EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01772 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:8126487-8127647 
TF binding sites/motifs
Number: 67             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:8127184-8127194AGGGGGAGAC+3.13
blmp-1MA0537.1chrIII:8126848-8126858TCTCTTCTCT-3.32
blmp-1MA0537.1chrIII:8126770-8126780GAATCGAGAA+3.57
blmp-1MA0537.1chrIII:8126846-8126856TCTCTCTTCT-3.57
ceh-22MA0264.1chrIII:8126898-8126908TTTAAGTGTG-3.59
ceh-22MA0264.1chrIII:8126552-8126562TTCAAGAGGT-3.87
ceh-48MA0921.1chrIII:8127299-8127307AATTGATT-3.03
ceh-48MA0921.1chrIII:8127495-8127503AATTGATT-3.03
ceh-48MA0921.1chrIII:8127517-8127525GTCAATAG+3.19
ces-2MA0922.1chrIII:8126745-8126753TCTATAAT-3.25
ces-2MA0922.1chrIII:8127269-8127277TTAAGTAA+3.64
daf-12MA0538.1chrIII:8126989-8127003ATGCGAACACACAC-3.54
daf-12MA0538.1chrIII:8127005-8127019ACTCACACACACAT-3.78
daf-12MA0538.1chrIII:8126999-8127013ACACACACTCACAC-4.01
daf-12MA0538.1chrIII:8126991-8127005GCGAACACACACAC-4.16
daf-12MA0538.1chrIII:8127003-8127017ACACTCACACACAC-4.86
daf-12MA0538.1chrIII:8127007-8127021TCACACACACATTG-4.88
daf-12MA0538.1chrIII:8126993-8127007GAACACACACACAC-6.25
daf-12MA0538.1chrIII:8127001-8127015ACACACTCACACAC-6.46
daf-12MA0538.1chrIII:8126997-8127011ACACACACACTCAC-7.06
daf-12MA0538.1chrIII:8126995-8127009ACACACACACACTC-7.63
dsc-1MA0919.1chrIII:8126748-8126757ATAATTAAG+3.21
dsc-1MA0919.1chrIII:8126748-8126757ATAATTAAG-3.21
dsc-1MA0919.1chrIII:8126646-8126655CAAATTAGC+3.38
dsc-1MA0919.1chrIII:8126646-8126655CAAATTAGC-3.38
dsc-1MA0919.1chrIII:8127224-8127233CTAATTAAG+4.31
dsc-1MA0919.1chrIII:8127224-8127233CTAATTAAG-4.31
efl-1MA0541.1chrIII:8127164-8127178GGTTGGCGTGCACG-3.47
efl-1MA0541.1chrIII:8127171-8127185GTGCACGGGAATAA+3.82
efl-1MA0541.1chrIII:8127133-8127147GAGCGCGCGCAAGA+3.8
efl-1MA0541.1chrIII:8127135-8127149GCGCGCGCAAGATG+4.12
elt-3MA0542.1chrIII:8126798-8126805TTGATCA+3.07
elt-3MA0542.1chrIII:8126800-8126807GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrIII:8127308-8127315CTGATCA+3.45
elt-3MA0542.1chrIII:8126822-8126829CATATCA+3.58
eor-1MA0543.1chrIII:8127580-8127594CAGAGATGCACACT+3.38
eor-1MA0543.1chrIII:8126929-8126943CAGAGAAAAACAAA+3.59
eor-1MA0543.1chrIII:8126933-8126947GAAAAACAAAAAGA+3.67
eor-1MA0543.1chrIII:8126931-8126945GAGAAAAACAAAAA+3.94
fkh-2MA0920.1chrIII:8126935-8126942AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:8127491-8127498TAAAAAT+3.19
fkh-2MA0920.1chrIII:8127576-8127583TCAACAG+3.43
lim-4MA0923.1chrIII:8127244-8127252GTAATCAG+3.04
lim-4MA0923.1chrIII:8127599-8127607TGATTGGT-3.07
lim-4MA0923.1chrIII:8127631-8127639TGATTGGT-3.07
lim-4MA0923.1chrIII:8126749-8126757TAATTAAG-3.15
lim-4MA0923.1chrIII:8126748-8126756ATAATTAA+3.37
lim-4MA0923.1chrIII:8127225-8127233TAATTAAG-3.69
lim-4MA0923.1chrIII:8127224-8127232CTAATTAA+4.52
lin-14MA0261.1chrIII:8126572-8126577AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrIII:8126994-8126999AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrIII:8126579-8126591TAACGAAACATT-3.81
pal-1MA0924.1chrIII:8126749-8126756TAATTAA+3.54
pha-4MA0546.1chrIII:8126989-8126998ATGCGAACA+3.12
pha-4MA0546.1chrIII:8127240-8127249GTTTGTAAT-3.32
pha-4MA0546.1chrIII:8127573-8127582AAATCAACA+3.64
pha-4MA0546.1chrIII:8126866-8126875GTTTGTTCA-3.77
sma-4MA0925.1chrIII:8127094-8127104TACAGAAAAT-3.13
unc-62MA0918.1chrIII:8126515-8126526TGTGACATCAC-3.46
vab-7MA0927.1chrIII:8126749-8126756TAATTAA+4.09
vab-7MA0927.1chrIII:8127225-8127232TAATTAA+4.57
zfh-2MA0928.1chrIII:8126646-8126656CAAATTAGCT-3.33
zfh-2MA0928.1chrIII:8126747-8126757TATAATTAAG+3.38
zfh-2MA0928.1chrIII:8126666-8126676CAAATTAATA-3.47
zfh-2MA0928.1chrIII:8126748-8126758ATAATTAAGA-3.79
zfh-2MA0928.1chrIII:8127223-8127233ACTAATTAAG+3.89
zfh-2MA0928.1chrIII:8127224-8127234CTAATTAAGA-4.73
Enhancer Sequence
ACAGAATAAA GAGAAATCGT TTTGGAAGTG TGACATCACA ATCATCTAGT AGTGCAATTC 60
CGGTATTCAA GAGGTTATGG AAGAGAACAC TCTAACGAAA CATTCGACTT CACAAAGCTA 120
TCAAATATTA GAAAGATATT TCTAACGGAC GTTGAAACAC AAATTAGCTG GCTCAAAATC 180
AAATTAATAG GTTCAACTAA AACTATGATA TAGTTTTGGA ATAACTATGG AAAATACCTA 240
TTTTCTGAGT ACGAGAGTTC TATAATTAAG AAGCTATATC ACAGAATCGA GAAATCGAAT 300
TCTACATGAA TTTGATCAAA TCAAAACTTT GATTTCATAT CACATGAGGT GACGACAAAT 360
CTCTCTTCTC TATCAACTTG TTTGTTCAAT CTCAGCAGCC GGACAACGAT TTTTAAGTGT 420
GAGATATATA GAACAAAGAT ATCAGAGAAA AACAAAAAGA TGGTCCCTGA AATAGGACAG 480
TACATGAACT TGCAAAGGTC CAATGCGAAC ACACACACAC TCACACACAC ATTGAATTCG 540
TTGTCGGACG GCGGGACGAG GACGACGAGT AAGCGCTGGG ACGAGAGAGC GTCAATAGTG 600
AAGAGAGTAC AGAAAATGGC CTGCTGGTGC AGTGAAAAAC GCGAGTGAGC GCGCGCAAGA 660
TGAGGCCTGC TGCTGAAGGT TGGCGTGCAC GGGAATAAGG GGGAGACCTC AATTTGAACG 720
TTACAAAGAG CCACGTACTA ATTAAGAAAA ATTGTTTGTA ATCAGAATAG GTAGGGGTTT 780
TATTAAGTAA GTTAAATATT GGAATATAGC TAAATTGATT TCTGATCATT GAACTTTGAA 840
GAAAAGCCTA CGATAGGGAA GGCCTTGGAA GGGAATCTTA AGATTATTTC AAACTCCCCA 900
TTTCGTGAAA ACTTGAAATT TCATCTACAT GACTTCATGC CTTATCGTAG CAACTGAACC 960
TTTTTAAAAT TATCACATCG CATTTTTTGG TAACTTATGT AGCGTAAAAA TTGATTTTTG 1020
TACATTTTCA GTCAATAGGT ATTCAAAAAC CGCCAAAATT GGACTCTATG GACTGAAAAT 1080
GTACCAAAAT CAACAGAGAT GCACACTCCA TCTGATTGGT TCAAAAATGG GCCGATCGAA 1140
TCGCTGATTG GTTGCAGGTC 1160