EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01521 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrIII:2062752-2063894 
TF binding sites/motifs
Number: 52             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrIII:2063596-2063606CATCTATTTT-3.01
blmp-1MA0537.1chrIII:2063686-2063696AAAATGAATC+3.15
blmp-1MA0537.1chrIII:2063401-2063411TATCAATCTC-3.48
blmp-1MA0537.1chrIII:2063331-2063341AAAGCGATAA+4.02
blmp-1MA0537.1chrIII:2062808-2062818AAAAAGAAGA+4.07
blmp-1MA0537.1chrIII:2063567-2063577TTTCCTTTTC-4.64
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrIII:2063046-2063059TTGTCATCCTTTA+4.25
ceh-22MA0264.1chrIII:2062841-2062851TTTAAGTAGC-3.75
ces-2MA0922.1chrIII:2062919-2062927TTACTCAA+3.17
che-1MA0260.1chrIII:2063787-2063792GTTTC-3.06
daf-12MA0538.1chrIII:2063720-2063734TATGTGTTTTTTTT+3.82
elt-3MA0542.1chrIII:2063803-2063810TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrIII:2063530-2063537GCTAAGA-3.45
elt-3MA0542.1chrIII:2063202-2063209TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:2063768-2063775TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrIII:2063485-2063492CTTATCA+4.05
eor-1MA0543.1chrIII:2062806-2062820AAAAAAAGAAGAAT+3.2
fkh-2MA0920.1chrIII:2062937-2062944TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrIII:2062799-2062806TGTTTAA-3.16
fkh-2MA0920.1chrIII:2063705-2063712TATTTAC-3.21
fkh-2MA0920.1chrIII:2062820-2062827TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrIII:2063434-2063441TTTTTAT-3.3
hlh-1MA0545.1chrIII:2062793-2062803AGCATCTGTT+3.36
hlh-1MA0545.1chrIII:2063017-2063027ACATCTGTCC-3.47
hlh-1MA0545.1chrIII:2062794-2062804GCATCTGTTT-3.85
lim-4MA0923.1chrIII:2063816-2063824TCATTACT-3.03
lin-14MA0261.1chrIII:2063778-2063783TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrIII:2062873-2062878AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrIII:2063618-2063623TGTTC-3.62
pal-1MA0924.1chrIII:2063886-2063893TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrIII:2063550-2063557TTATTTC-3.12
pal-1MA0924.1chrIII:2063056-2063063TTATTCC-3.15
pal-1MA0924.1chrIII:2063816-2063823TCATTAC-3.17
pal-1MA0924.1chrIII:2063107-2063114CAATAAA+4.12
pal-1MA0924.1chrIII:2062940-2062947TTATTGC-4.12
pha-4MA0546.1chrIII:2063706-2063715ATTTACATA-4.34
skn-1MA0547.1chrIII:2062809-2062823AAAAGAAGAATTTT+3.7
skn-1MA0547.1chrIII:2063111-2063125AAAGGTTGACAATT+4.42
skn-1MA0547.1chrIII:2063045-2063059ATTGTCATCCTTTA-5.68
snpc-4MA0544.1chrIII:2063163-2063174GCGGCCAACAT-4.89
unc-62MA0918.1chrIII:2063115-2063126GTTGACAATTT-3.06
unc-62MA0918.1chrIII:2063532-2063543TAAGACATTTC-3.11
unc-62MA0918.1chrIII:2063044-2063055AATTGTCATCC+3.32
unc-86MA0926.1chrIII:2063103-2063110TATGCAA+3.11
unc-86MA0926.1chrIII:2063873-2063880TATGCAC+3.18
unc-86MA0926.1chrIII:2063841-2063848TATGCAG+3.27
unc-86MA0926.1chrIII:2062762-2062769TTCCTAA-3.37
unc-86MA0926.1chrIII:2063832-2063839TTCCTAT-3.51
vab-7MA0927.1chrIII:2063816-2063823TCATTAC-3.29
zfh-2MA0928.1chrIII:2063733-2063743TTTAATTTAT+3.07
zfh-2MA0928.1chrIII:2063881-2063891AAAATTAATT-3.16
zfh-2MA0928.1chrIII:2063884-2063894ATTAATTTCT+3.2
Enhancer Sequence
TTTTAAAAAA TTCCTAAAAA TTCAAGTTTT GGAAAAAAGT GAGCATCTGT TTAAAAAAAA 60
AGAAGAATTT TTTATATTAA AAACATTTTT TTAAGTAGCA CTAACGGTTG GGGCGATTTT 120
GAACATAGGC CCAAAATAGT CTTAAATGGA CGAATTTCAA AATGAAATTA CTCAAAATTT 180
TTTAATTTTT ATTGCGGTTC AAAAGTTTCG AAAAAATTGC ACCGATTTTA GCTGAAATCT 240
AGAATTTTGG CCGCTTTTTC GTGTCACATC TGTCCGAAGT GGACTTTTTT GAAATTGTCA 300
TCCTTTATTC CATATTTTGG TAGTTAAACT TTGTTAGTTA AACTACAAAA ATATGCAATA 360
AAGGTTGACA ATTTCAAAAA AGTCAACTTC GGATAGATGT GACACGAAAA AGCGGCCAAC 420
ATTCTAGATT TTAGCTAACA TCAGCGTAAT TTTTTCAAAA TTTTGAACCG CCACAACAAA 480
AATTTTTTTT TTTTTGAGAA GTTGTTCGGT TACGTTCAAA ATCGTCCGAA CCGTTAGTCC 540
TCCTTTAAGA ACTTTTGAAA AATTTTCTTA ACTTTTTGAA AAGCGATAAA TTTTCGAAAA 600
TCTTTTTTTT TAGTTTCAGA AAATTTAACG AACTTGTCCA AAAATCTGCT ATCAATCTCT 660
AAAACAAAAA ATTTACAGGA ATTTTTTATT CTTATTCTTA AATTACTCCT ATGTCTTGGC 720
ATGTGCAATT CTCCTTATCA TGGCTCAAGT CTATCACTGT CTAACATTTC TCCTCGCTGC 780
TAAGACATTT CTGCAGTTTT ATTTCCCCAC AAAGTTTTCC TTTTCGCAGA GTTACATTTA 840
CAAGCATCTA TTTTACATTT ACCTGGTGTT CACCTTAAAA GAGTTGGCAT TTCTAATTCT 900
ATACTCACTG TATGAGATAA ACGACTTTGT CACAAAAATG AATCCTTACA TTTTATTTAC 960
ATATGCGGTA TGTGTTTTTT TTTTAATTTA TAATATAGAA TATTGAGCTA TAATTTTTTT 1020
TCAAGCTGTT CCACCGTTTC TTCAATATAC TTTTGTCAAA CCTTTCATTA CTTTTCTATA 1080
TTCCTATAAT ATGCAGTTTA CAACGAGCGG AACAACAGGG ATATGCACAA AAATTAATTT 1140
CT 1142