EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01141 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrII:11169722-11170205 
TF binding sites/motifs
Number: 30             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ceh-48MA0921.1chrII:11169773-11169781TTCGATAA+3.2
dsc-1MA0919.1chrII:11169985-11169994TTAATTATT+3.62
dsc-1MA0919.1chrII:11169985-11169994TTAATTATT-3.62
dsc-1MA0919.1chrII:11169981-11169990TTAATTAAT+3.84
dsc-1MA0919.1chrII:11169981-11169990TTAATTAAT-3.84
elt-3MA0542.1chrII:11170120-11170127CTCATCA+3.35
elt-3MA0542.1chrII:11170137-11170144CTTATCA+3.75
elt-3MA0542.1chrII:11169876-11169883TTTATCT+3
elt-3MA0542.1chrII:11170179-11170186TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrII:11170189-11170196GATAAAA-4.31
eor-1MA0543.1chrII:11169749-11169763CTCTACGGCTCTAG-3.5
fkh-2MA0920.1chrII:11169874-11169881TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrII:11169968-11169975TAAACAC+3.95
hlh-1MA0545.1chrII:11169970-11169980AACACATGAT+3.18
lim-4MA0923.1chrII:11169985-11169993TTAATTAT+3.12
lim-4MA0923.1chrII:11169986-11169994TAATTATT-3.57
lim-4MA0923.1chrII:11169981-11169989TTAATTAA+3.59
lim-4MA0923.1chrII:11169982-11169990TAATTAAT-3.75
lin-14MA0261.1chrII:11170007-11170012TGTTC-3.14
pal-1MA0924.1chrII:11169986-11169993TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrII:11169965-11169974AGATAAACA+3.62
skn-1MA0547.1chrII:11170117-11170131ATTCTCATCATGCA-3.86
unc-86MA0926.1chrII:11170112-11170119TATGGAT+3.14
vab-7MA0927.1chrII:11169982-11169989TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrII:11169982-11169989TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrII:11169986-11169993TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrII:11169985-11169995TTAATTATTA-3.46
zfh-2MA0928.1chrII:11169980-11169990TTTAATTAAT+3.84
zfh-2MA0928.1chrII:11169984-11169994ATTAATTATT+4.07
zfh-2MA0928.1chrII:11169981-11169991TTAATTAATT-4.38
Enhancer Sequence
ATAAGGAACC ATCAGGTTCT TCCTACCCTC TACGGCTCTA GATACCTCAA CTTCGATAAC 60
TCCTATCTAC TCGGAGAGGC GAGATATGAA AAAGTGATCA ACTGAAAACT TGTAGAGCAC 120
ATCAAAAACT ATGATATTCA ATTTAACCTA CGTTTTTATC TTTCAAGATG GGGGAGTTAG 180
ACTTACATTT GTACTGCACA CTTTTTGTTA TTCTACTGGC TGCTCTAACT CCCTCATCTT 240
GAAAGATAAA CACATGATTT TAATTAATTA TTATAGTTTT TAATATGTTC TACAATTTCT 300
TAGTGAATCA CTTTTTGATA TCTTGCCTCT CTGAGGAGAT AGGAGTTGTC GAAGTTACAG 360
TATCTATAGC TATGCGCATA TGAAGAATCA TATGGATTCT CATCATGCAA TACTACTTAT 420
CATCTGATTT TTGTGAGGAA CAATGATTCA AAACTGTTTT TTCAAATGAT AAAACAAGTT 480
TTG 483