EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01812 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:9180126-9181176 
TF binding sites/motifs
Number: 60             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:9180180-9180190AAATAGATAT+3.27
blmp-1MA0537.1chrIII:9180228-9180238AAATTGATAT+3.28
blmp-1MA0537.1chrIII:9180465-9180475ACTCTCTCTC-3.3
blmp-1MA0537.1chrIII:9180471-9180481TCTCTTCCTC-3.41
blmp-1MA0537.1chrIII:9181129-9181139AAAAAGAAGT+3.44
blmp-1MA0537.1chrIII:9180517-9180527CCTCCTTTTC-3.75
blmp-1MA0537.1chrIII:9180469-9180479TCTCTCTTCC-4.22
blmp-1MA0537.1chrIII:9180846-9180856CCTCACTTTC-4.28
blmp-1MA0537.1chrIII:9180453-9180463CTTCTCTTTT-4.43
blmp-1MA0537.1chrIII:9180467-9180477TCTCTCTCTT-4.5
blmp-1MA0537.1chrIII:9180461-9180471TTTCACTCTC-4.73
blmp-1MA0537.1chrIII:9180455-9180465TCTCTTTTTC-4.7
ceh-48MA0921.1chrIII:9180393-9180401TATCGAGT-3.41
ces-2MA0922.1chrIII:9180264-9180272TTTCGTAA+3.46
ces-2MA0922.1chrIII:9180193-9180201TTCGTTAT-3
che-1MA0260.1chrIII:9180882-9180887GTTTC-3.36
efl-1MA0541.1chrIII:9180521-9180535CTTTTCCGCCTATG-3.69
elt-3MA0542.1chrIII:9180430-9180437GATATAA-3.14
elt-3MA0542.1chrIII:9180639-9180646TTTATCA+3.21
elt-3MA0542.1chrIII:9181011-9181018TTTATCA+3.21
elt-3MA0542.1chrIII:9180374-9180381CTTAACA+3.58
elt-3MA0542.1chrIII:9180217-9180224TTTATCT+3
elt-3MA0542.1chrIII:9180647-9180654TTTATCT+3
eor-1MA0543.1chrIII:9180364-9180378TTGTCTATCTCTTA-3.33
eor-1MA0543.1chrIII:9180472-9180486CTCTTCCTCATACA-3.36
eor-1MA0543.1chrIII:9180366-9180380GTCTATCTCTTAAC-3.41
eor-1MA0543.1chrIII:9180454-9180468TTCTCTTTTTCACT-3.48
eor-1MA0543.1chrIII:9180168-9180182AAAAGCAACAGAAA+3.53
eor-1MA0543.1chrIII:9180718-9180732TTGTTCTTTTCTTT-3.53
eor-1MA0543.1chrIII:9180448-9180462TGCTTCTTCTCTTT-3.69
eor-1MA0543.1chrIII:9180458-9180472CTTTTTCACTCTCT-3.72
eor-1MA0543.1chrIII:9180516-9180530CCCTCCTTTTCCGC-3.79
eor-1MA0543.1chrIII:9180470-9180484CTCTCTTCCTCATA-4.03
eor-1MA0543.1chrIII:9180466-9180480CTCTCTCTCTTCCT-4.12
eor-1MA0543.1chrIII:9180460-9180474TTTTCACTCTCTCT-4.29
eor-1MA0543.1chrIII:9180464-9180478CACTCTCTCTCTTC-4.49
eor-1MA0543.1chrIII:9180456-9180470CTCTTTTTCACTCT-4.86
eor-1MA0543.1chrIII:9180493-9180507ATCTGCCTCTCTTT-4.96
fkh-2MA0920.1chrIII:9180307-9180314TAAATAC+3.03
fkh-2MA0920.1chrIII:9180936-9180943TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrIII:9180206-9180213TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:9181048-9181055TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:9181009-9181016TGTTTAT-4.31
hlh-1MA0545.1chrIII:9180346-9180356GCATCTGTTA-3.29
lim-4MA0923.1chrIII:9181028-9181036TCATTACT-3.03
pal-1MA0924.1chrIII:9181028-9181035TCATTAC-3.17
pha-4MA0546.1chrIII:9181084-9181093TTTTGCTCA-3.12
pha-4MA0546.1chrIII:9180762-9180771TGACAAACA+3.27
pha-4MA0546.1chrIII:9181112-9181121GTTGGTCTT-3.42
pha-4MA0546.1chrIII:9180304-9180313TTGTAAATA+3.54
pha-4MA0546.1chrIII:9180211-9180220ATTTGTTTT-3.73
pha-4MA0546.1chrIII:9180236-9180245ATTTACTCA-4.45
sma-4MA0925.1chrIII:9180364-9180374TTGTCTATCT+3.13
sma-4MA0925.1chrIII:9180548-9180558TCCAGACAGG-4.89
unc-62MA0918.1chrIII:9181072-9181083GTTGACAACGC-3.15
unc-86MA0926.1chrIII:9180258-9180265TGCATAT-3.18
vab-7MA0927.1chrIII:9180869-9180876CAATGAA+3.08
vab-7MA0927.1chrIII:9181028-9181035TCATTAC-3.29
vab-7MA0927.1chrIII:9180974-9180981TCATTAT-3
zfh-2MA0928.1chrIII:9180778-9180788CAAATTAAAA-3.3
Enhancer Sequence
CATTCAAAGT GTAGGACCAA TTTCTAAAAA ATACCTATTG GAAAAAGCAA CAGAAAATAG 60
ATATAATTTC GTTATAAACT TTTTTATTTG TTTTATCTAC AAAAATTGAT ATTTACTCAT 120
AAATGATCAT AGTGCATATT TCGTAAAAGA TTAAACTGAA AATGAACTCT TAAATCTATT 180
GTAAATACTC GCTTGTTCTT CTCGTAGTTC ATCCACCCTC GCATCTGTTA CTTCTTGCTT 240
GTCTATCTCT TAACACATCC TCTCATATAT CGAGTCATCA TTATATCTCC CCGGGCAACG 300
AGCTGATATA ACTGATACTC ATTGCTTCTT CTCTTTTTCA CTCTCTCTCT TCCTCATACA 360
CCTGTGCATC TGCCTCTCTT TGCGTGTCAT CCCTCCTTTT CCGCCTATGC TCAATTTGCT 420
TCTCCAGACA GGGATACTTT TAACGACGAA AAGTTCGTCC TTTTCCTGCA CATTATACGT 480
CATTTAGTTA TTTAGTTTCG TGCAACTTTA ACGTTTATCA TTTTATCTTT ATAATACTCG 540
TACTGTTAGT TCTGGCTAAC ACTTATAGCT CGTCAGACGA ACGTTCATAA TTTTGTTCTT 600
TTCTTTTGCT AAATCACTGA TATCACATTT GAGCTATGAC AAACATTTAT CTCAAATTAA 660
AAAAAGAGCT TGGCCCAAAA AAGTCAAAGT TTGCTCCATA ATCCGGTATC TATCCTCCGC 720
CCTCACTTTC CCCAATACTT TCCCAATGAA TTTCCGGTTT CTAAATCCTT TTAAAGCTTA 780
CTTTCAGATT CTCCAAAAAA TTGGTCACAA TTTTTACCTT TTATTTAACT TTTTAGTCGC 840
CATGATCGTC ATTATAATAT AGAATAATTC AGATAATGTA TTTTGTTTAT CAGTAGTGCA 900
TTTCATTACT TTACTTTGGC ATTTTTTATT TTGGTAGAGA TTTTAAGTTG ACAACGCTTT 960
TTGCTCACTT TTTCTGTTTG GATCTTGTTG GTCTTTTCGG AAAAAAAAGA AGTTTTACTT 1020
AAAGTAACGT TTTACTCATT CTAATAGTAA 1050