EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01832 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:9672763-9675125 
TF binding sites/motifs
Number: 128             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:9673287-9673297AAGAAGAAAG+3.87
blmp-1MA0537.1chrIII:9674700-9674710CCTCCTTTCT-3
blmp-1MA0537.1chrIII:9673931-9673941AAAGGGAGAC+4.05
blmp-1MA0537.1chrIII:9674727-9674737TCTCACCTTC-4.13
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:9674377-9674390TTAGCTTTTTTAA+3.18
ceh-22MA0264.1chrIII:9674306-9674316CTAAAGTAGT-3.11
ceh-22MA0264.1chrIII:9673598-9673608GCAATTCAAA+3.1
ceh-22MA0264.1chrIII:9674797-9674807ATACTCGAAA+3.35
ceh-22MA0264.1chrIII:9674545-9674555GTGAAGTACA-3.56
ceh-22MA0264.1chrIII:9673877-9673887CCACTTATCA+3.5
ceh-22MA0264.1chrIII:9674221-9674231TTTAAGTGTA-3.6
ceh-22MA0264.1chrIII:9673641-9673651GCACTTGTCA+3.79
ceh-22MA0264.1chrIII:9673315-9673325CTGAAGTGCA-4.21
ceh-48MA0921.1chrIII:9672988-9672996GATCGGTT-3.29
ceh-48MA0921.1chrIII:9674517-9674525ACCAATAT+3.52
ces-2MA0922.1chrIII:9672884-9672892TTACTCAA+3.17
ces-2MA0922.1chrIII:9673254-9673262TACAAAAT-3.19
ces-2MA0922.1chrIII:9674337-9674345TTACAGAA+3.55
ces-2MA0922.1chrIII:9673299-9673307TCTGTAAT-3.55
ces-2MA0922.1chrIII:9673018-9673026TTACATAT+3.64
ces-2MA0922.1chrIII:9674530-9674538TGTATTAT-3.97
che-1MA0260.1chrIII:9674317-9674322AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrIII:9672993-9672998GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrIII:9674522-9674536TATGTGCTTGTATT+4.18
dsc-1MA0919.1chrIII:9673138-9673147ATAATTATT+3.11
dsc-1MA0919.1chrIII:9673138-9673147ATAATTATT-3.11
dsc-1MA0919.1chrIII:9673702-9673711ATAATTAAG+3.21
dsc-1MA0919.1chrIII:9673702-9673711ATAATTAAG-3.21
dsc-1MA0919.1chrIII:9672936-9672945TTAATTACA+3.26
dsc-1MA0919.1chrIII:9672936-9672945TTAATTACA-3.26
dsc-1MA0919.1chrIII:9674168-9674177TTAATTTAC+3
dsc-1MA0919.1chrIII:9674168-9674177TTAATTTAC-3
efl-1MA0541.1chrIII:9674935-9674949ATTGTGCGCCAAGA-3.32
efl-1MA0541.1chrIII:9674494-9674508ATTTCCCCCGGATG-3.43
efl-1MA0541.1chrIII:9674936-9674950TTGTGCGCCAAGAT+3.69
elt-3MA0542.1chrIII:9673131-9673138GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrIII:9673859-9673866GATAACC-3.19
elt-3MA0542.1chrIII:9674725-9674732CTTCTCA+3.35
elt-3MA0542.1chrIII:9673880-9673887CTTATCA+3.75
elt-3MA0542.1chrIII:9674585-9674592GATAAGT-3.75
elt-3MA0542.1chrIII:9673630-9673637GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:9674329-9674336GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:9673459-9673466CTTATCA+4.05
eor-1MA0543.1chrIII:9673282-9673296TGTAGAAGAAGAAA+3.07
eor-1MA0543.1chrIII:9673928-9673942TGAAAAGGGAGACA+3.53
eor-1MA0543.1chrIII:9674401-9674415CCGAAAAGCAGACA+3.99
fkh-2MA0920.1chrIII:9673671-9673678TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:9674144-9674151TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:9673446-9673453TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:9673556-9673563TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:9673905-9673912TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:9674772-9674779TAAAAAT+3.19
fkh-2MA0920.1chrIII:9673430-9673437AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:9673529-9673536TAAAAAC+3.26
fkh-2MA0920.1chrIII:9675049-9675056TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:9675059-9675066TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:9675009-9675016TAAACAA+3.48
fkh-2MA0920.1chrIII:9675070-9675077TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrIII:9673713-9673720TGTTGAC-3.63
fkh-2MA0920.1chrIII:9673352-9673359TGTTTAC-4.05
hlh-1MA0545.1chrIII:9673640-9673650GGCACTTGTC+3.35
hlh-1MA0545.1chrIII:9673054-9673064TCATCTGTTT-3.87
lim-4MA0923.1chrIII:9673014-9673022GTAATTAC+3.06
lim-4MA0923.1chrIII:9673015-9673023TAATTACA-3.06
lim-4MA0923.1chrIII:9673703-9673711TAATTAAG-3.15
lim-4MA0923.1chrIII:9673702-9673710ATAATTAA+3.37
lim-4MA0923.1chrIII:9672937-9672945TAATTACA-3.91
lin-14MA0261.1chrIII:9673362-9673367AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrIII:9674864-9674869CGTTC-3.36
lin-14MA0261.1chrIII:9674960-9674965TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrIII:9673952-9673964ATGTTGCTTGAA+4.11
pal-1MA0924.1chrIII:9674264-9674271TAATTCC-3.14
pal-1MA0924.1chrIII:9673703-9673710TAATTAA+3.54
pal-1MA0924.1chrIII:9673015-9673022TAATTAC+3.85
pal-1MA0924.1chrIII:9673015-9673022TAATTAC-3.85
pal-1MA0924.1chrIII:9672937-9672944TAATTAC-4.27
pha-4MA0546.1chrIII:9675104-9675113GGTTGCTCA-3.04
pha-4MA0546.1chrIII:9673526-9673535AAGTAAAAA+3.15
pha-4MA0546.1chrIII:9674406-9674415AAGCAGACA+3.16
pha-4MA0546.1chrIII:9673331-9673340AAGTAAAGA+3.25
pha-4MA0546.1chrIII:9674515-9674524AGACCAATA+3.34
pha-4MA0546.1chrIII:9673698-9673707ATTTATAAT-3.3
pha-4MA0546.1chrIII:9673714-9673723GTTGACAAA-3.41
pha-4MA0546.1chrIII:9672808-9672817ATACAAATA+3.67
pha-4MA0546.1chrIII:9674476-9674485GTATAAATA+3.72
pha-4MA0546.1chrIII:9673447-9673456ATTTATATT-3.7
pha-4MA0546.1chrIII:9673157-9673166GAGCAACTA+3
skn-1MA0547.1chrIII:9675020-9675034TTCTTCAACGTTTT-3.83
skn-1MA0547.1chrIII:9673558-9673572TTTTTCATCGTCCG-3.9
skn-1MA0547.1chrIII:9673931-9673945AAAGGGAGACAAAT+4
sma-4MA0925.1chrIII:9673296-9673306GTTTCTGTAA+3.11
sma-4MA0925.1chrIII:9673068-9673078ATGTCTGCTA+3.1
sma-4MA0925.1chrIII:9674407-9674417AGCAGACATG-3.1
sma-4MA0925.1chrIII:9674509-9674519TTTTCTAGAC+3.21
sma-4MA0925.1chrIII:9673822-9673832TCTAGACTCT-3.28
sma-4MA0925.1chrIII:9674207-9674217TCTAGAAAAT-3.32
sma-4MA0925.1chrIII:9673002-9673012GACAGACATG-3.7
sma-4MA0925.1chrIII:9674204-9674214AAGTCTAGAA+3
sma-4MA0925.1chrIII:9673760-9673770TCTAGACATT-4.21
sma-4MA0925.1chrIII:9673819-9673829GTGTCTAGAC+4.36
unc-62MA0918.1chrIII:9673173-9673184TTTGACATGCC-3.17
unc-62MA0918.1chrIII:9673487-9673498TGATGTCATAC+3.25
unc-62MA0918.1chrIII:9674408-9674419GCAGACATGTA-3.35
unc-62MA0918.1chrIII:9674412-9674423ACATGTAAATT+3.3
unc-62MA0918.1chrIII:9673003-9673014ACAGACATGTT-3.46
unc-62MA0918.1chrIII:9673643-9673654ACTTGTCAGTG+4.05
unc-62MA0918.1chrIII:9673390-9673401GTTGACAGCTT-4.47
unc-86MA0926.1chrIII:9673997-9674004TATGCTT+3.09
unc-86MA0926.1chrIII:9674166-9674173TATTAAT+3.32
vab-7MA0927.1chrIII:9673139-9673146TAATTAT+3.29
vab-7MA0927.1chrIII:9673139-9673146TAATTAT-3.29
vab-7MA0927.1chrIII:9673015-9673022TAATTAC+3.54
vab-7MA0927.1chrIII:9673015-9673022TAATTAC-3.54
vab-7MA0927.1chrIII:9672937-9672944TAATTAC-3.88
vab-7MA0927.1chrIII:9673703-9673710TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrIII:9674262-9674272TTTAATTCCA+3.02
zfh-2MA0928.1chrIII:9674998-9675008ATTAATTTTT+3.16
zfh-2MA0928.1chrIII:9674167-9674177ATTAATTTAC+3.21
zfh-2MA0928.1chrIII:9673013-9673023TGTAATTACA+3.23
zfh-2MA0928.1chrIII:9673014-9673024GTAATTACAT-3.29
zfh-2MA0928.1chrIII:9673701-9673711TATAATTAAG+3.33
zfh-2MA0928.1chrIII:9673137-9673147AATAATTATT+3.38
zfh-2MA0928.1chrIII:9673138-9673148ATAATTATTT-3.38
zfh-2MA0928.1chrIII:9672936-9672946TTAATTACAT-3.42
zfh-2MA0928.1chrIII:9673272-9673282GTTAATTTGA+3.45
zfh-2MA0928.1chrIII:9674995-9675005CGAATTAATT-3.6
zfh-2MA0928.1chrIII:9672935-9672945TTTAATTACA+3.73
zfh-2MA0928.1chrIII:9673702-9673712ATAATTAAGT-3.95
Enhancer Sequence
AATATTTTTT GAATTTCTGA TTATTTTGGA TATTTTGAAG CAAAAATACA AATATATTTT 60
CAAACATACA AAAGTGTTTT TTGACTGATC ATTTGAATAC AAAAACATCA CTTAAGACAT 120
ATTACTCAAC TGCCAATTTC TACCAAAAGG TGTGTCTTCA GACTTTCAGA TCTTTAATTA 180
CATGGGTATG AGAATCTATT TTCAGAAATG TACTTTCAGA AACTTGATCG GTTTCTTGTG 240
ACAGACATGT TGTAATTACA TATGGTTCTG TGGCTCAAAA AGTGCAGAAG ATCATCTGTT 300
TCTTGATGTC TGCTATGTTT TATAAACGCA GCTTTCGGAA ACTGAGAATT TAGCCAAAAA 360
ATGTGAATGA TCAAAATAAT TATTTTTGTG GGTAGAGCAA CTATAACAAT TTTGACATGC 420
CAGTTTAAAG ACGCACGTTG ATTTTTTGAG TGAGTCTCGC CGCGATCTCA GTCATAGTGA 480
TCGCTAAAGG TTACAAAATT TACAGATTTG TTAATTTGAT GTAGAAGAAG AAAGTTTCTG 540
TAATTTAAAA TTCTGAAGTG CACTTGGAAA GTAAAGATTT ATAGTACCAT GTTTACGCGA 600
ACAGAATAAA ATTTTAGGTT TTCCAAAGTT GACAGCTTCT CTGTAGTACA AAAATTGGTA 660
GATGCGGAAA ACAAAGTGGC ATTTATTTAT ATTTTCCTTA TCATATTCCC AAAACTTTTT 720
CAAATGATGT CATACAAAAT ATTAAACCTA TTTCTGTCTA CCTAAGTAAA AACCACTGCT 780
TAACACAGAA AATTGTTTTT CATCGTCCGT TGTTTTGATG ATCGACTGGG GGTCTGCAAT 840
TCAAACGTCA TTTACTTCAG TTATCCTGAA AAAAGGGGGC ACTTGTCAGT GCCACCCCAT 900
GTCTTAAATG TTTTCAGCCC TGCAGAAGTA ATAGTATTTA TAATTAAGTG TGTTGACAAA 960
CAAAATTGTG TGTCCTGATC GTTTGATTCT ACACACCTCT AGACATTTTC ATCGGAACCT 1020
CCGACCAATT CTCATAGACC GAAATGTAAA GGGAGGGTGT CTAGACTCTT TTGGGTAACC 1080
AAATAAGATT GCAGCTGATA ACCCGATTGT CTCGCCACTT ATCAGCTACA ACGATCTCAG 1140
TTTGTTTTTT TGGAAAATAA AATTTTGAAA AGGGAGACAA ATCTTGAAAA TGTTGCTTGA 1200
AGAAAATGGT TTAGAAAATG GGTTTTCGGT GAAATATGCT TTTAGAATTG GAAAACTTCC 1260
AGTCCGTTTT GGTAAATTGC CAAATTTACC TAAAAGTTTG GGTTTTCGAG CCATTTACAA 1320
GGAAATATTT TCCATTTACT CGCAGACTTC AAAACGAGAT ACATGCCATA CAAAAAATAC 1380
TTGTTGAAGA AATGTTACTG CTTTATTAAT TTACATTTTT AAGCGAGAAA TCTCCACTCT 1440
CAAGTCTAGA AAATAAATTT TAAGTGTACA ACTCTGGGAA CTTTCGGAAA AATGTTTTTT 1500
TTAATTCCAA TAATTTTTCT AAATGCCTGC AAAAATATAT TTTCTAAAGT AGTGAAACCC 1560
CGCACTGAAA AAAATTACAG AACAAATTTT AAAGCGCATA TATTTTTTTA AAAATTAGCT 1620
TTTTTAATCT AAAAAGTTCC GAAAAGCAGA CATGTAAATT TGTACTTTGT ACACAAAGAA 1680
AAGTCAAACC CGGAAGAATA ATATTTTTTG GAAGTATAAA TATTTTTGAT AATTTCCCCC 1740
GGATGTTTTT CTAGACCAAT ATGTGCTTGT ATTATTTTCA ATGTGAAGTA CAGTTCTAAT 1800
TTTTTCTTTG GAAAAACACT TTGATAAGTC AACCTGCGTG CAAAGAGCCA AGGGTTTTAT 1860
TTTAAATTTT GAAGATAGTG TGATCTCTGA AAAATTTTCA AAATTCCAAA TCATTATTAG 1920
ATACTCGGCA TTTAGTGCCT CCTTTCTCCC ACCTTTTGAG GTCTTCTCAC CTTCCGCTCA 1980
CCTTTTTGCC ACCTTCTCCC CACCTTTTGT AAAAATATCA CAATTATTCA ACGAATACTC 2040
GAAATTCAGT CGCGTTTGCC ACCTTTCTCC CACCTATTGT GGTCTAAAAC AGCAGCGGCA 2100
GCGTTCTGGT GACACCAAAA CTGCCACCAT TTGCCACCCT TTGTCGCCTT TTGTAGCACT 2160
TTGTCACCTT TCATTGTGCG CCAAGATAGT GCTGACGTGT TCTCGGATGT TATCCTGGCA 2220
CGGATAACTC TTCGAATTAA TTTTTTTAAA CAATTTTTTC TTCAACGTTT TTAAATCTAT 2280
TTTTTTTTTT TATTTTTTTT TATTTTTTTT TTACGAGATA GCAGACGGCT CGACCTGAAC 2340
TGGTTGCTCA CCGGATCTTG AA 2362