EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01848 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:10195094-10197555 
TF binding sites/motifs
Number: 131             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:10195901-10195911CATCCTTTCT-3.03
blmp-1MA0537.1chrIII:10196322-10196332GAGATGAAAT+3.04
blmp-1MA0537.1chrIII:10195115-10195125TTTCGATTAC-3.06
blmp-1MA0537.1chrIII:10197136-10197146TCTCTTCTCC-3.31
blmp-1MA0537.1chrIII:10195858-10195868AAGTCGAGAG+3.42
blmp-1MA0537.1chrIII:10197183-10197193AAAGAGAGTA+3.65
blmp-1MA0537.1chrIII:10197107-10197117AAAATGAGAA+4.88
ceh-22MA0264.1chrIII:10196013-10196023TTCAATTGTT-3.17
ceh-22MA0264.1chrIII:10196822-10196832TTTAAGTGCA-3.9
ceh-48MA0921.1chrIII:10196295-10196303TTCAATAG+3.16
ceh-48MA0921.1chrIII:10195190-10195198ATCAATAT+3.21
ceh-48MA0921.1chrIII:10195777-10195785ACCGATTT+3.22
ceh-48MA0921.1chrIII:10197229-10197237AATCGGTT-3.22
ceh-48MA0921.1chrIII:10196372-10196380TATCGGAT-3.49
ceh-48MA0921.1chrIII:10195791-10195799TTCGATAG+3.54
ceh-48MA0921.1chrIII:10196909-10196917TATCGACT-3.8
ces-2MA0922.1chrIII:10196639-10196647ATATATAA+3.12
ces-2MA0922.1chrIII:10197474-10197482TGTGTAAC-3.15
ces-2MA0922.1chrIII:10195481-10195489TTTATAAT-3.18
ces-2MA0922.1chrIII:10197539-10197547TTGTGTAA+3.27
ces-2MA0922.1chrIII:10195721-10195729TTATATAT+3.3
ces-2MA0922.1chrIII:10196598-10196606TACCTAAT-3.73
ces-2MA0922.1chrIII:10197540-10197548TGTGTAAT-4.33
che-1MA0260.1chrIII:10196506-10196511AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrIII:10196011-10196016GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrIII:10195775-10195780AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrIII:10196006-10196011AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrIII:10197513-10197518GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrIII:10195747-10195761GGCGTGATTGCAAT+3.79
dsc-1MA0919.1chrIII:10196046-10196055TAAATTAAC+3.05
dsc-1MA0919.1chrIII:10196046-10196055TAAATTAAC-3.05
dsc-1MA0919.1chrIII:10196568-10196577TCAATTAAT+3.1
dsc-1MA0919.1chrIII:10196568-10196577TCAATTAAT-3.1
dsc-1MA0919.1chrIII:10196421-10196430TTAATTGAT+3.46
dsc-1MA0919.1chrIII:10196421-10196430TTAATTGAT-3.46
dsc-1MA0919.1chrIII:10196601-10196610CTAATTACT+3.95
dsc-1MA0919.1chrIII:10196601-10196610CTAATTACT-3.95
dsc-1MA0919.1chrIII:10196612-10196621CTAATTAAT+4.31
dsc-1MA0919.1chrIII:10196612-10196621CTAATTAAT-4.31
efl-1MA0541.1chrIII:10195672-10195686ATTTGCCGCACACC-4.27
elt-3MA0542.1chrIII:10195133-10195140TTAATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrIII:10195232-10195239TATATCA+3.14
elt-3MA0542.1chrIII:10196265-10196272GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrIII:10195187-10195194TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrIII:10196427-10196434GATAAGT-3.75
elt-3MA0542.1chrIII:10196395-10196402GATAATA-3.81
elt-3MA0542.1chrIII:10196284-10196291GATAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:10196876-10196883GATAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:10195783-10195790TTTATCA+4.31
elt-3MA0542.1chrIII:10196745-10196752TTTATCA+4.31
elt-3MA0542.1chrIII:10196931-10196938GATAAAA-4.31
elt-3MA0542.1chrIII:10196962-10196969CTTATCA+4.66
eor-1MA0543.1chrIII:10197281-10197295CTCTGAAACTTTTC-3.25
eor-1MA0543.1chrIII:10197104-10197118GAAAAAATGAGAAA+3.57
eor-1MA0543.1chrIII:10197114-10197128GAAATGCGGAGACA+3.59
eor-1MA0543.1chrIII:10197501-10197515AAGAGGCACAGGGC+3.68
eor-1MA0543.1chrIII:10197499-10197513CAAAGAGGCACAGG+3.71
eor-1MA0543.1chrIII:10197129-10197143CTGTGGTTCTCTTC-3.82
eor-1MA0543.1chrIII:10197112-10197126GAGAAATGCGGAGA+3.8
eor-1MA0543.1chrIII:10197184-10197198AAGAGAGTAAGACT+4.29
fkh-2MA0920.1chrIII:10196286-10196293TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:10195479-10195486TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:10195107-10195114TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:10195281-10195288TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrIII:10196755-10196762TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:10196580-10196587TGTTTAA-3.28
fkh-2MA0920.1chrIII:10196056-10196063TGTTTAT-3.71
hlh-1MA0545.1chrIII:10197028-10197038AGCATCTGTG+3.14
hlh-1MA0545.1chrIII:10196854-10196864GACAGTTGAG+3.25
hlh-1MA0545.1chrIII:10197124-10197134GACACCTGTG+3.2
hlh-1MA0545.1chrIII:10197020-10197030AGCAGATGAG+3.48
hlh-1MA0545.1chrIII:10195891-10195901GCAAGTGTTC-3.6
hlh-1MA0545.1chrIII:10197125-10197135ACACCTGTGG-3.73
lim-4MA0923.1chrIII:10196601-10196609CTAATTAC+3.34
lim-4MA0923.1chrIII:10196568-10196576TCAATTAA+3.3
lim-4MA0923.1chrIII:10196422-10196430TAATTGAT-3.5
lim-4MA0923.1chrIII:10196613-10196621TAATTAAT-3.67
lim-4MA0923.1chrIII:10196602-10196610TAATTACT-4.08
lim-4MA0923.1chrIII:10196612-10196620CTAATTAA+4.77
lin-14MA0261.1chrIII:10196806-10196811TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrIII:10195352-10195357TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrIII:10196976-10196981AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrIII:10196982-10196987AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrIII:10195896-10195901TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrIII:10196711-10196723ATTCACAACAAT-3.59
mab-3MA0262.1chrIII:10195626-10195638ATTTTGCGGTGT+3.98
pal-1MA0924.1chrIII:10195124-10195131CCATTAA+3.19
pal-1MA0924.1chrIII:10196397-10196404TAATAAC+3.36
pal-1MA0924.1chrIII:10195103-10195110TTATTAT-3.63
pal-1MA0924.1chrIII:10197544-10197551TAATAAC+3.92
pha-4MA0546.1chrIII:10195299-10195308GTTTGGATT-3.03
pha-4MA0546.1chrIII:10196807-10196816GTTCACATT-3.17
pha-4MA0546.1chrIII:10196990-10196999ATTGGCAAT-3.38
pha-4MA0546.1chrIII:10196066-10196075ATTTGCTAT-3.56
pha-4MA0546.1chrIII:10195108-10195117ATTTATTTT-3.76
pha-4MA0546.1chrIII:10196891-10196900AAGTAAATA+4.41
skn-1MA0547.1chrIII:10196388-10196402ACTCGCTGATAATA+3.89
skn-1MA0547.1chrIII:10197037-10197051GACGTCATCTTTTG-3.91
skn-1MA0547.1chrIII:10195232-10195246TATATCAAGATTTT-4.02
skn-1MA0547.1chrIII:10196745-10196759TTTATCAGCTTGTT-4.43
sma-4MA0925.1chrIII:10195389-10195399TTTTCTAGAA+3.09
sma-4MA0925.1chrIII:10197100-10197110TCTAGAAAAA-3.1
sma-4MA0925.1chrIII:10197269-10197279CTTTCTAGAA+3.22
sma-4MA0925.1chrIII:10195770-10195780TCCAGAAACC-4.02
unc-62MA0918.1chrIII:10196119-10196130CCATGTCATTT+3.87
unc-62MA0918.1chrIII:10196851-10196862ATTGACAGTTG-3.91
unc-86MA0926.1chrIII:10195726-10195733TATGTAT+3.06
unc-86MA0926.1chrIII:10196690-10196697GGCATAT-3.18
unc-86MA0926.1chrIII:10196616-10196623TTAATAA-3.32
unc-86MA0926.1chrIII:10196572-10196579TTAATAT-3.47
unc-86MA0926.1chrIII:10195290-10195297TGAATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrIII:10195708-10195715TGAATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrIII:10196496-10196503TATTCAT+3.87
unc-86MA0926.1chrIII:10196498-10196505TTCATAT-3.87
unc-86MA0926.1chrIII:10196688-10196695TAGGCAT+4.1
vab-7MA0927.1chrIII:10196602-10196609TAATTAC-3.02
vab-7MA0927.1chrIII:10195803-10195810TAATTGA+3.15
vab-7MA0927.1chrIII:10197215-10197222CCATTAG-3
vab-7MA0927.1chrIII:10196602-10196609TAATTAC+4.31
vab-7MA0927.1chrIII:10196613-10196620TAATTAA+4.57
zfh-2MA0928.1chrIII:10196623-10196633TTTAATTTTT+3.01
zfh-2MA0928.1chrIII:10195126-10195136ATTAATTTTA+3.13
zfh-2MA0928.1chrIII:10196879-10196889AAAATTAATG-3.13
zfh-2MA0928.1chrIII:10195097-10195107TTTAATTTAT+3.14
zfh-2MA0928.1chrIII:10196046-10196056TAAATTAACC-3.22
zfh-2MA0928.1chrIII:10196568-10196578TCAATTAATA-3.25
zfh-2MA0928.1chrIII:10196420-10196430GTTAATTGAT+3.27
zfh-2MA0928.1chrIII:10196600-10196610CCTAATTACT+3.7
zfh-2MA0928.1chrIII:10196611-10196621CCTAATTAAT+3.86
zfh-2MA0928.1chrIII:10196601-10196611CTAATTACTA-3.92
zfh-2MA0928.1chrIII:10196612-10196622CTAATTAATA-5.1
Enhancer Sequence
ATATTTAATT TATTATTTAT TTTTCGATTA CCATTAATTT TAATCATGTT TTAGTCAATT 60
TGTAGTTAGG GTATGTTTTT TCTAATTTTT CAATTTATCA ATATTGTTTG TGGGTTTATT 120
TTCAGTGATT TTTCAAGTTA TATCAAGATT TTTGCAATAG CTCATTTAGG ATTTTCAAAT 180
TTTCAAATTT TTACTATGAA TAAATGTTTG GATTAGAATA TTTCAGTACT GTTTTGATTT 240
TCTCTGAACT CTCCAAAATG TTCAAAAATT CAGATCTTTC CAAAAATTTG CAGCGTTTTC 300
TAGAAGTTTT TCAACAGCTG AAACTTTCCA AAAATATCTA ATAAAATTTC TCGAAGTTTT 360
CAAACTTTTT CAGAAGCTTC TCAAATTTTT ATAATTTTTG GGAAGTTTTC AAAAACTTTC 420
CAGTATTCTC CAGAAGTCTT ATTGCTTTTC AAAAGTATCT AAAACATTTT TTCGAAGTTT 480
CCAAACCTTT CTGCAGTAGT TTTGGTGCTC CAAAAGCTTT TTTTAAAGTA AAATTTTGCG 540
GTGTTTTTTA AGCTCGGCAA GTTTTCTGAA TTTGCCAAAT TTGCCGCACA CCCCTGGTTC 600
AAATAACAGT GCTATGAATA AATTGAATTA TATATGTATG TATTTGTAAC ATAGGCGTGA 660
TTGCAATTTT AACCAGTCCA GAAACCGATT TTATCAATTC GATAGAATAT AATTGAAATC 720
TTCAAATAAA TGGATTTTTA GGGAATCTTT CGTGCCATAC GATGAAGTCG AGAGAACCAT 780
CGGCGATTAG TAATGTAGCA AGTGTTCCAT CCTTTCTCTC AATGTCTTTC CCATCCTCTA 840
CGTGACGCCT TCCAACCTGA ACTTAAGACA GTGGTGGATA TGAGCAACCG TGTCTTCGAA 900
GGTATTTAGT CGAAACCGTT TCAATTGTTT CATATATCCA CACAACCATA GGTAAATTAA 960
CCTGTTTATG CTATTTGCTA TGAATTGGTG TTTCCCTAAA ATAAGTACTT CGCAATTCAT 1020
CTGTGCCATG TCATTTATAG TTAGCTCTTC CGCTTGTAAA ATATTCAGCT GACGTACTTC 1080
TTGCAACTTT AAGAATATGA TTTAATACGG ATAGAGGAAG TACGGTACAA ACATTAGTTT 1140
TGCAACACAA TAATTTATTG GAAAGCATTG TGTTAAAAGC CCGCGCTTGA GATAAAAATT 1200
ATTCAATAGA AAGTCCGACT GATCACGAGA GATGAAATAT CGTAATCCAA AAATCTCAAT 1260
GTAGTGGCAT TTTCGAAATA TCGGATGCTT TAAAACTCGC TGATAATAAC CGAATATTAG 1320
TTCGTGGTTA ATTGATAAGT CGACGTGATC AATTGTAAAT GCTTCGTGAA ATGTATGCAA 1380
TAGTCTTTTG AATTTCCCTA GATATTCATA TGAAACGGTA GGTAACTTGC TGTCCTTGAA 1440
CGTACTGAAA AAGTAATTTC ATAGTTTGGT GATTTCAATT AATATATGTT TAACTGCACA 1500
CCTTTACCTA ATTACTACCT AATTAATAAT TTAATTTTTC ACTAAATATA TAACTAAACC 1560
ATACTTTTCT TCATGGCATT TTTTCCTGTA GTTATAGGCA TATACGAGAT CTCGCGTATT 1620
CACAACAATC ATAATTTTTC GAACTTCAGG TTTTATCAGC TTGTTTTCGT AACGTACCTC 1680
ATGGCAGATA ATCATGAGTT TATATTTTTT CCTGTTCACA TTTTTGATTT TAAGTGCATT 1740
TTAAGTTTCT CGACGCTATT GACAGTTGAG TCTGAAATAA TAGATAAAAT TAATGTTAAG 1800
TAAATATTTT TCAAATATCG ACTTACACGT CACTGATGAT AAAACGTTAA TGTCAAACAG 1860
AAAAATATCT TATCAACCGG AGAACACGAA CACATTATTG GCAATAGAAC TGGCTGTCGT 1920
GTGCTGAGCA GATGAGCATC TGTGACGTCA TCTTTTGTGC ACAGGTCACT CGAAGAGGTA 1980
CAGTAGGATT AGACGACTAG AGGGACTCTA GAAAAAATGA GAAATGCGGA GACACCTGTG 2040
GTTCTCTTCT CCTGACGTAC CGCTGTTTCA AGATAGCATG CGACGGCAAA AAGAGAGTAA 2100
GACTACAATC ATCTGAATTA TCCATTAGCC GAAAAAATCG GTTATCCGCA CACTCCTGCT 2160
CTGTGCCAAA CAGAACTTTC TAGAAGTCTC TGAAACTTTT CAGATTTTTC AGAAGTTTAA 2220
TCCGACAGTA CTCCTACAGT ACCACTATTC TTCCAAAAAG CAAATGCACT AGATGCGAAA 2280
TTCAAATAAT TTTGATTTCA AAAAAACGTC AAAAGGGAAC TGTACTGGTT AGAATAGCAG 2340
TCAGTCATTC AGTCAACTGT ACAAGATACT GTACATCCGT TGTGTAACGA TATGAGCTTT 2400
TCATACAAAG AGGCACAGGG CTTCTGTGCA CACATAAAGG ACTCATTGTG TAATAACAAC 2460
A 2461