EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01819 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:9345633-9347669 
TF binding sites/motifs
Number: 138             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:9346160-9346170ATTCTCTCTT-3.02
blmp-1MA0537.1chrIII:9347314-9347324AGAAAGAGTG+3.15
blmp-1MA0537.1chrIII:9346793-9346803TTTCTCTCAT-3.2
blmp-1MA0537.1chrIII:9346177-9346187CTTCAACTTT-3.32
blmp-1MA0537.1chrIII:9347294-9347304TTTCTTCTCC-3.39
blmp-1MA0537.1chrIII:9347009-9347019AAAACGAAGC+3.3
blmp-1MA0537.1chrIII:9347532-9347542TCTCACCTTT-3.48
blmp-1MA0537.1chrIII:9345968-9345978AAATTGAAAT+3.83
blmp-1MA0537.1chrIII:9345656-9345666CTTCAATTTT-3.97
blmp-1MA0537.1chrIII:9346789-9346799TCTCTTTCTC-4.09
blmp-1MA0537.1chrIII:9346787-9346797TCTCTCTTTC-4.12
blmp-1MA0537.1chrIII:9346759-9346769TCTCTTTCTT-4.13
blmp-1MA0537.1chrIII:9347045-9347055AAAATGAAGG+4.14
blmp-1MA0537.1chrIII:9346851-9346861AGAGAGAGAG+4.43
blmp-1MA0537.1chrIII:9346162-9346172TCTCTCTTTT-5.33
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:9345858-9345871TTTTCCTCGTTAG+3.68
ceh-22MA0264.1chrIII:9346901-9346911ATCAAGTGTC-3.49
ceh-22MA0264.1chrIII:9346323-9346333TGCAAGTGGC-3
ceh-48MA0921.1chrIII:9346209-9346217GATCGATC-3.31
ces-2MA0922.1chrIII:9346601-9346609ATATGTAA+3.19
ces-2MA0922.1chrIII:9346927-9346935TACATGAT-3.32
ces-2MA0922.1chrIII:9347646-9347654TATTTAAT-3.54
ces-2MA0922.1chrIII:9346602-9346610TATGTAAT-3.64
che-1MA0260.1chrIII:9346702-9346707AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrIII:9345958-9345963GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrIII:9346352-9346357GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrIII:9345927-9345932AAGCC+3.7
daf-12MA0538.1chrIII:9347244-9347258CCTCAACCACACAT-3.15
daf-12MA0538.1chrIII:9346146-9346160ACATACACACACAA-3.1
daf-12MA0538.1chrIII:9346150-9346164ACACACACAAATTC-3.42
daf-12MA0538.1chrIII:9346148-9346162ATACACACACAAAT-3.44
daf-12MA0538.1chrIII:9346128-9346142TCGCTCCCACTCAC-3.61
daf-12MA0538.1chrIII:9346196-9346210ACAGAGCCACACTG-3.64
daf-12MA0538.1chrIII:9346136-9346150ACTCACACACACAT-3.78
daf-12MA0538.1chrIII:9346144-9346158ACACATACACACAC-3.98
daf-12MA0538.1chrIII:9346140-9346154ACACACACATACAC-3.9
daf-12MA0538.1chrIII:9346142-9346156ACACACATACACAC-3.9
daf-12MA0538.1chrIII:9346134-9346148CCACTCACACACAC-4.53
daf-12MA0538.1chrIII:9346132-9346146TCCCACTCACACAC-4.96
daf-12MA0538.1chrIII:9346138-9346152TCACACACACATAC-5.67
dsc-1MA0919.1chrIII:9346432-9346441ATAATTATT+3.11
dsc-1MA0919.1chrIII:9346432-9346441ATAATTATT-3.11
dsc-1MA0919.1chrIII:9346479-9346488TCAATTAAC+3.14
dsc-1MA0919.1chrIII:9346479-9346488TCAATTAAC-3.14
dsc-1MA0919.1chrIII:9347353-9347362CTAATAAGT+3.3
dsc-1MA0919.1chrIII:9347353-9347362CTAATAAGT-3.3
efl-1MA0541.1chrIII:9346168-9346182TTTTGCCTCCTTCA-3.09
efl-1MA0541.1chrIII:9346966-9346980GTTGGCGCGGACTT+3.66
efl-1MA0541.1chrIII:9346125-9346139AATTCGCTCCCACT-3.73
efl-1MA0541.1chrIII:9346337-9346351GAAGGCGGGAGTTA+3.84
efl-1MA0541.1chrIII:9346965-9346979CGTTGGCGCGGACT-4.07
elt-3MA0542.1chrIII:9347171-9347178TTGATCA+3.07
elt-3MA0542.1chrIII:9346054-9346061TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrIII:9347081-9347088CATAAGA-3.27
elt-3MA0542.1chrIII:9347098-9347105CATAAGA-3.27
elt-3MA0542.1chrIII:9345750-9345757TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:9346026-9346033GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:9346541-9346548GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:9346117-9346124TTTATCA+4.31
eor-1MA0543.1chrIII:9346816-9346830CTCTCTGTATATTA-3.16
eor-1MA0543.1chrIII:9346709-9346723AAGAAGCAGAGGAA+3.48
eor-1MA0543.1chrIII:9346850-9346864GAGAGAGAGAGTCT+3.54
eor-1MA0543.1chrIII:9346786-9346800ATCTCTCTTTCTCT-3.83
eor-1MA0543.1chrIII:9346333-9346347AAGAGAAGGCGGGA+4.12
eor-1MA0543.1chrIII:9346848-9346862CGGAGAGAGAGAGT+4.2
eor-1MA0543.1chrIII:9346780-9346794TTCTACATCTCTCT-4.33
eor-1MA0543.1chrIII:9346707-9346721AGAAGAAGCAGAGG+4.35
eor-1MA0543.1chrIII:9346790-9346804CTCTTTCTCTCATC-5.16
eor-1MA0543.1chrIII:9346788-9346802CTCTCTTTCTCTCA-6.4
fkh-2MA0920.1chrIII:9346378-9346385AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:9345697-9345704TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:9347447-9347454TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:9347642-9347649TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:9345823-9345830AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:9346029-9346036AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:9345746-9345753TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:9346014-9346021TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrIII:9347380-9347387TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrIII:9345634-9345641AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:9346655-9346662AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:9345675-9345682TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:9345738-9345745TAAAAAC+3.26
fkh-2MA0920.1chrIII:9345773-9345780TAAACAT+3.28
fkh-2MA0920.1chrIII:9345803-9345810TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:9345725-9345732TAAAAAA+3.4
fkh-2MA0920.1chrIII:9346821-9346828TGTATAT-3
fkh-2MA0920.1chrIII:9347235-9347242TGTTTAT-4.31
fkh-2MA0920.1chrIII:9347278-9347285TGTTTAT-4.31
hlh-1MA0545.1chrIII:9347456-9347466TCAGATGCTT-3.35
hlh-1MA0545.1chrIII:9346293-9346303CGCAGTTGTT+3.37
hlh-1MA0545.1chrIII:9346294-9346304GCAGTTGTTA-3.49
hlh-1MA0545.1chrIII:9346308-9346318TCATCTGTGT-3.54
hlh-1MA0545.1chrIII:9346236-9346246CCAACTGTGC-4.16
lim-4MA0923.1chrIII:9347573-9347581TAATGAAT-3.07
lim-4MA0923.1chrIII:9346605-9346613GTAATCAA+3.12
lim-4MA0923.1chrIII:9346479-9346487TCAATTAA+3.3
lim-4MA0923.1chrIII:9347266-9347274CTCATTAA+3.58
lin-14MA0261.1chrIII:9347039-9347044AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrIII:9347033-9347038CGTTC-3.36
mab-3MA0262.1chrIII:9347226-9347238AAGTTGCATTGT+3.83
mab-3MA0262.1chrIII:9346957-9346969AAATGCAACGTT-4.16
pal-1MA0924.1chrIII:9347175-9347182TCATAAC+3.09
pal-1MA0924.1chrIII:9346017-9346024TTATTTC-3.12
pal-1MA0924.1chrIII:9347281-9347288TTATTCC-3.15
pal-1MA0924.1chrIII:9346606-9346613TAATCAA+3.17
pal-1MA0924.1chrIII:9345883-9345890TAATGAT-3.26
pal-1MA0924.1chrIII:9347162-9347169TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrIII:9347450-9347457TTATTGT-3.46
pal-1MA0924.1chrIII:9345994-9346001TAATAAC+3.92
pha-4MA0546.1chrIII:9345663-9345672TTTTGCATA-3.03
pha-4MA0546.1chrIII:9346053-9346062ATTTATCAT-3.22
pha-4MA0546.1chrIII:9346316-9346325GTTGGTTTG-3.41
pha-4MA0546.1chrIII:9345635-9345644AAACAAACA+3.85
skn-1MA0547.1chrIII:9346472-9346486ATTCTCTTCAATTA-3.73
sma-4MA0925.1chrIII:9346906-9346916GTGTCTGGGC+6.42
snpc-4MA0544.1chrIII:9347454-9347465TGTCAGATGCT+3.97
unc-62MA0918.1chrIII:9346579-9346590AAATGTCAAAT+3.52
unc-62MA0918.1chrIII:9346218-9346229AGCTGTCAGCA+5.17
unc-86MA0926.1chrIII:9347400-9347407TACATAT-3.06
unc-86MA0926.1chrIII:9346463-9346470TATGCCT+3.18
unc-86MA0926.1chrIII:9347257-9347264TGTGCAT+3.18
unc-86MA0926.1chrIII:9347384-9347391TATTAAT+3.32
unc-86MA0926.1chrIII:9345880-9345887TATTAAT+3.47
unc-86MA0926.1chrIII:9346459-9346466TTCATAT-3.87
unc-86MA0926.1chrIII:9346453-9346460TGCCTAT-4.1
unc-86MA0926.1chrIII:9346465-9346472TGCCTAT-4.1
vab-7MA0927.1chrIII:9347609-9347616TCATTGA+3.09
vab-7MA0927.1chrIII:9346433-9346440TAATTAT+3.29
vab-7MA0927.1chrIII:9346433-9346440TAATTAT-3.29
vab-7MA0927.1chrIII:9345883-9345890TAATGAT-3.43
vab-7MA0927.1chrIII:9347267-9347274TCATTAA+3.88
zfh-2MA0928.1chrIII:9347648-9347658TTTAATTTTA+3.01
zfh-2MA0928.1chrIII:9347469-9347479TGAATTAGGA-3.05
zfh-2MA0928.1chrIII:9347550-9347560TAAATTAAAG-3.11
zfh-2MA0928.1chrIII:9347385-9347395ATTAATTTAT+3.23
zfh-2MA0928.1chrIII:9346479-9346489TCAATTAACG-3.27
zfh-2MA0928.1chrIII:9346431-9346441AATAATTATT+3.35
zfh-2MA0928.1chrIII:9346432-9346442ATAATTATTT-3.38
Enhancer Sequence
GAAAACAAAC AGCAATTGTA GTTCTTCAAT TTTTGCATAC ATTGTTTTCA ATGAACTTTC 60
ATTTTGTTGA ATTTTTAAAG CATTTAGTGA CGTAAAAAAA TTCGGTAAAA ACTTGTTTTT 120
TTCAGATCTT AACGTTTTTT TAAACATTAG AAATATTTGA TTTCAGAAAA TAAAAAAAAA 180
TGCAGCTTCA AAAACAAGCT AAGATTTCGC CAAATCTGAA TTATATTTTC CTCGTTAGAA 240
AATGGGATAT TAATGATTCG AGAATCGGAA AAAGATCTGA ACCAAATCAG CTTGAAGCCA 300
GCAAAAAATA TCACAAAAAT ATTTGGTTTC TGTTGAAATT GAAATTCCAA GCTTTTCAAC 360
GTAATAACTT ATTTTCAAAA GTTTTTATTT CTTGAAAAAA CAATGAATCG CGCTCCACCT 420
ATTTATCATT CATGAATCAA ACTTTTGAGA GTGCACATCA ACTTTCAAGC AACCTCATCC 480
GTCTTTTATC AAAATTCGCT CCCACTCACA CACACATACA CACACAAATT CTCTCTTTTG 540
CCTCCTTCAA CTTTTGATTG AAGACAGAGC CACACTGATC GATCGAGCTG TCAGCAATAT 600
CTGCCAACTG TGCGAGGTCA TTGCGAGGTG CTTTGAGACG AGACCGGGAT TCTCACTATA 660
CGCAGTTGTT AGGGGTCATC TGTGTTGGTT TGCAAGTGGC AAGAGAAGGC GGGAGTTAGG 720
TTTCAGTAAA GTTTGTACTT TTTTGAAAAC ATGAGTTGCC CTATACTGAT AGTTGATCGA 780
AGATAGGGAA TTCAGCTGAA TAATTATTTT TGATACATGA TGCCTATTCA TATGCCTATA 840
TTCTCTTCAA TTAACGATAT TACTAGGCTC ATTGTCAAAT TTAAGGTTTT TAGTGATAGT 900
GACCAAATGA AAAAATATTG AGAATATACT TGATAGCTTG ACTTGGAAAT GTCAAATGCC 960
TGAACAAAAT ATGTAATCAA ATACAATGAA AAATTGTTCC TTAAAAATCC ATTCAAAACT 1020
AGAAAACAAA ACTTTAAAAA TATAAAACCG AAAAAATTGC GTCAACCCGA AACCAGAAGA 1080
AGCAGAGGAA AAGTCTCGAC GGGGTGATGC TCCGGTTGGC CGAAGCTCTC TTTCTTCAGC 1140
TTTACACTTC TACATCTCTC TTTCTCTCAT CTTGAAGCAT CTTCTCTCTG TATATTAAAC 1200
GACAGCAGCA GCAGCCGGAG AGAGAGAGTC TCTTCTGAAG ACGCCAACAG GCACCGCCCG 1260
CCGATCGGAT CAAGTGTCTG GGCCCTCCAA GATTTACATG ATGCCTCGAA CCATTTTGCG 1320
ATTGAAATGC AACGTTGGCG CGGACTTCTG AAAGCTCTGG CTACTCGTGG TACAAAAAAA 1380
CGAAGCTGAG TTTTTTGCAG CGTTCGAACA GAAAAATGAA GGGTCAAGGA AAGCGTACCC 1440
AAAGAGTTCA TAAGAAAGTG TAGTTCATAA GAATCAAAGA ACAATCATAC AACTGGTTCC 1500
TGGTACTATA GAAAATTGGA AATACCTTTT TATGATTTTT GATCATAACT TTGCCTTGGA 1560
GCATTTCTCT ATAATCCAGA AGAAAAATTC CGAAAGTTGC ATTGTTTATA CCCTCAACCA 1620
CACATGTGCA TTGCTCATTA AAATTTGTTT ATTCCTTGCA CTTTCTTCTC CAACTTTCTT 1680
GAGAAAGAGT GGTGTTGGGT GAATAAGGTC CGGAGCAAAA CTAATAAGTT TGTAGCAAAG 1740
AAATCAGTTT TTATTAATTT ATTGAAATAC ATATGATCAA GGATTATCCT TCATTTGAAT 1800
TTATAAAACA TCAATTTTTA TTGTCAGATG CTTCCTTGAA TTAGGAGCCA TTTTCAGTCT 1860
GCCGGAAAAG CAGTTTCAAT GAAGCTGAAA TGTTAACGAT CTCACCTTTA AACCTTTTAA 1920
ATTAAAGTTT GAGGATACAT TAATGAATTG AGGCGTTTTA ATTTTTGAAA GGATACTCAT 1980
TGAAAATCGG GGGAACTTTT TCTTCAAAAT TTTTATTTAA TTTTAGGAAC AACATT 2036