EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01618 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:3560025-3561245 
TF binding sites/motifs
Number: 71             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:3560292-3560302GAAAAGAATA+3.15
blmp-1MA0537.1chrIII:3560362-3560372AAGAAGAGAC+3.28
blmp-1MA0537.1chrIII:3560383-3560393AGAGAGATAC+3.32
blmp-1MA0537.1chrIII:3561153-3561163AAATAGAATA+3.41
blmp-1MA0537.1chrIII:3560424-3560434GGAGAGAGAG+3.75
blmp-1MA0537.1chrIII:3560442-3560452AAGTTGAAAA+3.81
blmp-1MA0537.1chrIII:3560426-3560436AGAGAGAGAG+4.43
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:3561105-3561118TTGTTCTAGTTTG+4.6
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:3560979-3560992TTGGGTCAGTCAA+4.87
ces-2MA0922.1chrIII:3560691-3560699GTACACAA+3.01
ces-2MA0922.1chrIII:3560717-3560725GTACACAA+3.01
ces-2MA0922.1chrIII:3560636-3560644TATAAAAT-3.12
che-1MA0260.1chrIII:3560538-3560543AAGCG+3.2
dsc-1MA0919.1chrIII:3560412-3560421TTAATTTGG+3
dsc-1MA0919.1chrIII:3560412-3560421TTAATTTGG-3
efl-1MA0541.1chrIII:3560262-3560276ATTTGCGCCAATGT+3.54
efl-1MA0541.1chrIII:3560261-3560275AATTTGCGCCAATG-4.1
elt-3MA0542.1chrIII:3561139-3561146GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrIII:3560255-3560262CTTAACA+3.58
elt-3MA0542.1chrIII:3560447-3560454GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrIII:3560736-3560743GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrIII:3560286-3560300TAGAGAGAAAAGAA+3.41
eor-1MA0543.1chrIII:3560293-3560307AAAAGAATAAAACA+3.44
eor-1MA0543.1chrIII:3560419-3560433GGGTGGGAGAGAGA+3.64
eor-1MA0543.1chrIII:3560376-3560390AAGTTAAAGAGAGA+3.75
eor-1MA0543.1chrIII:3560057-3560071GAAATAGGAAGAAA+3.79
eor-1MA0543.1chrIII:3560423-3560437GGGAGAGAGAGAGC+4.4
eor-1MA0543.1chrIII:3560365-3560379AAGAGACGCAGAAG+6.23
fkh-2MA0920.1chrIII:3560952-3560959TGTAGAC-3.02
fkh-2MA0920.1chrIII:3561085-3561092TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:3561132-3561139TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:3561168-3561175TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrIII:3561087-3561094TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrIII:3560654-3560661TAAACAT+3.28
fkh-2MA0920.1chrIII:3560508-3560515TGTTTAA-3.28
fkh-2MA0920.1chrIII:3560523-3560530TCAACAA+3.76
hlh-1MA0545.1chrIII:3560605-3560615ACACATGTTT-3.08
hlh-1MA0545.1chrIII:3560994-3561004ACAGCTGAGC-3.27
hlh-1MA0545.1chrIII:3560993-3561003AACAGCTGAG+4.71
lim-4MA0923.1chrIII:3560500-3560508TAATTACA-3.22
lim-4MA0923.1chrIII:3560867-3560875TAATTGTT-3.28
lim-4MA0923.1chrIII:3560905-3560913TCAATTAA+3.3
lim-4MA0923.1chrIII:3560278-3560286TAATTGAA-3.3
lin-14MA0261.1chrIII:3560993-3560998AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrIII:3560825-3560830AACAC+3.62
pal-1MA0924.1chrIII:3560409-3560416CCATTAA+3.19
pal-1MA0924.1chrIII:3560220-3560227TAATGGT-3.19
pal-1MA0924.1chrIII:3560500-3560507TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrIII:3560867-3560874TAATTGT-3.42
pha-4MA0546.1chrIII:3560651-3560660ATTTAAACA+3.08
pha-4MA0546.1chrIII:3560090-3560099TTACAAACA+3.3
pha-4MA0546.1chrIII:3560520-3560529AGGTCAACA+3.6
skn-1MA0547.1chrIII:3560440-3560454AAAAGTTGAAAAAA+4.35
skn-1MA0547.1chrIII:3561050-3561064CATTGATGACAATT+4.92
sma-4MA0925.1chrIII:3560600-3560610TGCAGACACA-3.6
sma-4MA0925.1chrIII:3561188-3561198TCCAGACAAA-4.38
unc-62MA0918.1chrIII:3560501-3560512AATTACATGTT-3.22
unc-62MA0918.1chrIII:3560460-3560471TGATGTCAGGC+3.27
unc-62MA0918.1chrIII:3561054-3561065GATGACAATTG-3.32
vab-7MA0927.1chrIII:3560552-3560559CAATGAG-3.09
vab-7MA0927.1chrIII:3560500-3560507TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrIII:3560867-3560874TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrIII:3560500-3560507TAATTAC+3.6
zfh-2MA0928.1chrIII:3561235-3561245CATAATTCGA+3.06
zfh-2MA0928.1chrIII:3560276-3560286TTTAATTGAA+3.11
zfh-2MA0928.1chrIII:3560865-3560875ATTAATTGTT+3.12
zfh-2MA0928.1chrIII:3560905-3560915TCAATTAAGG-3.25
zfh-2MA0928.1chrIII:3560499-3560509ATAATTACAT-3.29
zfh-2MA0928.1chrIII:3560152-3560162CCTAATTCGA+3.32
zfh-2MA0928.1chrIII:3560498-3560508CATAATTACA+3.35
zfh-2MA0928.1chrIII:3560411-3560421ATTAATTTGG+3.57
Enhancer Sequence
ATCAACTTTG ATGATTGGAA GTGCAATTCT TGGAAATAGG AAGAAATTAG GCGGTAGTAG 60
ATAATTTACA AACAAGAAGG ATCCACGAAG AAGGTGATGT GATGGAGGAG CAGGGCGAGG 120
GTGGCGGCCT AATTCGATTC CAAACTTCCG ATTTTCCTTT AGTGCAAAGT GATGGGGTGT 180
GGAGGGTGGC CCGATTAATG GTTTAAGTTC CATAAAATAT GTTTTTTGTT CTTAACAATT 240
TGCGCCAATG TTTTAATTGA ATAGAGAGAA AAGAATAAAA CATAAGGAAT GCGTGTCATT 300
CAGATGACGT GCTCCATTCG ACGTCACGAA CCCCCCGAAG AAGAGACGCA GAAGTTAAAG 360
AGAGATACGC TACACATATA CGGACCATTA ATTTGGGTGG GAGAGAGAGA GCACAAAAAG 420
TTGAAAAAAA GAGCATGATG TCAGGCAGGA AGTGGGTCAA ACAGGTCAAC CCGCATAATT 480
ACATGTTTAA AATGCAGGTC AACAAGTTGG AAGAAGCGTG CTTTGCTCAA TGAGCATTCC 540
CAATGGGTAA GAGCTATTAT TTGTAGGTTG TGGTGTGCAG ACACATGTTT TGGTGCTCAA 600
GAATCAGCTT TTATAAAATG AAAGAAATTT AAACATATTT GGAGCTGCGT GGGGCATGAA 660
CGTGTAGTAC ACAACTCCAC TGTTTTTTGG AAGTACACAA ACAACACATT TGAAAAAATC 720
AGTCTAAGTC TACAGTAACC CATGCCCACA GTTTTGACGT TCGCAATGAT ATTAAAACCT 780
AGAATCCTAG AATCCCCAAG AACACTGCTT ACTGAAATGA CGTGAGCTCC TACCCGGTCT 840
ATTAATTGTT TGACTCCCTG ATGCCAACTA ACAGATCATT TCAATTAAGG CAACTTCCTC 900
GTCAGTCTTG ACCTGTTTTG ACCTCCTTGT AGACATAATT CCTCAAATGA CGTATTGGGT 960
CAGTCAAGAA CAGCTGAGCC ACTCCTCTGA CATTGACACA CTTCCTTATT AGACCACCCC 1020
CACTGCATTG ATGACAATTG TACTTTTTAG CTAGATTTTT TGTTTTTATG TGTGTAGAAA 1080
TTGTTCTAGT TTGACAACGA AGACGTTTGT TTTTGACAAA ATTTTTAAAA ATAGAATAAT 1140
TTTTGTTTTT TTAGAGATGC TTTTCCAGAC AAAACAGAAA ATCTTATTCA CAAAATTTCG 1200
TACTTTTTGC CATAATTCGA 1220