EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00406 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:8456917-8457846 
TF binding sites/motifs
Number: 53             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8457320-8457330GGATGGAGAA+3.32
blmp-1MA0537.1chrI:8457110-8457120CTTCTATTTT-3.89
blmp-1MA0537.1chrI:8456930-8456940AAAAAGAAAT+3.93
blmp-1MA0537.1chrI:8457534-8457544AAAATGAAAC+4.09
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:8457483-8457496TTAGTTTTGGTAA+3.06
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:8457736-8457749AAATTAGGTCAAT-3.59
ceh-48MA0921.1chrI:8457443-8457451CCCGATAG+3.14
ceh-48MA0921.1chrI:8457743-8457751GTCAATAC+3.17
ceh-48MA0921.1chrI:8457405-8457413ACCGATAT+4.05
ces-2MA0922.1chrI:8457752-8457760TTATGTCA+3.27
ces-2MA0922.1chrI:8456983-8456991TAACGCAA+4.05
daf-12MA0538.1chrI:8457203-8457217TAACAGACACCTTT-3.68
dsc-1MA0919.1chrI:8457735-8457744TAAATTAGG+3
dsc-1MA0919.1chrI:8457735-8457744TAAATTAGG-3
efl-1MA0541.1chrI:8457409-8457423ATATTGCGCGAGGG-3.21
elt-3MA0542.1chrI:8457016-8457023GATAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:8457057-8457064GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:8456970-8456977GATAAAA-4.31
fkh-2MA0920.1chrI:8457124-8457131TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrI:8457018-8457025TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:8457660-8457667TGTTGAT-3.43
hlh-1MA0545.1chrI:8457764-8457774ACCAATTGTT+3.22
hlh-1MA0545.1chrI:8456986-8456996CGCAACTGAT+3.26
hlh-1MA0545.1chrI:8457331-8457341GGCAACTGTT+3.72
hlh-1MA0545.1chrI:8457765-8457775CCAATTGTTG-3.99
hlh-1MA0545.1chrI:8457332-8457342GCAACTGTTC-5.11
lim-4MA0923.1chrI:8457031-8457039TCATTACT-3.03
lim-4MA0923.1chrI:8457825-8457833TAATGAGT-3.44
lim-4MA0923.1chrI:8457644-8457652TTCATTAG+3
lin-14MA0261.1chrI:8457337-8457342TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrI:8457308-8457313AACGC+3.36
mab-3MA0262.1chrI:8457535-8457547AAATGAAACATC-3.53
mab-3MA0262.1chrI:8457009-8457021AAGTTGCGATAA+3.92
pal-1MA0924.1chrI:8457031-8457038TCATTAC-3.17
pal-1MA0924.1chrI:8457621-8457628TTATGAC-3.79
pal-1MA0924.1chrI:8457223-8457230TAATAAC+3.92
pal-1MA0924.1chrI:8457368-8457375TAATAGA+3
pha-4MA0546.1chrI:8457741-8457750AGGTCAATA+3.69
skn-1MA0547.1chrI:8457499-8457513GAATCATGACATGT+4.35
skn-1MA0547.1chrI:8457135-8457149AATGTCATCAATTA-5.12
sma-4MA0925.1chrI:8457573-8457583TTTTCTAGAC+3.32
sma-4MA0925.1chrI:8457204-8457214AACAGACACC-3.54
unc-62MA0918.1chrI:8457514-8457525TTTGACATTTT-3.22
unc-62MA0918.1chrI:8457134-8457145AAATGTCATCA+3.51
unc-62MA0918.1chrI:8457507-8457518ACATGTCTTTG+3.8
unc-62MA0918.1chrI:8457503-8457514CATGACATGTC-4.45
unc-86MA0926.1chrI:8456977-8456984TACATAT-3.06
unc-86MA0926.1chrI:8457642-8457649TATTCAT+3.68
vab-7MA0927.1chrI:8457143-8457150CAATTAT-3.15
vab-7MA0927.1chrI:8457031-8457038TCATTAC-3.29
vab-7MA0927.1chrI:8457645-8457652TCATTAG-3.82
vab-7MA0927.1chrI:8457825-8457832TAATGAG-3.88
zfh-2MA0928.1chrI:8457735-8457745TAAATTAGGT-3.07
Enhancer Sequence
TGCAAAACCA TTGAAAAAGA AATAAGAAGC AGTTTGTCAG TTGTAACATT TTTGATAAAA 60
TACATATAAC GCAACTGATA TATAAGCTGC TAAAGTTGCG ATAAAAATAC AAATTCATTA 120
CTGTAAAGTT GGTCGGAAGT GATCAAATTT GTGAAATATT TCCAAAATTT GAAAACCCAG 180
CTTCTGCTAG ATTCTTCTAT TTTCACATGT TTTCTATAAA TGTCATCAAT TATTGAGATT 240
CAAATAACGA TATAGTTTCT CATGCCAAAA AGAGCTCTGC CTGCAGTAAC AGACACCTTT 300
CTGCTGTAAT AACTGTAACA ACCATATATC AATGGTCCAA CAGATCACCA TATTCGCCTG 360
TCCTTCTGCT GAGTCGGCAT TGTAAAAGGA GAACGCGGAG AGGGGATGGA GAAGGGCAAC 420
TGTTCGGAGC CCGGATCGGA AGACTGCTTT GTAATAGAGC CCCGTGCTAG GTTACTCCAC 480
GATATCTGAC CGATATTGCG CGAGGGCTTT TTGAGGGGAA CTTAGACCCG ATAGGGATTG 540
ATCCCATATG TTACACTGCA AAAATATTAG TTTTGGTAAC TAGAATCATG ACATGTCTTT 600
GACATTTTCC AGTTTTAAAA ATGAAACATC TAGTTTTAAA ACACCAATTT TGAAGATTTT 660
CTAGACGACA TTATACAGTG CGTACAAGTT CTATACCCCT AAATTTATGA CTGTTGCCAC 720
GTCTGTATTC ATTAGAAAAA ATCTGTTGAT GCCATTCGAT TCCAAATCCC AAAAAACCTA 780
TGTGTCTAAA TTTTCATGAC CGCACCTCAA AAACTAAATA AATTAGGTCA ATACATTATG 840
TCAAAAAACC AATTGTTGCT TGTGAATTTA AAAAAAAAAA AAGTTTAAAG TATTACTACG 900
AAGTTTTTTA ATGAGTTTAC TATCAGTTT 929