EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00916 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrII:3589850-3590451 
TF binding sites/motifs
Number: 58             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrII:3589976-3589986AAAACGAGGT+3.19
blmp-1MA0537.1chrII:3589925-3589935ATTCTTTTTT-3.53
blmp-1MA0537.1chrII:3590179-3590189TTTCTTCTTT-3.91
blmp-1MA0537.1chrII:3590430-3590440CTTCAATTTT-3.97
blmp-1MA0537.1chrII:3590173-3590183TTTCTTTTTC-4.91
ceh-22MA0264.1chrII:3590235-3590245TTCAATTAGT-3.15
ceh-48MA0921.1chrII:3589989-3589997TATTGAAT-3.27
dsc-1MA0919.1chrII:3590236-3590245TCAATTAGT+3.29
dsc-1MA0919.1chrII:3590236-3590245TCAATTAGT-3.29
dsc-1MA0919.1chrII:3590157-3590166TTAATTAAA+3.84
dsc-1MA0919.1chrII:3590157-3590166TTAATTAAA-3.84
elt-3MA0542.1chrII:3590292-3590299TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrII:3589970-3589977GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrII:3590418-3590432GTTTCAGTTTTTCT-3.25
eor-1MA0543.1chrII:3589934-3589948TCCTGTTTTTCTGG-3.46
eor-1MA0543.1chrII:3590185-3590199CTTTGTTTTTTTTT-3.59
eor-1MA0543.1chrII:3590183-3590197TTCTTTGTTTTTTT-3.61
eor-1MA0543.1chrII:3590168-3590182TTTTTTTTCTTTTT-3.64
eor-1MA0543.1chrII:3590172-3590186TTTTCTTTTTCTTC-3.82
eor-1MA0543.1chrII:3590174-3590188TTCTTTTTCTTCTT-4.06
eor-1MA0543.1chrII:3589856-3589870TAAAAACAAAGAGA+4.23
eor-1MA0543.1chrII:3589896-3589910CTCTGTGACTCCTT-4.61
fkh-2MA0920.1chrII:3589858-3589865AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrII:3590188-3590195TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrII:3589856-3589863TAAAAAC+3.26
fkh-2MA0920.1chrII:3590125-3590132TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrII:3590373-3590380TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrII:3590107-3590114TAAAAAA+3.4
lim-4MA0923.1chrII:3590236-3590244TCAATTAG+3.22
lim-4MA0923.1chrII:3590153-3590161ACAATTAA+3.28
lim-4MA0923.1chrII:3590158-3590166TAATTAAA-3.59
lim-4MA0923.1chrII:3590157-3590165TTAATTAA+3.75
lin-14MA0261.1chrII:3590315-3590320TGTTC-3.14
mab-3MA0262.1chrII:3590200-3590212ATTTGAAACATA-3.59
mab-3MA0262.1chrII:3590146-3590158TTTTGAAACAAT-3.63
pal-1MA0924.1chrII:3590128-3590135TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrII:3590154-3590161CAATTAA+3.42
pha-4MA0546.1chrII:3590059-3590068TTTTGCTCT-3.24
pha-4MA0546.1chrII:3590104-3590113ATGTAAAAA+3.2
pha-4MA0546.1chrII:3590294-3590303TAACAAACA+3.32
pha-4MA0546.1chrII:3590021-3590030ATTTATTTG-3.49
skn-1MA0547.1chrII:3590425-3590439TTTTTCTTCAATTT-4.17
sma-4MA0925.1chrII:3589940-3589950TTTTCTGGTT+3.18
sma-4MA0925.1chrII:3590224-3590234TTCAGACATA-3.24
unc-62MA0918.1chrII:3590262-3590273AAATGTCAAAG+3.22
unc-62MA0918.1chrII:3590347-3590358CGTGACACGTG-3.27
vab-7MA0927.1chrII:3590154-3590161CAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrII:3590158-3590165TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrII:3590158-3590165TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrII:3590237-3590244CAATTAG-3.6
zfh-2MA0928.1chrII:3589992-3590002TGAATTAAAA-3.11
zfh-2MA0928.1chrII:3590236-3590246TCAATTAGTT-3.16
zfh-2MA0928.1chrII:3590153-3590163ACAATTAATT-3.19
zfh-2MA0928.1chrII:3590322-3590332AGAATTAATT-3.19
zfh-2MA0928.1chrII:3590325-3590335ATTAATTCAT+3.31
zfh-2MA0928.1chrII:3590196-3590206TTTAATTTGA+3.3
zfh-2MA0928.1chrII:3590157-3590167TTAATTAAAA-3.84
zfh-2MA0928.1chrII:3590156-3590166ATTAATTAAA+4.38
Enhancer Sequence
AATGCGTAAA AACAAAGAGA CCGGACACTC CCTAGGCCAT TCGGTTCTCT GTGACTCCTT 60
GTGTTGGGGT CTTGTATTCT TTTTTCCTGT TTTTCTGGTT TTTAAAGTTC TGTGTGGTGT 120
GAAAAAAAAA CGAGGTAAGT ATTGAATTAA AAATGTACAT TTTTTAAAGC TATTTATTTG 180
ATACCTTTTA ATAGTTTTCT TTTGTGGGTT TTTGCTCTAA ATGGTAGAAT ACAGTCCCAA 240
TATACTGAAT ATAAATGTAA AAAAAAATTC TAAATTTTTT ATGATTTTTT AAAAAATTTT 300
GAAACAATTA ATTAAAATTT TTTTTTCTTT TTCTTCTTTG TTTTTTTTTA ATTTGAAACA 360
TAGTTTGTCA ATTTTTCAGA CATATTTCAA TTAGTTTCGC CGTAAAATGC GAAAATGTCA 420
AAGTGACTCA CGGTGTGGAT TTTTTAACAA ACAATCAAAA AAACATGTTC CAAGAATTAA 480
TTCATTCTTA ACCATTGCGT GACACGTGGC ATTTTTTTGA GTTTTTTTAT GGATTTCAGC 540
TGTTTTAAAT CAGCTAACTT TCAGCTTTGT TTCAGTTTTT CTTCAATTTT TTTTTTGGAT 600
T 601