EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-01097 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrII:9567407-9567836 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrII:9567814-9567824TATCTCTTTT-3.64
blmp-1MA0537.1chrII:9567435-9567445TTTCACTTTC-4.33
blmp-1MA0537.1chrII:9567566-9567576TTTCAATTTT-4.82
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrII:9567494-9567507TTGGACACCTTAA+4.4
ceh-48MA0921.1chrII:9567478-9567486ATCAATAT+3.21
ceh-48MA0921.1chrII:9567765-9567773ATCAATAA+4.21
ces-2MA0922.1chrII:9567759-9567767TACAAAAT-3.19
ces-2MA0922.1chrII:9567758-9567766TTACAAAA+3.45
daf-12MA0538.1chrII:9567460-9567474AAGCAAACATATTT-3.09
dsc-1MA0919.1chrII:9567592-9567601TTAATTTGC+3.19
dsc-1MA0919.1chrII:9567592-9567601TTAATTTGC-3.19
elt-3MA0542.1chrII:9567777-9567784GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrII:9567475-9567482CTTATCA+3.71
fkh-2MA0920.1chrII:9567619-9567626TAAACAG+3.16
fkh-2MA0920.1chrII:9567660-9567667TGTTGAT-3.51
fkh-2MA0920.1chrII:9567770-9567777TAAACAT+3.81
pal-1MA0924.1chrII:9567748-9567755AAATAAA+3.12
pha-4MA0546.1chrII:9567763-9567772AAATCAATA+3.55
pha-4MA0546.1chrII:9567460-9567469AAGCAAACA+4.16
pha-4MA0546.1chrII:9567470-9567479ATTTGCTTA-4.37
sma-4MA0925.1chrII:9567607-9567617GTGTCTAGAT+4.12
unc-86MA0926.1chrII:9567590-9567597TATTAAT+3.35
zfh-2MA0928.1chrII:9567591-9567601ATTAATTTGC+3.44
Enhancer Sequence
CTGATTCAAA CATATAGCTA CTAAAGTATT TCACTTTCAA ACACTATATC TACAAGCAAA 60
CATATTTGCT TATCAATATC AGCCATATTG GACACCTTAA AAACATATCC CATCTTCAAA 120
CTCTCACGAT GGCTGAAGAA AAAAAAATTT TTTTTAATTT TTCAATTTTT TTTTAAGTTT 180
AGGTATTAAT TTGCTTTGAT GTGTCTAGAT ATTAAACAGC TATTTGATAT TTTCATACAT 240
TCTTGTTGTC GCATGTTGAT GATGCTCAAT CTCAAAAAAG GCTAGGAAAA GTTATTTTTA 300
AATTTGACCG GCGCTCACTT AAGAAACTTA AAAGTTAGAA GAAATAAAAC ATTACAAAAT 360
CAATAAACAT GTTAAAAGCT ACATTTCTTC AGTTAACCAT TTTCATGTAT CTCTTTTCGT 420
TGCTGAGCT 429