EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01773 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:8180938-8181514 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:8180947-8180957AGAACGAGTG+3.02
blmp-1MA0537.1chrIII:8181373-8181383AAATTGATTG+3.05
ceh-48MA0921.1chrIII:8181254-8181262TATTGGAT-3.01
ceh-48MA0921.1chrIII:8181374-8181382AATTGATT-3.03
ceh-48MA0921.1chrIII:8181431-8181439TATTGATA-3.44
daf-12MA0538.1chrIII:8181106-8181120TGAGTATGTGTACG+3.01
eor-1MA0543.1chrIII:8180942-8180956CAGAGAGAACGAGT+3.51
fkh-2MA0920.1chrIII:8181421-8181428TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrIII:8181504-8181511TAAAAAT+3.19
fkh-2MA0920.1chrIII:8181361-8181368TATACAT+3.24
fkh-2MA0920.1chrIII:8181359-8181366TGTATAC-3.45
lim-4MA0923.1chrIII:8181377-8181385TGATTGGA-3.01
pal-1MA0924.1chrIII:8181486-8181493TTATGGT-3.21
pal-1MA0924.1chrIII:8181424-8181431TTATTAT-3.63
pha-4MA0546.1chrIII:8181501-8181510GAGTAAAAA+3.26
pha-4MA0546.1chrIII:8181432-8181441ATTGATATT-3.5
skn-1MA0547.1chrIII:8181412-8181426ATTATCAAGTTTTT-3.61
unc-62MA0918.1chrIII:8181052-8181063CGCTGTCAAAG+3.42
unc-62MA0918.1chrIII:8181286-8181297GGTGACATGTT-4.14
unc-86MA0926.1chrIII:8181250-8181257TTCCTAT-3.51
vab-7MA0927.1chrIII:8181394-8181401TAATTGA+3.09
zfh-2MA0928.1chrIII:8181213-8181223GATAATTCGA+3.08
zfh-2MA0928.1chrIII:8180969-8180979CGAATTATCC-3.08
Enhancer Sequence
GAATCAGAGA GAACGAGTGC AACTTTTGCT TCGAATTATC CACACTGGAT ATATGATTAA 60
CCATTACGGC CAGAGCATCG GCGAGTGAGG CGAGTGGCGT ATCCAACCTG AAATCGCTGT 120
CAAAGGTAGA GTTCTCGTAT GGTTCAAAGT CAAAGGTGTC GAATACACTG AGTATGTGTA 180
CGTCTGAAAC AGAAACAATA ATCTGTTGGG CACCAGTTGG ATGCGCCACT CGCCTCACTC 240
GCCGATGCTC TGGCCGTAAT GCTTAATCAT ATGTGGATAA TTCGAAGCAA AAGTTGCACT 300
ATTTCTCAAG GATTCCTATT GGATACAAAG ATCGTACTGA AAATGTCGGG TGACATGTTG 360
TTGCATCTGC TCTGGTTAGC GGCATCGACA GTAATCGCAA TTGGTGGGGT TACTGTAGTC 420
TTGTATACAT CTGGAAAATT GATTGGAAAA TACCAGTAAT TGAAGCAGGC GCTGATTATC 480
AAGTTTTTAT TATTATTGAT ATTTCAGGAC TTGCTCTGAC TGCTGGTTGC ACAATTATTT 540
GCGGATATTT ATGGTTTTAA AAAGAGTAAA AATTTC 576