EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01365 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrII:15041549-15042066 
TF binding sites/motifs
Number: 33             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrII:15041908-15041918TATCATTCCT-3.19
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrII:15041927-15041940TTGTGATAGTTTA+4.02
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrII:15042030-15042043AAACTATCACAAT-4.02
ceh-22MA0264.1chrII:15041678-15041688CTACTTGATG+3.4
ceh-22MA0264.1chrII:15041617-15041627ACACTCGAAA+3.86
ceh-22MA0264.1chrII:15041964-15041974GTACTTTAAA+3
ceh-48MA0921.1chrII:15041586-15041594TATTGAGT-3.03
ces-2MA0922.1chrII:15042024-15042032TAAGGTAA+3.08
ces-2MA0922.1chrII:15041575-15041583TTATGTAA+3.39
ces-2MA0922.1chrII:15041757-15041765TTTCGTAA+3.46
ces-2MA0922.1chrII:15042019-15042027TTAAATAA+3.54
ces-2MA0922.1chrII:15041758-15041766TTCGTAAT-3.55
ces-2MA0922.1chrII:15041576-15041584TATGTAAT-4.87
elt-3MA0542.1chrII:15041841-15041848GCTAAAA-3.07
fkh-2MA0920.1chrII:15041888-15041895TGTTGAT-3.51
lim-4MA0923.1chrII:15041761-15041769GTAATGAA+3.04
lim-4MA0923.1chrII:15041579-15041587GTAATTAT+3.22
lin-14MA0261.1chrII:15041881-15041886TGTTC-3.01
mab-3MA0262.1chrII:15041854-15041866TTTTTGCCAACT+3.62
pal-1MA0924.1chrII:15041947-15041954TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrII:15041762-15041769TAATGAA+3.17
pal-1MA0924.1chrII:15041580-15041587TAATTAT-3.33
pha-4MA0546.1chrII:15041889-15041898GTTGATTTT-3.64
pha-4MA0546.1chrII:15041655-15041664ATGCCAATA+3.89
sma-4MA0925.1chrII:15041603-15041613GTTTCTAGTA+3.07
unc-86MA0926.1chrII:15041921-15041928TGCATAT-3.11
vab-7MA0927.1chrII:15041580-15041587TAATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrII:15041762-15041769TAATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrII:15041580-15041587TAATTAT-3.6
zfh-2MA0928.1chrII:15042015-15042025AAAATTAAAT-3.04
zfh-2MA0928.1chrII:15041945-15041955TTTAATTTCG+3.07
zfh-2MA0928.1chrII:15041578-15041588TGTAATTATA+3.26
zfh-2MA0928.1chrII:15041579-15041589GTAATTATAT-3.26
Enhancer Sequence
AGAAATACGG TAACTATTAG TAAGAGTTAT GTAATTATAT TGAGTTTTGT TGTAGTTTCT 60
AGTAACATAC ACTCGAAAAG ATCTCTGGAA ATTAGTATTA CATGCTATGC CAATAGAGAA 120
AATTAAATGC TACTTGATGT CTTAAAGGAG GACTAACGGT TCGGACGATT TTGAACGTAT 180
AGCTCCAAAA TGGGCTCAAT TGAACAAATT TCGTAATGAA ACTTCTCAAA AAATTTTCAA 240
AAATTTTTGT ATGGCGGTTC AAAATTTCGA AAAAAAAACT ACACTGATTT TTGCTAAAAT 300
CCCAATTTTT GCCAACTTTT CTGTGTTGCA GCTGTTCGAT GTTGATTTTT TTTTGGAATT 360
ATCATTCCTT ATTGCATATT GTGATAGTTT ATCTCATTTA ATTTCGTCGA TTAAGGTACT 420
TTAAAAACCG GTAACCTATC AGTTTTAAAA GTAGTACTTA ATCGACAAAA TTAAATAAGG 480
TAAACTATCA CAATATGCTG CTATAAGGGA TGATAAT 517