EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00431 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:9393315-9394443 
TF binding sites/motifs
Number: 87             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9394078-9394088AAGATGATGA+3.05
blmp-1MA0537.1chrI:9393901-9393911CCTCGATCTT-3.25
blmp-1MA0537.1chrI:9394011-9394021AAGAAGAAGA+3.39
blmp-1MA0537.1chrI:9393473-9393483AAAGGGAAGT+3.51
blmp-1MA0537.1chrI:9393550-9393560GAATAGAAAA+3.88
blmp-1MA0537.1chrI:9393585-9393595AAATAGAAAT+3.8
blmp-1MA0537.1chrI:9393343-9393353AAAAGGAAAA+4.7
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:9393732-9393745AAATTAAAATAAT-4.19
ceh-22MA0264.1chrI:9394036-9394046TTCAAGAAGA-3.43
ceh-48MA0921.1chrI:9393661-9393669ATCAATAC+3.21
ces-2MA0922.1chrI:9393995-9394003ATACGCAA+3.01
ces-2MA0922.1chrI:9394347-9394355TTAAACAA+3.04
ces-2MA0922.1chrI:9393316-9393324TTTCATAA+3.43
ces-2MA0922.1chrI:9394121-9394129TATGTAAA-3.64
ces-2MA0922.1chrI:9394120-9394128TTATGTAA+4.68
che-1MA0260.1chrI:9394104-9394109AAGCG+3.2
che-1MA0260.1chrI:9393821-9393826AAACC+3.36
dsc-1MA0919.1chrI:9394260-9394269TTAATTAAT+4.29
dsc-1MA0919.1chrI:9394260-9394269TTAATTAAT-4.29
elt-3MA0542.1chrI:9393578-9393585GATAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:9393769-9393776GAGAAAA-3.02
eor-1MA0543.1chrI:9393580-9393594TAAAAAAATAGAAA+3.13
eor-1MA0543.1chrI:9394042-9394056AAGAAAAGACAAGA+3.32
eor-1MA0543.1chrI:9394006-9394020ACAAGAAGAAGAAG+3.44
eor-1MA0543.1chrI:9394039-9394053AAGAAGAAAAGACA+3.64
eor-1MA0543.1chrI:9394009-9394023AGAAGAAGAAGACA+4.52
fkh-2MA0920.1chrI:9393772-9393779AAAACAT+3.01
fkh-2MA0920.1chrI:9393778-9393785TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9393941-9393948TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:9393512-9393519AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:9394184-9394191TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:9394387-9394394TATACAT+3.12
fkh-2MA0920.1chrI:9393402-9393409AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:9393981-9393988TATACAC+3.33
fkh-2MA0920.1chrI:9394003-9394010TATACAA+3.35
fkh-2MA0920.1chrI:9393696-9393703TAAACAC+3.37
fkh-2MA0920.1chrI:9393459-9393466TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:9393580-9393587TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:9393924-9393931TAAACAA+3.48
fkh-2MA0920.1chrI:9394348-9394355TAAACAA+3.48
fkh-2MA0920.1chrI:9393705-9393712TAAACAA+4.31
lim-4MA0923.1chrI:9394092-9394100GTCATTAA+3.16
lim-4MA0923.1chrI:9394265-9394273TAATTGTT-3.28
lim-4MA0923.1chrI:9394260-9394268TTAATTAA+3.75
lim-4MA0923.1chrI:9394261-9394269TAATTAAT-3.75
lin-14MA0261.1chrI:9393560-9393565TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:9393435-9393440AACAC+3.62
mab-3MA0262.1chrI:9393995-9394007ATACGCAATATA-3.8
mab-3MA0262.1chrI:9394249-9394261ATGTTGAGGAAT+4.03
pal-1MA0924.1chrI:9394257-9394264GAATTAA+3.14
pal-1MA0924.1chrI:9393598-9393605CCATTAA+3.19
pal-1MA0924.1chrI:9393709-9393716CAATAAC+3.24
pal-1MA0924.1chrI:9393781-9393788TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrI:9394265-9394272TAATTGT-3.42
pal-1MA0924.1chrI:9393456-9393463CAATAAA+3.46
pal-1MA0924.1chrI:9393702-9393709CAATAAA+3.46
pal-1MA0924.1chrI:9394093-9394100TCATTAA+3.73
pha-4MA0546.1chrI:9393693-9393702ATTTAAACA+3.08
pha-4MA0546.1chrI:9394345-9394354AATTAAACA+3.15
pha-4MA0546.1chrI:9393769-9393778GAGAAAACA+3.23
skn-1MA0547.1chrI:9394138-9394152AATAGTTGATATTT+3.81
skn-1MA0547.1chrI:9394012-9394026AGAAGAAGACAACC+3.87
skn-1MA0547.1chrI:9394076-9394090GAAAGATGATGATG+4.08
skn-1MA0547.1chrI:9394247-9394261AAATGTTGAGGAAT+4.41
skn-1MA0547.1chrI:9394079-9394093AGATGATGATGATG+5.35
sma-4MA0925.1chrI:9393502-9393512GAGTCTGGCA+3.36
sma-4MA0925.1chrI:9393816-9393826CCTAGAAACC-3.4
unc-62MA0918.1chrI:9394160-9394171AATGACAAATG-3.2
unc-62MA0918.1chrI:9394328-9394339GGTGACAATTT-3.34
unc-62MA0918.1chrI:9394088-9394099TGATGTCATTA+3.41
unc-86MA0926.1chrI:9394387-9394394TATACAT+3.07
unc-86MA0926.1chrI:9393533-9393540AATGCAT+3.11
unc-86MA0926.1chrI:9394321-9394328TATGCAA+3.11
vab-7MA0927.1chrI:9394261-9394268TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:9394261-9394268TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrI:9394265-9394272TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrI:9394422-9394429TCATGAA+3.29
vab-7MA0927.1chrI:9394093-9394100TCATTAA+3.4
zfh-2MA0928.1chrI:9394234-9394244AGAATTAAAT-3.04
zfh-2MA0928.1chrI:9393843-9393853ACTAATTCAA+3.13
zfh-2MA0928.1chrI:9393883-9393893TGAATTAAAA-3.15
zfh-2MA0928.1chrI:9394263-9394273ATTAATTGTT+3.19
zfh-2MA0928.1chrI:9394256-9394266GGAATTAATT-3.22
zfh-2MA0928.1chrI:9393731-9393741CAAATTAAAA-3.27
zfh-2MA0928.1chrI:9394343-9394353AAAATTAAAC-3
zfh-2MA0928.1chrI:9394259-9394269ATTAATTAAT+4.38
zfh-2MA0928.1chrI:9394260-9394270TTAATTAATT-4.38
Enhancer Sequence
ATTTCATAAA TACGTACGAA AATTAAAAAA AAGGAAAATT ATGCACAACC ACCCGAGTAG 60
GGTCAAATAC TCGGAAAAAT TCGATTGAAA ACAAAACTTT TGGTGTCCCG TGCAAAAATG 120
AACACCGTTC TGTAGAGCTT ACAATAAAAA AATACTGGAA AGGGAAGTAC GCTCCATTGC 180
ACTCTTTGAG TCTGGCAAAA ACAAAACCGT TGCATTGAAA TGCATTGTCC TTTGGGAATA 240
GAAAATGTTC CCCAGATTGT GAGGATAAAA AAATAGAAAT ATACCATTAA GTCGGCGAGT 300
TTTTTGTTTC GAGTTTTTGT TTGGAAAAAT ACTATTTTTT GTATCTATCA ATACAATATT 360
CGCAGGATAT TTTTCAAAAT TTAAACACAA TAAACAATAA CAAACGGTAT AAACCGCAAA 420
TTAAAATAAT AGAAACAAAT TTGTTAACAA AACTGAGAAA ACATTTTTAT GATAGTCCGC 480
GTGGACTACA CGACATGCTG GCCTAGAAAC CTCTGCACAA AAAAGGGCAC TAATTCAAAA 540
AAGTTTGTCT TCGCGTATAA TAGATTTCTG AATTAAAATG AAGATTCCTC GATCTTTTGG 600
GGAAATATTT AAACAAAGTT GTGCTATAAA TAAGAATTTA TAAGTTTTCT TCAGAATCTA 660
AAATAGTATA CACATGAAAA ATACGCAATA TACAAGAAGA AGAAGACAAC CAAGAATTTG 720
TTTCAAGAAG AAAAGACAAG AAAAATGTAC AACGTGTGGT GGAAAGATGA TGATGATGTC 780
ATTAAAGAGA AGCGGGTCCG AGAAATTATG TAAAAGTGGG TAAAATAGTT GATATTTTCC 840
TGGAAAATGA CAAATGAAAG GCAAAAGTTT GTTTTTTTCC GAGAATCAGC CACCCGTAAA 900
CCGGGCGTTT GGAAAAACTA GAATTAAATG CAAAATGTTG AGGAATTAAT TAATTGTTAG 960
GCTCTATTCC GTCACAGGAC TAACAAAAAA GAGCATAACC CCATAATATG CAAGGTGACA 1020
ATTTTCAAAA AATTAAACAA CACGGTAAGA GACTTCTCTT CGGATCAGAG AATATACATA 1080
GGGAAAACGG GGTTTTGTTT GGAGATCTCA TGAAACAGGT ACGAAATA 1128