EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01260 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrII:13441274-13442089 
TF binding sites/motifs
Number: 38             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrII:13441882-13441892GAGGGGAGAT+3.03
blmp-1MA0537.1chrII:13442013-13442023CTTCGCCTCC-3.06
blmp-1MA0537.1chrII:13441455-13441465AAGAAGAAGG+3.4
blmp-1MA0537.1chrII:13441447-13441457AAGTCGAAAA+3.51
ceh-22MA0264.1chrII:13441707-13441717TTCGATTGGT-3.38
ceh-22MA0264.1chrII:13441877-13441887TTGAAGAGGG-3.47
ceh-48MA0921.1chrII:13441793-13441801TATCGACG-3.05
ceh-48MA0921.1chrII:13441551-13441559TATTGGTC-3.84
ces-2MA0922.1chrII:13441538-13441546TTGCACAA+3.01
ces-2MA0922.1chrII:13442037-13442045ATATATAA+3.12
ces-2MA0922.1chrII:13441561-13441569AACATAAT-3.19
ces-2MA0922.1chrII:13441990-13441998TTATGTAA+3.39
ces-2MA0922.1chrII:13441560-13441568TAACATAA+4.27
ces-2MA0922.1chrII:13441991-13441999TATGTAAT-4.87
che-1MA0260.1chrII:13441275-13441280GCTTC-3.7
che-1MA0260.1chrII:13441435-13441440GCTTC-3.7
eor-1MA0543.1chrII:13442011-13442025GTCTTCGCCTCCTT-4.27
eor-1MA0543.1chrII:13441453-13441467AAAAGAAGAAGGAA+4
fkh-2MA0920.1chrII:13442050-13442057TGTATAT-3.12
fkh-2MA0920.1chrII:13441961-13441968TGTATAC-3.24
hlh-1MA0545.1chrII:13441515-13441525TCAAATGCTC-3.07
hlh-1MA0545.1chrII:13441388-13441398GGCACCTGCC+3.36
hlh-1MA0545.1chrII:13441389-13441399GCACCTGCCG-3.55
lin-14MA0261.1chrII:13441607-13441612AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrII:13441760-13441765AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrII:13441890-13441902ATGTTGGGTATC+3.53
pal-1MA0924.1chrII:13441557-13441564TCATAAC+3.4
pal-1MA0924.1chrII:13441998-13442005TAATAAA+3.63
pha-4MA0546.1chrII:13441288-13441297GTCTACTTA-3.08
sma-4MA0925.1chrII:13441689-13441699GATAGACATC-3.41
unc-62MA0918.1chrII:13442059-13442070ATATGTCATAA+3.06
unc-62MA0918.1chrII:13441284-13441295ACATGTCTACT+3.19
unc-62MA0918.1chrII:13441332-13441343ACATGTCTACT+3.19
unc-86MA0926.1chrII:13442048-13442055TATGTAT+3.06
unc-86MA0926.1chrII:13442050-13442057TGTATAT-3.07
unc-86MA0926.1chrII:13441281-13441288TGCACAT-3.18
unc-86MA0926.1chrII:13441509-13441516TGCGTAT-3.29
vab-7MA0927.1chrII:13441951-13441958TCATTAT+3.19
Enhancer Sequence
GGCTTCATGC ACATGTCTAC TTAGAAGAAA AGACCTCTGA GGTATTGTTT TGATCTACAC 60
ATGTCTACTG GAAAGAAAAG ACCTCTGAGG TGGATCAGGT CAGCTTTGGG AAGAGGCACC 120
TGCCGTGCTC TCTGCAGTTG CAGTCAAGGT GGACAGGAGC GGCTTCTGGA TTGAAGTCGA 180
AAAGAAGAAG GAATCATTGC TCAACTCTTT TGAAGATGCG AGTGAAGGCC ACCTATGCGT 240
ATCAAATGCT CAGTCATTGG ACGATTGCAC AAATTGTTAT TGGTCATAAC ATAATCCACA 300
ACCAGGAACT GAGATACAAC AGGTTGATGG TGGAACAGGC GGAATCAGTG TGGATGATTC 360
AAGGTTGGGT CTAATATTCA GGCAGCAACG TTTTTTAGTC TGTTGGTGAA GGTTGGATAG 420
ACATCAAAAA TATTTCGATT GGTACGGGAA GTGTGGCTAA CTTGGAACCC GCAATTGGAG 480
GATGTGAACA CCGAAGTACC GTGTGCAAAG GATTGGCAAT ATCGACGGTC ACACTGGAGG 540
GTGGTCCGTG AGAACCTCAG AAGACATTCG TGGATGGCTC CTCACCAAAG CTCTCGTTTG 600
TCATTGAAGA GGGGAGATGT TGGGTATCTA CGTGTACCTA ACCCTTAACG TGGATATGAA 660
GATCGTGTAA CGTGAACTCA TTATCTATGT ATACTAACTT TCTATTCATT CCTTAGTTAT 720
GTAATAATAA ACTACTCGTC TTCGCCTCCT TGTTCGGCCT CGAATATATA ACAATATGTA 780
TATATATATG TCATAATGTA TGTATTCAAA AAACA 815