545768GTAATTAGG+3.95
dsc-1MA0919.1chrIII:10545759-10545768GTAATTAGG-3.95
efl-1MA0541.1chrIII:10547035-10547049TATTGCCGGCTGAA-3.18
efl-1MA0541.1chrIII:10546281-10546295CATTCGCGGCCACA-3.21
efl-1MA0541.1chrIII:10546282-10546296ATTCGCGGCCACAT+3.49
elt-3MA0542.1chrIII:10546091-10546098GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrIII:10544642-10544649GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrIII:10545821-10545828GTTAAGA-3.58
elt-3MA0542.1chrIII:10546310-10546317GATAAGT-3.75
elt-3MA0542.1chrIII:10546383-10546390GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrIII:10546204-10546218CAGAGTCGTAGAAG+3.42
eor-1MA0543.1chrIII:10546093-10546107GAAAAATAGAGAGG+3.65
eor-1MA0543.1chrIII:10546091-10546105GAGAAAAATAGAGA+4.37
eor-1MA0543.1chrIII:10545066-10545080TTCTCCGTCACTTC-5.21
fkh-2MA0920.1chrIII:10545276-10545283TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:10546062-10546069TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:10544846-10544853AAAACAC+3.08
fkh-2MA0920.1chrIII:10545148-10545155TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:10545167-10545174TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:10545574-10545581TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrIII:10546798-10546805TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrIII:10545731-10545738AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:10545432-10545439TAAAAAC+3.26
fkh-2MA0920.1chrIII:10546337-10546344TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:10546779-10546786TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:10545306-10545313TAAAAAA+3.4
fkh-2MA0920.1chrIII:10545288-10545295TAAACAG+3.71
fkh-2MA0920.1chrIII:10546845-10546852TAAACAA+4.31
hlh-1MA0545.1chrIII:10544493-10544503TCAGCTGCGG-4.22
lim-4MA0923.1chrIII:10545876-10545884TAATGGGG-3.12
lim-4MA0923.1chrIII:10544809-10544817TAATTGCT-3.15
lim-4MA0923.1chrIII:10545760-10545768TAATTAGG-3.34
lim-4MA0923.1chrIII:10546617-10546625TAATTGAC-3.65
lim-4MA0923.1chrIII:10545759-10545767GTAATTAG+4.08
lin-14MA0261.1chrIII:10546058-10546063AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrIII:10544504-10544509CGTTC-3.36
mab-3MA0262.1chrIII:10546533-10546545TTTTCCAACATA-3.55
mab-3MA0262.1chrIII:10544934-10544946GTTTGCAACATG-4.4
pal-1MA0924.1chrIII:10544828-10544835TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrIII:10546842-10546849CAATAAA+3.46
pal-1MA0924.1chrIII:10545496-10545503CCATAAA+3.51
pal-1MA0924.1chrIII:10546795-10546802TAATAAA+3.63
pal-1MA0924.1chrIII:10545887-10545894TAATAAC+3.92
pha-4MA0546.1chrIII:10545542-10545551ATTCAAACA+3.03
pha-4MA0546.1chrIII:10545501-10545510AAGTAGACA+3.2
pha-4MA0546.1chrIII:10547105-10547114GTTTGTACA-3.71
pha-4MA0546.1chrIII:10545842-10545851GAGCATATA+3
skn-1MA0547.1chrIII:10545110-10545124CATTGATGACATTT+4.1
sma-4MA0925.1chrIII:10544449-10544459TGGTCTAGAA+3.02
sma-4MA0925.1chrIII:10545222-10545232ATCAGACATA-3.07
sma-4MA0925.1chrIII:10546463-10546473CCTAGAAATC-3.13
sma-4MA0925.1chrIII:10544720-10544730CCTAGAAAAA-3.17
sma-4MA0925.1chrIII:10545858-10545868ATGTCTATCA+3.21
sma-4MA0925.1chrIII:10546270-10546280CCTAGAAAAT-3.27
sma-4MA0925.1chrIII:10545316-10545326CTCAGACATA-3.2
sma-4MA0925.1chrIII:10546228-10546238ATTTCTAGGC+3.37
sma-4MA0925.1chrIII:10544452-10544462TCTAGAAATT-3.42
sma-4MA0925.1chrIII:10546348-10546358TTGTCTAGAA+3.87
sma-4MA0925.1chrIII:10547078-10547088CCTAGACACC-4.12
unc-62MA0918.1chrIII:10546493-10546504AGCTGTCCAAT+3.08
unc-62MA0918.1chrIII:10546577-10546588AGTTGTCTCCT+3.15
unc-62MA0918.1chrIII:10546959-10546970AGTTGTCTCCG+3.17
unc-62MA0918.1chrIII:10545114-10545125GATGACATTTT-3.51
unc-62MA0918.1chrIII:10546645-10546656AGCTGTCTTCA+3.73
unc-62MA0918.1chrIII:10545422-10545433GGTGACAGCGT-3.86
unc-62MA0918.1chrIII:10546619-10546630ATTGACAGTTC-4.35
unc-86MA0926.1chrIII:10545257-10545264GGCATAT-3.18
unc-86MA0926.1chrIII:10545795-10545802TGCATAT-3.18
unc-86MA0926.1chrIII:10546993-10547000TATTAAT+3.35
unc-86MA0926.1chrIII:10546331-10546338TATTCAT+3.58
unc-86MA0926.1chrIII:10546333-10546340TTCATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrIII:10545345-10545352TAGGCAT+3.83
unc-86MA0926.1chrIII:10545568-10545575TAGGCAT+3.83
unc-86MA0926.1chrIII:10545282-10545289TAGGCAT+4.1
vab-7MA0927.1chrIII:10545760-10545767TAATTAG+3.02
vab-7MA0927.1chrIII:10546500-10546507CAATGAA+3.08
vab-7MA0927.1chrIII:10544833-10544840TCATTGG-3.08
vab-7MA0927.1chrIII:10545109-10545116TCATTGA+3.09
vab-7MA0927.1chrIII:10546812-10546819TAATTGA+3.15
vab-7MA0927.1chrIII:10545760-10545767TAATTAG-4.31
zfh-2MA0928.1chrIII:10544857-10544867AAAATTAGTG-3.01
zfh-2MA0928.1chrIII:10544826-10544836TTTAATTTCA+3.02
zfh-2MA0928.1chrIII:10546615-10546625ATTAATTGAC+3.26
zfh-2MA0928.1chrIII:10545759-10545769GTAATTAGGA-3.62
zfh-2MA0928.1chrIII:10545758-10545768AGTAATTAGG+4.03
Enhancer Sequence
TTTCATGGTC TAGAAATTTG AAAACTTTTG GGGATTCCGC AACTAGTAGT CAGCTGCGGG 60
CGTTCGTGCC TAGAGCCCTT AAAACTCTTC CATCTGGTTT AGGCTTTGGT TTAGGCTTAG 120
GCTCACGCTT AGGCTTAGGC TTACGCTTAG ACCTACGCTT AGACTTAGGC TAGGGCTTAG 180
GCTTGGGCTT ATGCTTTTGT TAAAACTGAA ACTCAGGTTT ACGCTGCGGC TTCGGCTTAG 240
GCTTAGGCAA AACCTCTTCC AGCATTAAGA GCGTGGCCTA GAAAAAATAC AATTCTAAAC 300
CACATGCCTG GGAAGATGCA CTGCACTTTT TCTTTCTGTT TTAGCCATCA AACGGAAGCT 360
ATATATAATT GCTCCGGTAC CCTTTAATTT CATTGGGCGG AGAAAACACA TTCAAAATTA 420
GTGCGAACCT CGTAAAACGG GGTACTGTAA GTGATCCCCC CGCAAAAAAA ACCAAACTAC 480
AATAGGGCAC GTTTGCAACA TGAAACTAAC AAACAAATTC TTGGAGGGGT GTGAGAGTTT 540
GGTGGTTGGG AGGGCTCCGA TTTCAAGATC ACACCGATCT TCGCACTGAT AGGCCGACCA 600
TGAATGGAGG AGACTCCACT CTTTCTCCGT CACTTCCTGT GAATGAGCTC ACGGAGGGGA 660
TGAGCTCATT GATGACATTT TGAAGGGAAA AGTTCATAGC TTCTTGTTTT TTTTTTTTGG 720
ATTTGTTTTT AAAAGTTAAG TGGAGATCAA AAAGGTGTGC CTATTTGGTG CCTAAATCAT 780
CAGACATAAG GTGATTATGT AGGCAAGCGA CTAGGCATAT AGTATATACT TATAAAAATA 840
GGCATAAACA GAGGTATGTG CGTAAAAAAG CACTCAGACA TAAAATAAGC GTGTAGGGAG 900
GTAGGCATAA TGTAGATACA GGGGCAAGAA AGCATAATAG GCGAGGGATA GGGTTGGAAG 960
GCGGGCAGGT AAATGTGAGG TGACAGCGTA AAAACACTGT CCGACATGAG AATTTAGGCA 1020
GGTAGGTATA AAGTAGGGTC ATAGGCGGAG AGCCATAAAG TAGACAGGCA CATAGAGGCA 1080
AACTATAAAA TTAGGGAAAT TCAAACAATT CGCACGTAGG CAGGTAGGCA TAAAAACGTA 1140
CCTACCCGTC AAATAACTTT CAAAAGATGT ATCTTCTCTA TAATTTAGGC TTCCTGGGCG 1200
GGTCTCTGGA CTTCTCGGAA AAAAGTTTTG CTTAACTATT TTGCAGACTT TCAAGTTTCC 1260
AGGAAGCCAA AAAAAGAGAG TATCATGAAA ACAAAAAGTG TATGACGTGG ACTGAGTAAT 1320
TAGGAGGGTG CACGGGTGAA AAGTCGGGTG GTGCATATAA ATTACACCCC GAAAATTGTT 1380
AAGATGCTCA ATGGAGCAGA GCATATAGGT GCTGATGTCT ATCACTGATT TCTAATGGGG 1440
GCGTAATAAC TGAGTAGGGG GGAGGGGGGG TCCTGCCCGT GGGGCATGAC TTTTCAACGG 1500
ATTTCGGAGG AGGGTGGAGG ATAATCTGGT CAACTAAATT TGTGTATGGT GGTGGACCTG 1560
CTCCACACAC ACTAAAATAG CATACACACA CGGAAGTGTG CTGGTTAAAA TTAGAACATA 1620
AAAATGCAGG AATTTCCTTT TTTTTTTGAG AAAAATAGAG AGGAATTTTG CTTCAGTGAG 1680
TCTGAAATTT GACATTATTT TTTTGCTAGG TGGTCAGGAA AACAGTGACG TAATAGGTGG 1740
CCTAGAACTT CATGGCGTGG CAGAGTCGTA GAAGGTTGTT GGAAATTTCT AGGCCACGTG 1800
TGGCGTCCTA CTTCTTTAGA CGGTGGCCTA GAAAATTCAT TCGCGGCCAC ATAAGCTAGA 1860
GTTGGTGATA AGTATACCTT CCCCACTTAT TCATAAAAAA AAATTTGTCT AGAACTTCTA 1920
GGGTTCTACG ATCCAGCTTG AAAAAAACCG CACATGACTT AGAATCCCGA AAATCCTGTC 1980
TAAAAAAAGT GACGTCATAC TCGACCTAAA AACTGGTGAC CTAGAAATCT CCGTAGAAGA 2040
GATGGTATAA GCTGTCCAAT GAAAGGTTTT GGTGCAAAAT ATTTCCAAAT TTTCCAACAT 2100
AAATTTTCAA AAAAAAAAAC TAGTGAAAAC TCAAGTTGTC TCCTACTACC GAGAAAAGGA 2160
ATCTAATCTG GATTAATTGA CAGTTCCCCC AAAAACCTCT AAGCTGTCTT CACATTTTTC 2220
TCTGAATTCC GAACTTCCCC TCCGCTGTGA CGTGGATCGC TTTATTCTGA TCTCTTTGCT 2280
CCAAAAGAAA AAATGAGCGA AAAAGCGGAA AAGGTCCAAA AAATAAGGTT CAAAATAAAA 2340
AAAGAGCGAA ATAATAAAAA CTACTAAATA ATTGAGGAAT GTAAAATTCT GCGAATAACA 2400
ATAAACAAAT CGAAGTGAAA TTTGTGTGAT GAATTTCAGA AAAATTATAG CCATGGTGGA 2460
TACGAATTTT TGTACTGGAA CGTGCCCCCC TGGTGTTGGA GTCTCAAAGT TCTACAGTTG 2520
TCTCCGTGGA GTACACGGAA CTGCCCGGGT ATTAATGGAA GAGGAATGAC GTCACATTTG 2580
GCCTGGAAAT ATATTGCCGG CTGAAAAATG AAAAAGGAGC GATGCTATTG ATGACCTAGA 2640
CACCCCAACC GCTGCCAAAA TGTTTGTACA TC 2672