EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01663 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:5324144-5324562 
TF binding sites/motifs
Number: 29             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:5324237-5324247AAATTGAAAA+4.82
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:5324287-5324300TTGGATTTGTTCG+3.63
ces-2MA0922.1chrIII:5324258-5324266TGCCTAAT-3.14
ces-2MA0922.1chrIII:5324222-5324230TATATGAT-3.25
ces-2MA0922.1chrIII:5324332-5324340TATTTTAT-3
daf-12MA0538.1chrIII:5324304-5324318AGCGCGCTTGCACG+4.86
dsc-1MA0919.1chrIII:5324472-5324481TTAATTAAT+4.29
dsc-1MA0919.1chrIII:5324472-5324481TTAATTAAT-4.29
elt-3MA0542.1chrIII:5324498-5324505GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:5324191-5324198GATAAAA-4.31
fkh-2MA0920.1chrIII:5324367-5324374TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrIII:5324328-5324335TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrIII:5324451-5324458TAAAAAT+3.19
fkh-2MA0920.1chrIII:5324517-5324524TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrIII:5324193-5324200TAAAAAA+3.3
lim-4MA0923.1chrIII:5324472-5324480TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrIII:5324473-5324481TAATTAAT-3.75
pal-1MA0924.1chrIII:5324469-5324476AAATTAA+3.07
pha-4MA0546.1chrIII:5324329-5324338ATTTATTTT-3.76
skn-1MA0547.1chrIII:5324491-5324505AATCGTTGAAAAAA+3.81
skn-1MA0547.1chrIII:5324184-5324198ATATCATGATAAAA+4.76
unc-86MA0926.1chrIII:5324416-5324423TGCAAAT-3.09
unc-86MA0926.1chrIII:5324160-5324167TGCCTAT-4.1
vab-7MA0927.1chrIII:5324473-5324480TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrIII:5324473-5324480TAATTAA-3.22
zfh-2MA0928.1chrIII:5324468-5324478GAAATTAATT-3.2
zfh-2MA0928.1chrIII:5324475-5324485ATTAATTCAG+3.36
zfh-2MA0928.1chrIII:5324471-5324481ATTAATTAAT+4.38
zfh-2MA0928.1chrIII:5324472-5324482TTAATTAATT-4.38
Enhancer Sequence
AAATTGCTTT AAAACATGCC TATGATACCA CAAGGACCGA ATATCATGAT AAAAAATTCA 60
AAAAAATTTT CTAAATTTTA TATGATTTTT TGAAAATTGA AAAATCTCAG TTTTTGCCTA 120
ATTTCTATTT GAATTACCGC CAATTGGATT TGTTCGATGG AGCGCGCTTG CACGTTTTTA 180
AATTTATTTA TTTTATTTTT TGTTATTTTC CACCGATTTT TAATGTTTTC GGTGTATTTT 240
TGGTCGAATT TTAGAGAAAA AATCAAAATA AATGCAAATT TTCGATTAAA AAGCACGCTT 300
ACAGGCGTAA AAATGTAAAT CAGTGAAATT AATTAATTCA GGTTTGAAAT CGTTGAAAAA 360
AGTTACTTTT ACATTTTTAC GCCTATAAGC GTGCTTTTTA ATCGAAAATT TGCAATTA 418