EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01117 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrII:10205740-10206443 
TF binding sites/motifs
Number: 46             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrII:10205816-10205826ACTCGTTTTC-3.24
blmp-1MA0537.1chrII:10206229-10206239AAAATGAGTA+3.46
ceh-22MA0264.1chrII:10206212-10206222CCTCTTGACT+3.82
ceh-48MA0921.1chrII:10205763-10205771ATCAATAA+4.21
ceh-48MA0921.1chrII:10205932-10205940TATTGATT-4.21
ces-2MA0922.1chrII:10205754-10205762GAACGTAA+3.01
ces-2MA0922.1chrII:10205941-10205949TACGTTCT-3.01
dsc-1MA0919.1chrII:10206088-10206097CTAATTGTT+3.09
dsc-1MA0919.1chrII:10206088-10206097CTAATTGTT-3.09
elt-3MA0542.1chrII:10206046-10206053CCTATCA+3.35
elt-3MA0542.1chrII:10205960-10205967TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrII:10205742-10205756AAAAGTGACAAAGA+3.29
eor-1MA0543.1chrII:10205947-10205961CTTTGTCACTTTTT-3.29
eor-1MA0543.1chrII:10205744-10205758AAGTGACAAAGAAC+3.53
eor-1MA0543.1chrII:10205945-10205959TTCTTTGTCACTTT-3.53
fkh-2MA0920.1chrII:10206409-10206416TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrII:10205980-10205987TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrII:10206135-10206142TGTATAC-3.24
fkh-2MA0920.1chrII:10206008-10206015TGTTGAT-3.51
lim-4MA0923.1chrII:10205973-10205981TAATTGTT-3.28
lim-4MA0923.1chrII:10206089-10206097TAATTGTT-3.2
lin-14MA0261.1chrII:10205844-10205849AACAT+3.14
mab-3MA0262.1chrII:10206104-10206116ATGTTGTGTACA+3.63
mab-3MA0262.1chrII:10206024-10206036ATGTTGCCCAGC+3.82
mab-3MA0262.1chrII:10205995-10206007TTGTTGCTATTA+4.24
mab-3MA0262.1chrII:10205986-10205998TTGTTGCCATTG+4.43
pal-1MA0924.1chrII:10205973-10205980TAATTGT-3.42
pha-4MA0546.1chrII:10206234-10206243GAGTAGACA+3.1
pha-4MA0546.1chrII:10206126-10206135TTGTAAATA+3.54
pha-4MA0546.1chrII:10205761-10205770AAATCAATA+3.55
pha-4MA0546.1chrII:10205933-10205942ATTGATTTT-3.55
pha-4MA0546.1chrII:10206109-10206118GTGTACATA-3
skn-1MA0547.1chrII:10206008-10206022TGTTGATGAATAAT+3.82
sma-4MA0925.1chrII:10205860-10205870ATCAGACATG-3.06
sma-4MA0925.1chrII:10205869-10205879GTCAGACAAG-3.15
snpc-4MA0544.1chrII:10206366-10206377TGTAGGTCGCC+4.35
unc-62MA0918.1chrII:10205861-10205872TCAGACATGTC-3.53
unc-62MA0918.1chrII:10205865-10205876ACATGTCAGAC+4.37
unc-86MA0926.1chrII:10206133-10206140TATGTAT+3.06
unc-86MA0926.1chrII:10206056-10206063TTAATAT-3.47
unc-86MA0926.1chrII:10206014-10206021TGAATAA-3.58
vab-7MA0927.1chrII:10206290-10206297CAATGAG-3.09
vab-7MA0927.1chrII:10205973-10205980TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrII:10206018-10206025TAATGAA+3.35
zfh-2MA0928.1chrII:10206062-10206072TAAATTAAAA-3.07
zfh-2MA0928.1chrII:10206052-10206062AAAATTAATA-3.12
Enhancer Sequence
AAAAAAGTGA CAAAGAACGT AAAATCAATA ACAATGAAAT TTGGCATAAG AAATTCATTC 60
GGAGTCGAAG TCAATCACTC GTTTTCTGCT TTTGAGTATA TAGGAACATG ACGCCGTAGT 120
ATCAGACATG TCAGACAAGG TTGCACTGGA GTTGATGACT CCGAATGAAT TTCTTATGCC 180
AAATTTCATT GTTATTGATT TTACGTTCTT TGTCACTTTT TTTTTCAAAT TTTTAATTGT 240
TGTTTTTTGT TGCCATTGTT GCTATTAATG TTGATGAATA ATGAATGTTG CCCAGCCTTT 300
TCGTGTCCTA TCAAAATTAA TATAAATTAA AACATGACTC AGCTACTACT AATTGTTGCC 360
CGAAATGTTG TGTACATATT GAAAGATTGT AAATATGTAT ACCCTTTGAA TGAATGAACA 420
AATTGAGTAG ATGTACCTTT GGTGTATTCT TGGAATACGG TCCTTGTACG TGCCTCTTGA 480
CTGATGAAGA AAATGAGTAG ACAATGAGCA AGGGTAGGCA ATGAGAATAG GTAGTCAATG 540
ATTTTGGAGT CAATGAGTAT TTGCCACAAT TTACTTGTTC AAGGATTTAG CTCTTTCGTG 600
TAGAGGTTAA AACTTTAAGG CCGAAGTGTA GGTCGCCTAA AATGCAGGCG ATAAGTTGTG 660
TGCCTACAAT GTTTTCGTTT GTCTCGAATT GTGTTTTTTC CAT 703