EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01709 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:6631089-6632377 
TF binding sites/motifs
Number: 95             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:6631767-6631777ATTCACTTTT-3.3
blmp-1MA0537.1chrIII:6632125-6632135AAATGGATAA+3.7
blmp-1MA0537.1chrIII:6631382-6631392TTTCTTTTCT-4.09
blmp-1MA0537.1chrIII:6631453-6631463TTTCTTTTTT-4.98
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:6632055-6632068ATGGCCTAGTTCG+3.72
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:6631671-6631684TAATTAGACTACT-4.42
ceh-48MA0921.1chrIII:6631850-6631858ACCGATCA+3.29
ceh-48MA0921.1chrIII:6631867-6631875ATCGATAA+4.96
ces-2MA0922.1chrIII:6631435-6631443TCCATAAT-3.32
che-1MA0260.1chrIII:6631376-6631381AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrIII:6631814-6631819GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrIII:6632282-6632287GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrIII:6631206-6631211AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrIII:6631848-6631853AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrIII:6632097-6632102AAGCC+3.7
daf-12MA0538.1chrIII:6631793-6631807AGTGTGGTTTTTTG+3.58
daf-12MA0538.1chrIII:6631143-6631157GAACACGCGCGCAA-3.64
dpy-27MA0540.1chrIII:6631593-6631608ATCCCTGGTCAAAAA+3.9
dsc-1MA0919.1chrIII:6631670-6631679CTAATTAGA+4.01
dsc-1MA0919.1chrIII:6631670-6631679CTAATTAGA-4.01
dsc-1MA0919.1chrIII:6631555-6631564CTAATTAGC+5.95
dsc-1MA0919.1chrIII:6631609-6631618CTAATTAGC+5.95
dsc-1MA0919.1chrIII:6631555-6631564CTAATTAGC-5.95
dsc-1MA0919.1chrIII:6631609-6631618CTAATTAGC-5.95
efl-1MA0541.1chrIII:6631145-6631159ACACGCGCGCAATG+4.09
elt-3MA0542.1chrIII:6632130-6632137GATAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrIII:6631117-6631124CTTACCA+3.35
eor-1MA0543.1chrIII:6631452-6631466TTTTCTTTTTTTTT-3.15
eor-1MA0543.1chrIII:6631450-6631464GTTTTTCTTTTTTT-3.24
eor-1MA0543.1chrIII:6631454-6631468TTCTTTTTTTTTAA-3.27
eor-1MA0543.1chrIII:6631383-6631397TTCTTTTCTTCTAA-3.2
eor-1MA0543.1chrIII:6631542-6631556AAAAGAACCAGAGC+3.4
eor-1MA0543.1chrIII:6631380-6631394GTTTTCTTTTCTTC-3.59
eor-1MA0543.1chrIII:6632293-6632307GAGAGCCTGAGAGG+3.79
fkh-2MA0920.1chrIII:6631408-6631415TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:6632132-6632139TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:6631166-6631173TAAAAAG+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:6631449-6631456TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:6631833-6631840TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrIII:6631430-6631437TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:6632185-6632192TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrIII:6631740-6631747TGTTTAA-3.28
fkh-2MA0920.1chrIII:6631335-6631342TAAACAA+4.31
hlh-1MA0545.1chrIII:6631121-6631131CCAATTGATG-3.1
hlh-1MA0545.1chrIII:6632179-6632189ACCAGTTGTT+3.56
hlh-1MA0545.1chrIII:6632180-6632190CCAGTTGTTT-4.17
lim-4MA0923.1chrIII:6631670-6631678CTAATTAG+3.93
lim-4MA0923.1chrIII:6631671-6631679TAATTAGA-3.93
lim-4MA0923.1chrIII:6631555-6631563CTAATTAG+4.96
lim-4MA0923.1chrIII:6631609-6631617CTAATTAG+4.96
lim-4MA0923.1chrIII:6631556-6631564TAATTAGC-4.96
lim-4MA0923.1chrIII:6631610-6631618TAATTAGC-4.96
lin-14MA0261.1chrIII:6631819-6631824TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrIII:6632334-6632339TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrIII:6631144-6631149AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrIII:6631264-6631276ATGAGCAACATC-3.37
pal-1MA0924.1chrIII:6631786-6631793TTATTTC-3.12
pal-1MA0924.1chrIII:6632227-6632234TTATTCC-3.15
pal-1MA0924.1chrIII:6631439-6631446TAATAAA+3.63
pal-1MA0924.1chrIII:6631830-6631837TAATAAA+3.63
pha-4MA0546.1chrIII:6632211-6632220GTGCAAAAA+3.05
pha-4MA0546.1chrIII:6631288-6631297ATGCAGACA+3.08
pha-4MA0546.1chrIII:6631409-6631418GTTTTCATT-3.24
pha-4MA0546.1chrIII:6631439-6631448TAATAAATA+3.32
pha-4MA0546.1chrIII:6631966-6631975GGACAAACA+3.4
pha-4MA0546.1chrIII:6631332-6631341ATATAAACA+3.55
skn-1MA0547.1chrIII:6632273-6632287TTGGTCATCGTTTC-3.12
skn-1MA0547.1chrIII:6631247-6631261CAACGATGACGAAC+3.99
skn-1MA0547.1chrIII:6631123-6631137AATTGATGAATTTT+4.05
sma-4MA0925.1chrIII:6631814-6631824GTTTCTGTTC+3.01
sma-4MA0925.1chrIII:6632031-6632041TACAGAAAAT-3.02
sma-4MA0925.1chrIII:6631300-6631310ATGACTAGTA+3.04
sma-4MA0925.1chrIII:6631090-6631100TCCAGTAAAC-3.04
sma-4MA0925.1chrIII:6631690-6631700TTGTCTGAGT+3.12
sma-4MA0925.1chrIII:6631651-6631661CTGTCTGAGT+3.25
sma-4MA0925.1chrIII:6631289-6631299TGCAGACAAC-3.26
sma-4MA0925.1chrIII:6632363-6632373TTCAGACAAG-3.2
sma-4MA0925.1chrIII:6632099-6632109GCCAGAAATC-3.56
unc-62MA0918.1chrIII:6631649-6631660ACCTGTCTGAG+3.7
unc-86MA0926.1chrIII:6631157-6631164TGCCTAT-4.1
vab-7MA0927.1chrIII:6631897-6631904TCATTGA+3.09
vab-7MA0927.1chrIII:6631262-6631269CAATGAG-3.09
vab-7MA0927.1chrIII:6631556-6631563TAATTAG+3.51
vab-7MA0927.1chrIII:6631610-6631617TAATTAG+3.51
vab-7MA0927.1chrIII:6631671-6631678TAATTAG+3.51
vab-7MA0927.1chrIII:6631556-6631563TAATTAG-3.51
vab-7MA0927.1chrIII:6631610-6631617TAATTAG-3.51
vab-7MA0927.1chrIII:6631671-6631678TAATTAG-3.51
zfh-2MA0928.1chrIII:6631475-6631485TGAATTAAAC-3.15
zfh-2MA0928.1chrIII:6631670-6631680CTAATTAGAC-4.13
zfh-2MA0928.1chrIII:6631669-6631679TCTAATTAGA+4.18
zfh-2MA0928.1chrIII:6631609-6631619CTAATTAGCA-4.26
zfh-2MA0928.1chrIII:6631555-6631565CTAATTAGCG-4.36
zfh-2MA0928.1chrIII:6631554-6631564GCTAATTAGC+4.44
zfh-2MA0928.1chrIII:6631608-6631618GCTAATTAGC+4.44
Enhancer Sequence
GTCCAGTAAA CTTAGTAAAT CAAAACTTCT TACCAATTGA TGAATTTTTG CAGTGAACAC 60
GCGCGCAATG CCTATCGTAA AAAGTACGGA GAGGATCCAC CAAAAATCAC GCTTGTGAAG 120
CGTCCAATTG CCGATGCGGA GCAATTTCTC ACTGAAGGCA ACGATGACGA ACTCAATGAG 180
CAACATCCAT CAACTTCGAA TGCAGACAAC AATGACTAGT AAGAACCATA CTCAATCCCC 240
ACCATATAAA CAATTTTTTG TTTTGATTCC TGCAAAACTC CTCCGTGAAA CGTTTTCTTT 300
TCTTCTAATG CCTTCCTCAT GTTTTCATTT GTTATTTCAT TTGTTTTCCA TAATAAATAT 360
TGTTTTTCTT TTTTTTTAAA TCAAAATGAA TTAAACGGAG TTCGAAAAAG CGACAAATCA 420
CAACTAGCTA GCAAAATACC AGGACTATTT AGCAAAAGAA CCAGAGCTAA TTAGCGAAAA 480
ACCAGAGCTA GCCAGGTTGA CTCTATCCCT GGTCAAAAAG CTAATTAGCA GTGATTTTGA 540
GTCGGTTGGC CGTGACTCGC ACCTGTCTGA GTGGTTGAAA TCTAATTAGA CTACTAAGCC 600
TTTGTCTGAG TAAGCGAGGA ACGATCGTCT CGTTGAGAAG CTCCCAATTC ATGTTTAAAG 660
CCACCCGCGG AGCAATGGAT TCACTTTTTT GAGTTCTTTA TTTCAGTGTG GTTTTTTGAC 720
TTCACGTTTC TGTTCTGGAC ATAATAAAAA CTCGATTGGA AACCGATCAC ATTTTTCGAT 780
CGATAAATTC ACGGGGTTCT GGCCTTTCTC ATTGAATTTT CTCGCTCCAT TGACAATCGC 840
CTGCCGGACA GCGCGTGGAA AAGTGTCGCG TACACACGGA CAAACACAAC AGTTTTACAA 900
CTAAAAACGA GCCGCGACGC GACACGCAAC GCGCCGTAAA TCTACAGAAA ATCTCTCCGA 960
CCCAAAATGG CCTAGTTCGG AAAACTCTGC CATTTCGATT TATGAGGGAA GCCAGAAATC 1020
CGTGAAAATT ACAAGAAAAT GGATAAAAAT TTTCAGGAAA ACTAGATTTT TTCTGCAAAA 1080
AATCTGAAAA ACCAGTTGTT TTCTGAAAAT TATCCCAAAA TTGTGCAAAA ATTCTAATTT 1140
ATTCCAAAAA ATCTCGACTG GCAATTTTTT TGGTCATGGT TTTTTTGGTC ATCGTTTCAG 1200
GTGCGAGAGC CTGAGAGGAC CTACTACCAA ACTTTGAGAG TTTAATGTTC CACTTTTATT 1260
CTGACAAAGT AAAATTCAGA CAAGTAAT 1288