EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01689 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:6279315-6280275 
TF binding sites/motifs
Number: 103             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:6279868-6279878GAATTGAGTG+3.04
blmp-1MA0537.1chrIII:6279352-6279362TCTCTTCCTC-3.41
blmp-1MA0537.1chrIII:6280227-6280237TCTCTCCTTC-3.49
blmp-1MA0537.1chrIII:6280075-6280085CTTCTTTCTC-3.61
blmp-1MA0537.1chrIII:6279348-6279358TTTCTCTCTT-3.79
blmp-1MA0537.1chrIII:6279355-6279365CTTCCTCTCT-3
blmp-1MA0537.1chrIII:6279374-6279384TATCTTTTTT-4.01
blmp-1MA0537.1chrIII:6279638-6279648AAAATGAAAC+4.09
blmp-1MA0537.1chrIII:6279350-6279360TCTCTCTTCC-4.23
blmp-1MA0537.1chrIII:6279797-6279807AAATTGAAAA+4.82
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:6280045-6280058TATCGTTGCCAAT-3.59
ceh-22MA0264.1chrIII:6280094-6280104GTGAATTGGC-3.16
ceh-48MA0921.1chrIII:6279765-6279773AATTGATT-3.22
ceh-48MA0921.1chrIII:6279821-6279829ATCAATAA+3.36
ceh-48MA0921.1chrIII:6279530-6279538CTCGATAA+3.68
ceh-48MA0921.1chrIII:6279464-6279472TATTGATT-3.92
ceh-48MA0921.1chrIII:6279910-6279918TATTGATT-3.92
daf-12MA0538.1chrIII:6280011-6280025TCGCACACACAACG-3.11
daf-12MA0538.1chrIII:6280005-6280019CCGAAATCGCACAC-3.74
dsc-1MA0919.1chrIII:6279369-6279378TTAATTATC+3.39
dsc-1MA0919.1chrIII:6279369-6279378TTAATTATC-3.39
dsc-1MA0919.1chrIII:6279763-6279772TTAATTGAT+3.43
dsc-1MA0919.1chrIII:6279763-6279772TTAATTGAT-3.43
dsc-1MA0919.1chrIII:6279893-6279902TTAATTATT+3.67
dsc-1MA0919.1chrIII:6279893-6279902TTAATTATT-3.67
dsc-1MA0919.1chrIII:6279846-6279855CTAATTAAT+4.07
dsc-1MA0919.1chrIII:6279846-6279855CTAATTAAT-4.07
dsc-1MA0919.1chrIII:6279474-6279483TTAATTAAT+4.29
dsc-1MA0919.1chrIII:6279474-6279483TTAATTAAT-4.29
elt-3MA0542.1chrIII:6280247-6280254TTTATCC+3.02
elt-3MA0542.1chrIII:6279997-6280004GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrIII:6279635-6279642GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:6279700-6279707GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrIII:6280228-6280242CTCTCCTTCAGTCT-3.32
eor-1MA0543.1chrIII:6279997-6280011GAGAAAAACCGAAA+3.67
eor-1MA0543.1chrIII:6279359-6279373CTCTCTGTTTTTAA-3.73
eor-1MA0543.1chrIII:6280232-6280246CCTTCAGTCTCTCG-3.89
eor-1MA0543.1chrIII:6279559-6279573GAGAGGAATAGACA+4.13
eor-1MA0543.1chrIII:6279351-6279365CTCTCTTCCTCTCT-5.44
eor-1MA0543.1chrIII:6280259-6280273ATCTGCGTCTCTAC-5.48
eor-1MA0543.1chrIII:6280202-6280216TAGAGATGCAGACA+5.66
eor-1MA0543.1chrIII:6279353-6279367CTCTTCCTCTCTGT-6.25
fkh-2MA0920.1chrIII:6279952-6279959TGTTTAT-4.31
hlh-1MA0545.1chrIII:6279337-6279347CACATCTGAC+3.14
hlh-1MA0545.1chrIII:6280165-6280175ACAAGTGTGT-3.23
hlh-1MA0545.1chrIII:6279985-6279995GCATCTGTTT-3.52
lim-4MA0923.1chrIII:6279913-6279921TGATTACA-3.12
lim-4MA0923.1chrIII:6279893-6279901TTAATTAT+3.24
lim-4MA0923.1chrIII:6279836-6279844CTCATTAA+3.46
lim-4MA0923.1chrIII:6279894-6279902TAATTATT-3.57
lim-4MA0923.1chrIII:6279764-6279772TAATTGAT-3.5
lim-4MA0923.1chrIII:6279847-6279855TAATTAAT-3.67
lim-4MA0923.1chrIII:6279370-6279378TAATTATC-3.71
lim-4MA0923.1chrIII:6279474-6279482TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrIII:6279475-6279483TAATTAAT-3.75
lim-4MA0923.1chrIII:6279369-6279377TTAATTAT+3
lim-4MA0923.1chrIII:6279846-6279854CTAATTAA+4.14
lin-14MA0261.1chrIII:6279958-6279963TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrIII:6279335-6279340AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrIII:6280047-6280059TCGTTGCCAATT+4.4
pal-1MA0924.1chrIII:6279436-6279443AAATAAA+3.12
pal-1MA0924.1chrIII:6279610-6279617AAATAAA+3.12
pal-1MA0924.1chrIII:6279449-6279456TTATTTC-3.12
pal-1MA0924.1chrIII:6279913-6279920TGATTAC-3.17
pal-1MA0924.1chrIII:6279658-6279665TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrIII:6279370-6279377TAATTAT-3.54
pal-1MA0924.1chrIII:6279894-6279901TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrIII:6279322-6279331ATGTAAACT+3.12
pha-4MA0546.1chrIII:6279465-6279474ATTGATTTA-3.48
skn-1MA0547.1chrIII:6279938-6279952TTTGTGATCATTAT-3.13
skn-1MA0547.1chrIII:6280205-6280219AGATGCAGACATTC+3.88
skn-1MA0547.1chrIII:6279881-6279895ATTGTCAAGATGTT-4.05
skn-1MA0547.1chrIII:6279628-6279642GATAGATGAAAAAA+4.13
sma-4MA0925.1chrIII:6279416-6279426CTGTCTATTT+3.09
sma-4MA0925.1chrIII:6279861-6279871ACGTCTAGAA+3.09
sma-4MA0925.1chrIII:6279565-6279575AATAGACAGT-3.25
sma-4MA0925.1chrIII:6280208-6280218TGCAGACATT-3.41
sma-4MA0925.1chrIII:6279605-6279615GCCAGAAATA-3.5
snpc-4MA0544.1chrIII:6280158-6280169GCGACGGACAA-4.18
unc-62MA0918.1chrIII:6279414-6279425AACTGTCTATT+3.21
unc-62MA0918.1chrIII:6279341-6279352TCTGACATTTC-3.8
unc-62MA0918.1chrIII:6279645-6279656AACTGTCACTG+4.28
unc-86MA0926.1chrIII:6279472-6279479TATTAAT+3.32
unc-86MA0926.1chrIII:6279478-6279485TTAATAA-3.32
unc-86MA0926.1chrIII:6279761-6279768TATTAAT+3.47
vab-7MA0927.1chrIII:6279475-6279482TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrIII:6279475-6279482TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrIII:6279837-6279844TCATTAA+3.88
vab-7MA0927.1chrIII:6279370-6279377TAATTAT-4.09
vab-7MA0927.1chrIII:6279894-6279901TAATTAT-4.09
vab-7MA0927.1chrIII:6279847-6279854TAATTAA+4.57
zfh-2MA0928.1chrIII:6279839-6279849ATTAATTCTA+3.17
zfh-2MA0928.1chrIII:6279826-6279836TAAATTAAGC-3.23
zfh-2MA0928.1chrIII:6279762-6279772ATTAATTGAT+3.25
zfh-2MA0928.1chrIII:6279893-6279903TTAATTATTC-3.47
zfh-2MA0928.1chrIII:6279369-6279379TTAATTATCT-3.53
zfh-2MA0928.1chrIII:6279368-6279378TTTAATTATC+3.61
zfh-2MA0928.1chrIII:6279845-6279855TCTAATTAAT+3.61
zfh-2MA0928.1chrIII:6279849-6279859ATTAATTCGT+3.6
zfh-2MA0928.1chrIII:6279892-6279902GTTAATTATT+3.84
zfh-2MA0928.1chrIII:6279473-6279483ATTAATTAAT+4.22
zfh-2MA0928.1chrIII:6279474-6279484TTAATTAATA-4.22
zfh-2MA0928.1chrIII:6279846-6279856CTAATTAATT-5.57
Enhancer Sequence
ATTTACAATG TAAACTTTTG AACACATCTG ACATTTCTCT CTTCCTCTCT GTTTTTAATT 60
ATCTTTTTTT GCGGAGTGAG CCTATGTAGT TCAATCGAAA ACTGTCTATT TAGAATGAGA 120
GAAATAAAAC AAATTTATTT CGGAAAAAAT ATTGATTTAT TAATTAATAA TTTACATTCG 180
GAGTTCACAT TGCCACGAGT CTTCCGCAAA CATCACTCGA TAACATCGGT AAATCACTTC 240
GGACGAGAGG AATAGACAGT GTAGATATTC GGTGTAGGTT TTGGCACGAT GCCAGAAATA 300
AAATGACGTC ATAGATAGAT GAAAAAATGA AACTGTCACT GCTTTATGAT ACTAGCAACT 360
TTCGAAGTAG AGTAATTCTA GATGTGAAAA AAATTATTAG AACTCCTCGA AAAAATATTC 420
AAAAAATCTA GAATCTGGAA CGTATATATT AATTGATTTG CTAGTTAGAA TATAATACTT 480
TAAAATTGAA AATTTCCTTT CAGATCATCA ATAAATTAAG CCTCATTAAT TCTAATTAAT 540
TCGTCAACGT CTAGAATTGA GTGAATATTG TCAAGATGTT AATTATTCCA CATGATATTG 600
ATTACAATAG AAAGTATGCC CTTTTTGTGA TCATTATTGT TTATGTTCCT TTCCCAGTTC 660
TTACTGCTTC GCATCTGTTT TTGAGAAAAA CCGAAATCGC ACACACAACG CAGAAAATGT 720
GTTGTTACTC TATCGTTGCC AATTCTTCTC TCATTTTGGC CTTCTTTCTC CTCGACCGAG 780
TGAATTGGCC TCCGACGACG AGGATGGGTG AAAGACATAC GGCGACTGTA GAGAGTGACA 840
TACGCGACGG ACAAGTGTGT TGAAATTGTG CAAGACCGTA TGATTTGTAG AGATGCAGAC 900
ATTCAGGGTA TGTCTCTCCT TCAGTCTCTC GTTTTATCCT AAGTATCTGC GTCTCTACAC 960