EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01625 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:3766461-3768120 
TF binding sites/motifs
Number: 68             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:3766826-3766836AAGTTGAATG+3.02
blmp-1MA0537.1chrIII:3767292-3767302AAAAAGAGTT+3.04
blmp-1MA0537.1chrIII:3767197-3767207TATCGCTTTT-4.01
ceh-22MA0264.1chrIII:3767884-3767894CCACTTTTAA+3.1
ceh-22MA0264.1chrIII:3766732-3766742ACAATTGAAA+3.2
ceh-48MA0921.1chrIII:3767809-3767817TATCGGGC-3.32
ces-2MA0922.1chrIII:3767509-3767517ATATATAA+3.12
ces-2MA0922.1chrIII:3768051-3768059TGTGTAAT-3.15
ces-2MA0922.1chrIII:3767411-3767419TGCGTAAG-3.23
ces-2MA0922.1chrIII:3767493-3767501TTTCATAA+3.43
ces-2MA0922.1chrIII:3767410-3767418TTGCGTAA+3.59
che-1MA0260.1chrIII:3767848-3767853GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrIII:3766741-3766755AGTGTCTGTGTGTC+3.55
daf-12MA0538.1chrIII:3766739-3766753AAAGTGTCTGTGTG+5.15
dsc-1MA0919.1chrIII:3767464-3767473TCAATTAAC+3.31
dsc-1MA0919.1chrIII:3767464-3767473TCAATTAAC-3.31
elt-3MA0542.1chrIII:3766800-3766807GATAAGA-3.45
elt-3MA0542.1chrIII:3767018-3767025CTTATCA+3.71
elt-3MA0542.1chrIII:3766769-3766776GATAAGT-3.75
elt-3MA0542.1chrIII:3767131-3767138TTTATCA+3.95
elt-3MA0542.1chrIII:3767671-3767678GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrIII:3766809-3766823GAGAGATGGACGAA+3.48
eor-1MA0543.1chrIII:3766801-3766815ATAAGACAGAGAGA+4.78
fkh-2MA0920.1chrIII:3766840-3766847TGTAGAC-3.02
fkh-2MA0920.1chrIII:3767624-3767631TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:3766677-3766684AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:3767180-3767187AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:3767232-3767239AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:3767346-3767353AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:3767676-3767683AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:3767725-3767732TAAAAAT+3.19
fkh-2MA0920.1chrIII:3767977-3767984TAAAAAT+3.19
fkh-2MA0920.1chrIII:3767983-3767990TGTTTAA-3.28
fkh-2MA0920.1chrIII:3768113-3768120TAAACAA+4.66
lim-4MA0923.1chrIII:3766941-3766949TTCATTAA+3.07
lim-4MA0923.1chrIII:3767578-3767586CCCATTAA+3.18
lim-4MA0923.1chrIII:3767464-3767472TCAATTAA+3.52
lin-14MA0261.1chrIII:3767125-3767130AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrIII:3767620-3767625AACAT+3.14
mab-3MA0262.1chrIII:3766916-3766928CAATGCAACAAT-4.45
pal-1MA0924.1chrIII:3767643-3767650TAATTCC-3.14
pal-1MA0924.1chrIII:3766765-3766772TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrIII:3766924-3766931CAATAAA+3.46
pal-1MA0924.1chrIII:3767393-3767400CAATAAA+3.46
pal-1MA0924.1chrIII:3767263-3767270TTGTTAC-3
pha-4MA0546.1chrIII:3767286-3767295GAGCAAAAA+3.12
pha-4MA0546.1chrIII:3767722-3767731ATGTAAAAA+3.2
pha-4MA0546.1chrIII:3768110-3768119GGGTAAACA+4.14
pha-4MA0546.1chrIII:3767681-3767690AAGCAAACA+4.16
pha-4MA0546.1chrIII:3766990-3766999ATGTAAATA+4.51
skn-1MA0547.1chrIII:3766538-3766552TTTTTCAGCAACTT-4.09
sma-4MA0925.1chrIII:3767009-3767019CATAGACAGC-3.23
sma-4MA0925.1chrIII:3767749-3767759TCCAGTCATA-3.72
sma-4MA0925.1chrIII:3766742-3766752GTGTCTGTGT+3.92
snpc-4MA0544.1chrIII:3767454-3767465TGTCGCCTGCT+4.73
snpc-4MA0544.1chrIII:3766751-3766762TGTCGCCCACC+4
unc-62MA0918.1chrIII:3767048-3767059TAAGACAGGCT-3.03
unc-62MA0918.1chrIII:3766473-3766484AACTGTCTCAA+3.13
unc-62MA0918.1chrIII:3766728-3766739AGTGACAATTG-3.44
unc-62MA0918.1chrIII:3767010-3767021ATAGACAGCTT-3.65
unc-86MA0926.1chrIII:3767582-3767589TTAATAT-3.47
vab-7MA0927.1chrIII:3766698-3766705CAATGAA+3.08
vab-7MA0927.1chrIII:3767579-3767586CCATTAA+3.16
vab-7MA0927.1chrIII:3767805-3767812TCATTAT-3.35
zfh-2MA0928.1chrIII:3767638-3767648AAAATTAATT-3.16
zfh-2MA0928.1chrIII:3767690-3767700GTTAATTTTC+3.1
zfh-2MA0928.1chrIII:3767641-3767651ATTAATTCCA+3.22
zfh-2MA0928.1chrIII:3767464-3767474TCAATTAACA-3.27
Enhancer Sequence
AAGTTGCTCA AAAACTGTCT CAAATACCAA CGTGCCGAGT TACACATGAC ACTCGGCATA 60
TTGCGATTCT GTAGCAGTTT TTCAGCAACT TTTTGAAACT TTCTAACTTG AAAAGCTTTG 120
GGTGGCTTTA CATTTGTCCA AAACATGGGA CAACTTTACA ACTCGTGGAT TTGAATTTCA 180
TCTAACTATA ATGTCACACT CTACACCGGA ACTCTAAAAA CAACGCGCAA TGAGCTCCAA 240
TGAAACATCG CGAGACGTGT CCGAAATAGT GACAATTGAA AGTGTCTGTG TGTCGCCCAC 300
CAATTTATGA TAAGTGTGTC TCATATAGAG GACAAATGCG ATAAGACAGA GAGATGGACG 360
AAGAAAAGTT GAATGGAGTT GTAGACGATT GGAGGTTCGG CTGGTGGGGA GGGACACATA 420
AGGTAGGGGG GACCGCCTGT TTGAAAGGGG GGACTCAATG CAACAATAAA CGTATTATGA 480
TTCATTAAGT TTCAAAACCA AGTAACATTA TGGCAAGTAT ATTGAGGTAA TGTAAATAGT 540
GTCTCTCTCA TAGACAGCTT ATCAGCAAGA GAAAATGGAA TTTGTTCTAA GACAGGCTGA 600
AAGTGGTGGG AATCTGTGTT TCAAACTTTT TTTTGATACT TTTTTGGCCA AAAAAGTAAA 660
GCAGAACATC TTTATCATAC CTTAGTTTTG TAACAACCAA ATTCGAAACT AAAACTTGAA 720
AAACAAGCAT TCCCACTATC GCTTTTACGA TATCAACCAT CTATTTGAAC AAAAACAAAA 780
TAAGATACTA TCATATTAAA GTTTGTTACT TTTGATACTG GGAATGAGCA AAAAAAGAGT 840
TTCAGTTTTT TTGGGCGTGG ATCCTAACTG TAGTATTTCA GTCAAAAAAC AAGAAGAGCT 900
TGCTTTAGTA ACGCTACTGT ACCGTACCAT TACAATAAAC TAGCCAGTAT TGCGTAAGTA 960
CCCTGGATAT GCCGAGATGG AGCCCACAAT CAATGTCGCC TGCTCAATTA ACAATTTTGA 1020
AAATTTAGGA AATTTCATAA ATTTTAAAAT ATATAACTTC CACTTCGCGA TTTTTCATGC 1080
ACAGCCGCAA TTCATTGAAT AGGTATTCCC CTATTCACCC ATTAATATTT TAAAATTAAA 1140
AAAATCATAT CTTAGCTAGA ACATAAAAAT ATATCTAAAA ATTAATTCCA GATGTTTCTC 1200
CACTGCACAT GAAAAAAAAC AAGCAAACAG TTAATTTTCA AAACAAAAAA AAACATTTTA 1260
AATGTAAAAA TTGTAGCTAG CTCCAGGCTC CAGTCATATG ACGAATGAGG TAATCGTTGT 1320
TCGTTAAAAA GTATAAAATC ACCTTCATTA TCGGGCCTCT CATGGGTATT TAGATCATTG 1380
AATTGCGGTT TCAAAAAGTA AAAGTACAAG TCCGGGTCAC CCACCACTTT TAATGGAATG 1440
TGGATATGCT CAAATACAGT GCTCATTGTA ATGGGATGGC GTGGAGGATG ATTTACCCTG 1500
TGTAACAGAA AAATAGTAAA AATGTTTAAC ACCGGATGTT TCAGAAAAAA TCCCATTTCA 1560
AATAATTTTG CAGAGCATTT TTTTGAATTC TGTGTAATTC TTCACAACAA ACGTACTGGA 1620
AAAAAATCTG GAAATTTTTG AATTTAGTTG GGTAAACAA 1659