EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01857 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:10485199-10486777 
TF binding sites/motifs
Number: 117             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:10486448-10486458TATCCCTTAT-3.02
blmp-1MA0537.1chrIII:10485343-10485353TTTCTTCTCT-3.05
blmp-1MA0537.1chrIII:10486535-10486545TATCTTTTCT-3.05
blmp-1MA0537.1chrIII:10486582-10486592CTTCGCCTCC-3.06
blmp-1MA0537.1chrIII:10486277-10486287GAATTGAAAT+3.37
blmp-1MA0537.1chrIII:10485404-10485414CTTCTTCTTC-3.39
blmp-1MA0537.1chrIII:10485407-10485417CTTCTTCTTC-3.39
blmp-1MA0537.1chrIII:10485410-10485420CTTCTTCTTC-3.39
blmp-1MA0537.1chrIII:10486626-10486636AGAGAGATAC+3.3
blmp-1MA0537.1chrIII:10485254-10485264ACTCTCTCTC-3.3
blmp-1MA0537.1chrIII:10486509-10486519TCTCCACTTC-3.51
blmp-1MA0537.1chrIII:10485624-10485634TATCACTTTT-3.6
blmp-1MA0537.1chrIII:10485260-10485270TCTCTCTCCC-3.75
blmp-1MA0537.1chrIII:10486182-10486192AGGAGGAGGG+3
blmp-1MA0537.1chrIII:10485536-10485546ATTCCATTCT-3
blmp-1MA0537.1chrIII:10486592-10486602TATCATTTTT-4.03
blmp-1MA0537.1chrIII:10485256-10485266TCTCTCTCTC-4.43
blmp-1MA0537.1chrIII:10485258-10485268TCTCTCTCTC-4.43
blmp-1MA0537.1chrIII:10486540-10486550TTTCTCTCTT-4.67
ceh-22MA0264.1chrIII:10485376-10485386TTCAATTGTC-3.05
ceh-22MA0264.1chrIII:10485740-10485750TTCAAGAAGT-3.57
ceh-22MA0264.1chrIII:10485729-10485739CCACTTGAGT+4.49
ceh-48MA0921.1chrIII:10486379-10486387TTCAATAT+3.27
ces-2MA0922.1chrIII:10486441-10486449TATGTACT-3.46
daf-12MA0538.1chrIII:10485480-10485494TCCGTGTGTGTGTT+3.01
daf-12MA0538.1chrIII:10485250-10485264CCCCACTCTCTCTC-3.14
daf-12MA0538.1chrIII:10485482-10485496CGTGTGTGTGTTCT+3.31
daf-12MA0538.1chrIII:10485484-10485498TGTGTGTGTTCTTC+4.54
dsc-1MA0919.1chrIII:10486167-10486176TCAATTAAG+3.11
dsc-1MA0919.1chrIII:10486167-10486176TCAATTAAG-3.11
dsc-1MA0919.1chrIII:10485316-10485325GTAATTAAC+3.59
dsc-1MA0919.1chrIII:10485316-10485325GTAATTAAC-3.59
efl-1MA0541.1chrIII:10485380-10485394ATTGTCCGCGTCCG-3.38
efl-1MA0541.1chrIII:10486187-10486201GAGGGCGCGAAATT+6.16
elt-3MA0542.1chrIII:10486644-10486651TTCATCA+3.02
elt-3MA0542.1chrIII:10485750-10485757TTAATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrIII:10486469-10486476TTTATCA+3.21
elt-3MA0542.1chrIII:10485469-10485476TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrIII:10486457-10486464TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrIII:10486055-10486062CATAAGA-3.27
elt-3MA0542.1chrIII:10486227-10486234GATAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrIII:10486590-10486597CCTATCA+3.35
elt-3MA0542.1chrIII:10485329-10485336GATATGA-3.58
elt-3MA0542.1chrIII:10485658-10485665GATAATA-3.81
elt-3MA0542.1chrIII:10485216-10485223TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:10486641-10486648TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:10486424-10486431TTTATCA+4.31
eor-1MA0543.1chrIII:10486301-10486315AAGATTGTCAGAGA+3.22
eor-1MA0543.1chrIII:10485402-10485416TTCTTCTTCTTCTT-3.48
eor-1MA0543.1chrIII:10486625-10486639GAGAGAGATACGCA+3.4
eor-1MA0543.1chrIII:10486500-10486514TCTTGCCCCTCTCC-3.56
eor-1MA0543.1chrIII:10486481-10486495ATCCCACTCTCTCC-3.57
eor-1MA0543.1chrIII:10485408-10485422TTCTTCTTCTTCCG-3.68
eor-1MA0543.1chrIII:10485677-10485691GTCTCTGTTTTCAT-3.71
eor-1MA0543.1chrIII:10485405-10485419TTCTTCTTCTTCTT-3.82
eor-1MA0543.1chrIII:10485253-10485267CACTCTCTCTCTCT-4.05
eor-1MA0543.1chrIII:10485255-10485269CTCTCTCTCTCTCC-5.67
eor-1MA0543.1chrIII:10485257-10485271CTCTCTCTCTCCCG-5.77
fkh-2MA0920.1chrIII:10485936-10485943TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:10486455-10486462TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:10485767-10485774TGTTTTC-3.08
fkh-2MA0920.1chrIII:10485237-10485244TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:10485521-10485528TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:10486757-10486764TGTTTAA-3.37
fkh-2MA0920.1chrIII:10485997-10486004TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:10485461-10485468TGTTTAT-3.71
fkh-2MA0920.1chrIII:10486467-10486474TGTTTAT-4.31
hlh-1MA0545.1chrIII:10485456-10485466TCGACTGTTT-3.14
hlh-1MA0545.1chrIII:10485637-10485647AACAGACGTC+3.18
hlh-1MA0545.1chrIII:10486603-10486613AACACATGTT+3.41
lim-4MA0923.1chrIII:10486372-10486380TCAATTAT+3.03
lim-4MA0923.1chrIII:10485317-10485325TAATTAAC-3.07
lim-4MA0923.1chrIII:10485846-10485854TAATGACA-3.16
lim-4MA0923.1chrIII:10486167-10486175TCAATTAA+3.52
lim-4MA0923.1chrIII:10485316-10485324GTAATTAA+3.91
lin-14MA0261.1chrIII:10486396-10486401TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrIII:10486705-10486710TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrIII:10486603-10486608AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrIII:10485490-10485495TGTTC-3.62
lin-14MA0261.1chrIII:10486208-10486213TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrIII:10486414-10486426GTGTTGCAATTT+3.78
mab-3MA0262.1chrIII:10486559-10486571CGTGGCAACATT-4.17
mab-3MA0262.1chrIII:10485815-10485827AAGTTGCAAAGT+4
pal-1MA0924.1chrIII:10486683-10486690TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrIII:10485470-10485477TTATCAC-3.1
pal-1MA0924.1chrIII:10485939-10485946TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrIII:10485846-10485853TAATGAC-3.73
pal-1MA0924.1chrIII:10485645-10485652TCATAAA+3.79
pal-1MA0924.1chrIII:10485317-10485324TAATTAA+4.27
pha-4MA0546.1chrIII:10485683-10485692GTTTTCATA-3.13
pha-4MA0546.1chrIII:10486456-10486465ATTTATCAT-3.22
pha-4MA0546.1chrIII:10486468-10486477GTTTATCAT-3.28
pha-4MA0546.1chrIII:10485462-10485471GTTTATATT-3.83
skn-1MA0547.1chrIII:10485843-10485857AATTAATGACAATT+3.23
skn-1MA0547.1chrIII:10485750-10485764TTAATCATGAAATT-3.57
skn-1MA0547.1chrIII:10486641-10486655TTTTTCATCACATT-4.48
skn-1MA0547.1chrIII:10485651-10485665ATTTGATGATAATA+5.11
sma-4MA0925.1chrIII:10485243-10485253TCCAGACCCC-3.55
unc-62MA0918.1chrIII:10486321-10486332AATTGTCAATC+3.19
unc-62MA0918.1chrIII:10485673-10485684AGTTGTCTCTG+3.25
unc-62MA0918.1chrIII:10485847-10485858AATGACAATTT-3.4
unc-86MA0926.1chrIII:10486350-10486357TAGTAAT+3.04
unc-86MA0926.1chrIII:10485610-10485617TATGCTT+3.09
unc-86MA0926.1chrIII:10486633-10486640TACGCAT+3.29
unc-86MA0926.1chrIII:10485914-10485921TATTAAT+3.32
unc-86MA0926.1chrIII:10486344-10486351TAGTCAT+3.42
unc-86MA0926.1chrIII:10486680-10486687TATTAAT+3.47
unc-86MA0926.1chrIII:10485916-10485923TTAATAT-3.47
vab-7MA0927.1chrIII:10486373-10486380CAATTAT-3.15
vab-7MA0927.1chrIII:10485846-10485853TAATGAC-3.4
vab-7MA0927.1chrIII:10485317-10485324TAATTAA+3.88
zfh-2MA0928.1chrIII:10486681-10486691ATTAATTTCT+3.13
zfh-2MA0928.1chrIII:10486233-10486243AGTAATTTGA+3.1
zfh-2MA0928.1chrIII:10485841-10485851TAAATTAATG-3.26
zfh-2MA0928.1chrIII:10486167-10486177TCAATTAAGT-3.31
zfh-2MA0928.1chrIII:10485315-10485325TGTAATTAAC+3.3
zfh-2MA0928.1chrIII:10485316-10485326GTAATTAACA-3.93
Enhancer Sequence
AGCCTTTCTC CCCAGATTTT TTCAAATTTC CAAAAAGTTG TTTTTCCAGA CCCCCACTCT 60
CTCTCTCTCC CGGATGGACT CATCGGAAAC ATTATGGGAG GTAAGAAGAG ACATATTGTA 120
ATTAACACAT GATATGACCT CTTGTTTCTT CTCTTTATCC ATACCGTTCC CGTTCAGTTC 180
AATTGTCCGC GTCCGATTCG GAATTCTTCT TCTTCTTCTT CCGTTCAATT CGTGAAATTA 240
TGTGTCCTCT GTGTCAATCG ACTGTTTATA TTTATCACTA TTCCGTGTGT GTGTTCTTCT 300
TACGTACATC TCATAATCGC TTTGTTTTCC GAATTGCATT CCATTCTCAA TAATCATGAT 360
GGCTGGATGA AAAGCACTAT TACATTCAAT GGTCATTTGA TTCAGGATCT ATATGCTTTT 420
TAAGATATCA CTTTTAGAAA CAGACGTCAT AAATTTGATG ATAATAGTTG CATTAGTTGT 480
CTCTGTTTTC ATATACTGTA CATACTCTCT TAGTATTGCA CTATATTGTT CCACTTGAGT 540
TTTCAAGAAG TTTAATCATG AAATTCGGTG TTTTCAGATA ATTTTAAGTC TAATACAGCA 600
TCCACCGTTA AATGAAAAGT TGCAAAGTTT AATTTTCAAA AATAAATTAA TGACAATTTG 660
TTTTGAATAA GGGGCAAGAA AATGGGTTCA AAGTTCCTCT AATGTGACTT ATGATTATTA 720
ATATTTGAGA GGAATAATTT TTATGATCGA CGACTTCCAA AAGAGGGGCA AAACTGAGCG 780
ATAACCATTT TTTTTTAATA AAAAATTTCA AGCATTTTTC GAAAAGTTTC ACTATGATAT 840
TTTGTTGCTT TAGCATCATA AGATTGGTTT TCAACTATTT TTTTGTTGTA AAACTTCCTT 900
GCCCCTTTAT TGAGGATTCC CACCAAAAAC ATCCAACCTT CTTGTCCAAA CCTAATCCTC 960
CCATGCCCTC AATTAAGTGT GGGAGGAGGA GGGCGCGAAA TTGGCAAGGT GTTCAGATTG 1020
TAGTACAAGA TAAGAGTAAT TTGATTGATC AATCACCCAA AAAAGTTCCT CTCTACAAGA 1080
ATTGAAATTT GAAATTTCAC AAAAGATTGT CAGAGATATG GAAATTGTCA ATCATATCCT 1140
TCCAGTAGTC ATAGTAATAT CAGGGAATTT AGGTCAATTA TTCAATATAT CCCTCCATGT 1200
TCGCCTTCCC CGACGGTGTT GCAATTTTAT CAATGCAACT GTTATGTACT ATCCCTTATT 1260
TATCATATTG TTTATCATTG GTATCCCACT CTCTCCGAAC TTCTTGCCCC TCTCCACTTC 1320
GTACCAGCCA CCGCCATATC TTTTCTCTCT TGATTGACGA CGTGGCAACA TTTACTGTTT 1380
TACCTTCGCC TCCTATCATT TTTGAACACA TGTTACATTT GAATCAGAGA GAGATACGCA 1440
TTTTTTTCAT CACATTCTAT GAACTTTTAT ATGTTTTGAA ATATTAATTT CTTTAAGACT 1500
GAATCATGTT CTAAATTACC TTGTACTTTA CTGTTTTTAG GATTTTCAGT GGAGAAAGTG 1560
TTTAAAACCG CCTAAGGA 1578