EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01247 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrII:13259236-13259892 
TF binding sites/motifs
Number: 52             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrII:13259624-13259634ATTCAATTTT-3.04
blmp-1MA0537.1chrII:13259788-13259798ATTCAATTTT-3.04
blmp-1MA0537.1chrII:13259357-13259367TTTCCCTCTT-3.66
blmp-1MA0537.1chrII:13259511-13259521AGAGAGAGGG+3.74
blmp-1MA0537.1chrII:13259505-13259515GGAGAGAGAG+3.75
blmp-1MA0537.1chrII:13259646-13259656TATCTTTTTT-4.01
blmp-1MA0537.1chrII:13259810-13259820TATCTTTTTT-4.01
blmp-1MA0537.1chrII:13259507-13259517AGAGAGAGAG+4.43
blmp-1MA0537.1chrII:13259509-13259519AGAGAGAGAG+4.43
ceh-48MA0921.1chrII:13259733-13259741ATCAATTC+3.03
ceh-48MA0921.1chrII:13259533-13259541ATCGATAC+4.35
ces-2MA0922.1chrII:13259472-13259480CACATAAT-3.27
ces-2MA0922.1chrII:13259604-13259612TAAGTAAT-3.85
ces-2MA0922.1chrII:13259767-13259775TAAGTAAT-3.85
ces-2MA0922.1chrII:13259418-13259426TGTATAAT-4.13
daf-12MA0538.1chrII:13259878-13259892TAAGTGTGTGTTGT+4.27
dsc-1MA0919.1chrII:13259702-13259711GTAATTATT+3.21
dsc-1MA0919.1chrII:13259867-13259876GTAATTATT+3.21
dsc-1MA0919.1chrII:13259702-13259711GTAATTATT-3.21
dsc-1MA0919.1chrII:13259867-13259876GTAATTATT-3.21
efl-1MA0541.1chrII:13259775-13259789ATCCGCGGAAAAAA+3.93
efl-1MA0541.1chrII:13259612-13259626ATCCGCGGAAAAAT+4.32
elt-3MA0542.1chrII:13259376-13259383TTTATCC+3.02
elt-3MA0542.1chrII:13259675-13259682GATAGAA-3.02
eor-1MA0543.1chrII:13259356-13259370ATTTCCCTCTTTTT-3.6
eor-1MA0543.1chrII:13259510-13259524GAGAGAGAGGGACC+3.76
eor-1MA0543.1chrII:13259508-13259522GAGAGAGAGAGGGA+5.64
eor-1MA0543.1chrII:13259504-13259518GGGAGAGAGAGAGA+6.26
eor-1MA0543.1chrII:13259506-13259520GAGAGAGAGAGAGG+6.28
fkh-2MA0920.1chrII:13259872-13259879TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrII:13259365-13259372TTTTTAC-3.09
fkh-2MA0920.1chrII:13259717-13259724TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrII:13259657-13259664TAAACAT+3.28
lim-4MA0923.1chrII:13259713-13259721TAATTGTT-3.28
lim-4MA0923.1chrII:13259702-13259710GTAATTAT+3.42
lim-4MA0923.1chrII:13259867-13259875GTAATTAT+3.42
pal-1MA0924.1chrII:13259703-13259710TAATTAT-3.33
pal-1MA0924.1chrII:13259868-13259875TAATTAT-3.33
pal-1MA0924.1chrII:13259713-13259720TAATTGT-3.42
pal-1MA0924.1chrII:13259339-13259346TTATTGT-3.46
pal-1MA0924.1chrII:13259422-13259429TAATAAA+3.63
pha-4MA0546.1chrII:13259422-13259431TAATAAATA+3.32
unc-62MA0918.1chrII:13259265-13259276AATGACACCTT-3.49
vab-7MA0927.1chrII:13259703-13259710TAATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrII:13259868-13259875TAATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrII:13259713-13259720TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrII:13259703-13259710TAATTAT-3.6
vab-7MA0927.1chrII:13259868-13259875TAATTAT-3.6
zfh-2MA0928.1chrII:13259701-13259711CGTAATTATT+3.3
zfh-2MA0928.1chrII:13259866-13259876CGTAATTATT+3.3
zfh-2MA0928.1chrII:13259702-13259712GTAATTATTT-3.45
zfh-2MA0928.1chrII:13259867-13259877GTAATTATTT-3.45
Enhancer Sequence
AATAACCGTT TTGTACCATC CTTAGTCTAA ATGACACCTT ATACCATCAT ATTCGTCTGC 60
AGAGGGTTTA ACACCATCTA TTGAGAACCT TTAATACCAT CCTTTATTGT TCTTGAATGT 120
ATTTCCCTCT TTTTACTTGT TTTATCCTAT TTAGAGTCCT GCTCTACCCA CACGGGAGAG 180
GTTGTATAAT AAATAGGTTT TTGAGTATTA CTTTGTTCGT ATTACACCGC TTATCTCACA 240
TAATTCAGAT GCTTTACTGG GACACACGGG GAGAGAGAGA GAGGGACCGG AGACGTGATC 300
GATACCGACT ACTACCATCC TACACGGCCT CCACATCAAT TCTAAAAAAC AGATTTTTTT 360
CGAAAGTTTA AGTAATATCC GCGGAAAAAT TCAATTTTGG ACATTTCTAT TATCTTTTTT 420
TTAAACATGT ATTTCAGTTG ATAGAAGACT CAAAATTATA ATGCTCGTAA TTATTTTTAA 480
TTGTTTTTTG TCTTAGAATC AATTCTAAAA AACAGATTTT TTTCGAAAGT TTAAGTAATA 540
TCCGCGGAAA AAATTCAATT TTGGACATTT CTATTATCTT TTTTTTAAAA CATGTATTTC 600
AGTGAATAGA AGACTCAAAA TTATAATGCT CGTAATTATT TATAAGTGTG TGTTGT 656