EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00428 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:9347138-9348132 
TF binding sites/motifs
Number: 64             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:9347279-9347289TAAAGGAAAA+3.2
blmp-1MA0537.1chrI:9347310-9347320AAATTGAAGT+3.36
blmp-1MA0537.1chrI:9347169-9347179ATTCAATTTT-3.46
blmp-1MA0537.1chrI:9347759-9347769AAATAGAAGG+3.89
blmp-1MA0537.1chrI:9347158-9347168CTTCTATTTT-3.89
blmp-1MA0537.1chrI:9347728-9347738AAATGGAAAA+4.47
blmp-1MA0537.1chrI:9347189-9347199TTTCCATTTT-4.47
blmp-1MA0537.1chrI:9347525-9347535TTTCACTTTT-6.34
ceh-48MA0921.1chrI:9347708-9347716TTCGATAT+3.07
ceh-48MA0921.1chrI:9347211-9347219TATCGAAA-3.07
ceh-48MA0921.1chrI:9347668-9347676ATCAATAA+3.44
ceh-48MA0921.1chrI:9347251-9347259TATTGATA-3.44
ceh-48MA0921.1chrI:9347931-9347939ATCGATAT+3.56
ces-2MA0922.1chrI:9347751-9347759TTAAATAA+3.54
ces-2MA0922.1chrI:9347396-9347404TTCGTTAT-3
che-1MA0260.1chrI:9347584-9347589AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:9347805-9347810GTTTC-3.36
dsc-1MA0919.1chrI:9347235-9347244TTAATTTAT+3
dsc-1MA0919.1chrI:9347235-9347244TTAATTTAT-3
efl-1MA0541.1chrI:9347824-9347838TCTGGCGGGAAAAT+6
elt-3MA0542.1chrI:9347923-9347930TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:9348089-9348096GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:9347665-9347672TTTATCA+4.31
elt-3MA0542.1chrI:9347255-9347262GATAAAA-4.31
eor-1MA0543.1chrI:9347760-9347774AATAGAAGGAAAAA+3.15
eor-1MA0543.1chrI:9347153-9347167TTTTCCTTCTATTT-3.15
eor-1MA0543.1chrI:9347299-9347313AAAAAAAACAAAAA+3.22
fkh-2MA0920.1chrI:9347257-9347264TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9347756-9347763TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9347164-9347171TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9347663-9347670TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:9347287-9347294AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:9347303-9347310AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:9347539-9347546TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:9347610-9347617TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrI:9347473-9347480TGTTGAT-3.43
fkh-2MA0920.1chrI:9347263-9347270TCAACAA+3.66
fkh-2MA0920.1chrI:9347657-9347664TGTTGAT-3.66
fkh-2MA0920.1chrI:9347966-9347973TAAACAT+3.81
lim-4MA0923.1chrI:9347747-9347755ACAATTAA+3.14
lim-4MA0923.1chrI:9347953-9347961ACAATTAG+3.22
mab-3MA0262.1chrI:9347219-9347231ATGTTGTTATTT+3.51
mab-3MA0262.1chrI:9347836-9347848ATCTTGCGTTTG+3.85
pal-1MA0924.1chrI:9347291-9347298CAATAAC+3.24
pal-1MA0924.1chrI:9347400-9347407TTATTGT-3.24
pal-1MA0924.1chrI:9347748-9347755CAATTAA+3.42
pal-1MA0924.1chrI:9347963-9347970TCATAAA+3.79
pha-4MA0546.1chrI:9347415-9347424AAGGAAATA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:9347260-9347269AAATCAACA+3.64
pha-4MA0546.1chrI:9347474-9347483GTTGATTTT-3.64
pha-4MA0546.1chrI:9347658-9347667GTTGATTTT-3.64
pha-4MA0546.1chrI:9347374-9347383GTTTGTATT-3.79
skn-1MA0547.1chrI:9347421-9347435ATATGATGAGTATT+4.9
sma-4MA0925.1chrI:9347579-9347589CCTAGAAACG-3.2
unc-86MA0926.1chrI:9347379-9347386TATTAAT+3.35
unc-86MA0926.1chrI:9347892-9347899TTAATAT-3.47
unc-86MA0926.1chrI:9347860-9347867TAGGCAT+4.1
vab-7MA0927.1chrI:9347748-9347755CAATTAA+3.22
zfh-2MA0928.1chrI:9347747-9347757ACAATTAAAT-3.04
zfh-2MA0928.1chrI:9347888-9347898AAAATTAATA-3.08
zfh-2MA0928.1chrI:9347146-9347156ATTAATTTTT+3.13
zfh-2MA0928.1chrI:9347771-9347781AAAATTAATC-3.13
zfh-2MA0928.1chrI:9347234-9347244GTTAATTTAT+3.24
zfh-2MA0928.1chrI:9347683-9347693TAAATTAATG-3.26
Enhancer Sequence
TTTACGAGAT TAATTTTTTC CTTCTATTTT TATTCAATTT TATGCCGATT TTTTCCATTT 60
TTTCGCTGTT TTATATCGAA AATGTTGTTA TTTAACGTTA ATTTATGCCT TTTTATTGAT 120
AAAAATCAAC AATATTCCAT GTAAAGGAAA AAACAATAAC AAAAAAAAAC AAAAATTGAA 180
GTTTGTCCTT GGGTGCACTA CGAATCAACG TATTCCGGAT ATCTGGAATG TTAAATGTTT 240
GTATTAATGT GGAGAACTTT CGTTATTGTG ATTTGTAAAG GAAATATGAT GAGTATTTGG 300
ATGAAAATTG GAATTTACAG ACTAAATCGA CAAACTGTTG ATTTTTTAAA GATGTTTTAG 360
GCCTAATTTT TTAGCGAACG GAATGCTTTT CACTTTTAAA TTGTTTTTTG AAAATGTTTT 420
TTAAATGAAA TGCTCACTTT TCCTAGAAAC GTTGTGTCGC CGTAATTTTC CTTGTTTTCC 480
GTCGATTTTG TGCTGAAAAT GGAACTTTAC ATGGAATTTT GTTGATTTTT ATCAATAAAA 540
AGGCATAAAT TAATGTTAAA TAACAGCATT TTCGATATAA AACAGCGAAA AAATGGAAAA 600
AATCGGCATA CAATTAAATA AAAATAGAAG GAAAAAATTA ATCTCGTAAA CCCACACGTG 660
CGGCACGGTT TCGTGGGCGG GGCGTCTCTG GCGGGAAAAT CTTGCGTTTG AAATTTCACA 720
TATAGGCATC CAATGGTTTT GCGGATTTTA AAAATTAATA TAAAATCAGG GAAATTTTTT 780
TAATTTTTTT CACATCGATA TTCGGTATCA GGAGCACAAT TAGAGTCATA AACATATATT 840
TCCCCACAAA CTCTACTCCC CCTTTAACTT GAGTTATAAA TACAACTAGC AAAATCGTCA 900
TTTGGAAAGG TATATCTTAC TTTTCTGTCT AAAATTTTCG AATGTTAGCT TGAAAAAAAG 960
ACTTGCGGCT CTTTTTTGAG CGGTCTCATG ATCT 994