EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00666 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:13941862-13942910 
TF binding sites/motifs
Number: 64             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:13941884-13941894CATCAATTTC-3.37
blmp-1MA0537.1chrI:13942389-13942399TTTCTCTTAC-3.49
blmp-1MA0537.1chrI:13942269-13942279AAATTGAAGA+3.93
blmp-1MA0537.1chrI:13942645-13942655GAAGCGAGAA+3.95
blmp-1MA0537.1chrI:13942200-13942210TTTCAATCAC-3
blmp-1MA0537.1chrI:13942568-13942578AAAAAGAAAC+4.04
blmp-1MA0537.1chrI:13942075-13942085AAATTGAAAG+4.7
ceh-22MA0264.1chrI:13941980-13941990ATAAAGTGGT-3.19
ceh-48MA0921.1chrI:13942437-13942445ATCAATTT+3.03
ceh-48MA0921.1chrI:13942025-13942033TATCGAAA-3.07
ces-2MA0922.1chrI:13942868-13942876TTACGAAA+3.55
ces-2MA0922.1chrI:13942349-13942357TTACGCAA+4.46
che-1MA0260.1chrI:13942646-13942651AAGCG+3.2
dpy-27MA0540.1chrI:13942175-13942190TTTGGCGCAGTGGGA-3.57
dsc-1MA0919.1chrI:13942552-13942561TTAATTAAA+3.84
dsc-1MA0919.1chrI:13942552-13942561TTAATTAAA-3.84
efl-1MA0541.1chrI:13942694-13942708ATCGGAGGGAAAAC+3.24
efl-1MA0541.1chrI:13942174-13942188TTTTGGCGCAGTGG-3.66
efl-1MA0541.1chrI:13941940-13941954ATTTTGCGTTCAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:13942243-13942257GTTTTTTTCTTGTT-3.26
eor-1MA0543.1chrI:13942191-13942205TTCCATGTCTTTCA-3.29
eor-1MA0543.1chrI:13942558-13942572AAAAGATGCAAAAA+3.57
eor-1MA0543.1chrI:13942390-13942404TTCTCTTACTCTGA-3.67
hlh-1MA0545.1chrI:13942117-13942127CCAACTGCTA-3.31
hlh-1MA0545.1chrI:13942456-13942466CACAAATGGC+3.38
hlh-1MA0545.1chrI:13942371-13942381CCAGTTGTGG-3.41
lim-4MA0923.1chrI:13942434-13942442CCAATCAA+3.01
lim-4MA0923.1chrI:13941920-13941928ACAATTAA+3.14
lim-4MA0923.1chrI:13941963-13941971ACAATTAA+3.28
lim-4MA0923.1chrI:13941925-13941933TAATTGTT-3.28
lim-4MA0923.1chrI:13942553-13942561TAATTAAA-3.59
lim-4MA0923.1chrI:13942552-13942560TTAATTAA+3.75
lin-14MA0261.1chrI:13942602-13942607AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:13942141-13942146AACGC+3.36
lin-14MA0261.1chrI:13941946-13941951CGTTC-3.36
mab-3MA0262.1chrI:13942450-13942462ATGTTGCACAAA+3.69
mab-3MA0262.1chrI:13941940-13941952ATTTTGCGTTCA+3.6
pal-1MA0924.1chrI:13942346-13942353CAATTAC+3.23
pal-1MA0924.1chrI:13942295-13942302TAATTGT-3.23
pal-1MA0924.1chrI:13941921-13941928CAATTAA+3.42
pal-1MA0924.1chrI:13941964-13941971CAATTAA+3.42
pal-1MA0924.1chrI:13941925-13941932TAATTGT-3.42
pal-1MA0924.1chrI:13942011-13942018TTATGGC-3.51
pha-4MA0546.1chrI:13942382-13942391ATATACTTT-3.02
pha-4MA0546.1chrI:13942625-13942634ATGTGAATA+3
skn-1MA0547.1chrI:13942747-13942761AAATCTTGAAAAAT+4.17
skn-1MA0547.1chrI:13942270-13942284AATTGAAGAAAAAT+4.55
skn-1MA0547.1chrI:13941879-13941893TTATTCATCAATTT-4.74
skn-1MA0547.1chrI:13942297-13942311ATTGTCAGCAATTT-5.8
sma-4MA0925.1chrI:13942813-13942823TCCAGAAAAA-3.46
sma-4MA0925.1chrI:13942290-13942300TCCAGTAATT-3
unc-62MA0918.1chrI:13942296-13942307AATTGTCAGCA+3.19
unc-86MA0926.1chrI:13941915-13941922TGCATAC-3.03
unc-86MA0926.1chrI:13942550-13942557TATTAAT+3.32
unc-86MA0926.1chrI:13941880-13941887TATTCAT+3.58
vab-7MA0927.1chrI:13941921-13941928CAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:13941964-13941971CAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:13942553-13942560TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:13941925-13941932TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrI:13942553-13942560TAATTAA-3.22
zfh-2MA0928.1chrI:13941923-13941933ATTAATTGTT+3.19
zfh-2MA0928.1chrI:13941920-13941930ACAATTAATT-3.19
zfh-2MA0928.1chrI:13942552-13942562TTAATTAAAA-3.84
zfh-2MA0928.1chrI:13942551-13942561ATTAATTAAA+4.22
Enhancer Sequence
CCATTTTTAA TTTTTCTTTA TTCATCAATT TCCTAATTTT ACCTGACCCC TACTGCATAC 60
AATTAATTGT TGTCTAAAAT TTTGCGTTCA AAGTATTGTT AACAATTAAA ATATATATAT 120
AAAGTGGTAT AAAGCATTTA CGAATTGTTT TATGGCACAC TAATATCGAA ATCTGACGAC 180
CTATGCGCCT ACAATTTCAT CCTGGTATCT CTGAAATTGA AAGCAAAAGA ACAAAACAGT 240
TGAAAAATCT ACCGCCCAAC TGCTATTGGG CCAGGGGAGA ACGCCGATAG GCGATCGCCA 300
AAATTTAGCG ATTTTTGGCG CAGTGGGATT TCCATGTCTT TCAATCACAC GACCGGGGCT 360
CAATTCCCAT TAGTGGTCTA TGTTTTTTTC TTGTTGAGAT TGCCTTGAAA TTGAAGAAAA 420
ATTCGATTTC CAGTAATTGT CAGCAATTTT GCACGAATGG CGCACTGGTA TTTTCCATGT 480
CTCACAATTA CGCAACCGGG GTTCGAGTCC CAGTTGTGGT ATATACTTTT CTCTTACTCT 540
GATTATCCTG AAAAACTAGA AAAATGCGAT TTCCAATCAA TTTGAGAAAT GTTGCACAAA 600
TGGCGCAGTG GGATTTTCCA TGTCTTCCAG TTACACGTCC GGGGTTCGAG CCCCCACTGT 660
GGCAAACGCT TTTTCAAAAC TCTGATTTTA TTAATTAAAA GATGCAAAAA AGAAACATAT 720
CACTTTGAAA TTGACAGAAG AACAGCAAAA TTGACCCATA GAAATGTGAA TAAACTGGTG 780
GAGGAAGCGA GAAGGGGGGG GGGGGGGGGG TATCTATGAA AAACTAGGAA AAATCGGAGG 840
GAAAACTTGA ATTTTTGCAA AAAATTGACC AATTTGGAGG TTTAAAAATC TTGAAAAATG 900
ACTGAAATCT AAAAAATGAG CTGAAAATTT CCAAAATAAT ATCGGAAATT TTCCAGAAAA 960
ATAAGGCGAA TTTACAGGAA AAATTCTGAA AAATTCCAAA AAAAAATTAC GAAAAAAATA 1020
TTTCGAAAAA ATCACTAAAA ATTCCAGA 1048