EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00399 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:8099726-8101204 
TF binding sites/motifs
Number: 89             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:8100084-8100094TATCCACTTT-3.17
blmp-1MA0537.1chrI:8100330-8100340AGAATGAGTG+3.19
blmp-1MA0537.1chrI:8100924-8100934AAAAGGAAAC+3.87
blmp-1MA0537.1chrI:8100220-8100230TCTCTATTCT-3.8
blmp-1MA0537.1chrI:8100888-8100898TTTCTTTTTT-4.04
blmp-1MA0537.1chrI:8099781-8099791TTTCGATTTT-4.3
blmp-1MA0537.1chrI:8099966-8099976TTTCAATTTC-4.74
blmp-1MA0537.1chrI:8101160-8101170TTTCTTTTTT-4.98
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:8099807-8099820TTAGTTTAGTTAT+4.07
ceh-22MA0264.1chrI:8101066-8101076TTCAAGAACT-3.26
ceh-48MA0921.1chrI:8099944-8099952TATTGAAC-3.34
ceh-48MA0921.1chrI:8100914-8100922TATTGATT-3.92
ces-2MA0922.1chrI:8100947-8100955TACGTTGT-3.01
ces-2MA0922.1chrI:8100409-8100417TGTTTAAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:8100772-8100780TTTTATAA+3.12
ces-2MA0922.1chrI:8100773-8100781TTTATAAT-3.18
ces-2MA0922.1chrI:8100433-8100441TTGTATAA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:8100627-8100635TTATATAA+3.35
ces-2MA0922.1chrI:8100628-8100636TATATAAG-3.35
ces-2MA0922.1chrI:8099898-8099906TATGTCAT-3.55
ces-2MA0922.1chrI:8100716-8100724TACGTGAT-3.7
ces-2MA0922.1chrI:8100434-8100442TGTATAAT-4.13
che-1MA0260.1chrI:8100754-8100759AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:8100908-8100913AAACG+3.06
daf-12MA0538.1chrI:8100342-8100356TGTATGTGAGTGTC+3.03
daf-12MA0538.1chrI:8100330-8100344AGAATGAGTGTGTG+3.09
daf-12MA0538.1chrI:8100348-8100362TGAGTGTCTATGAG+3.17
daf-12MA0538.1chrI:8100344-8100358TATGTGAGTGTCTA+3.2
daf-12MA0538.1chrI:8100332-8100346AATGAGTGTGTGTA+3.52
daf-12MA0538.1chrI:8100338-8100352TGTGTGTATGTGAG+3.7
daf-12MA0538.1chrI:8100336-8100350AGTGTGTGTATGTG+3.9
daf-12MA0538.1chrI:8100334-8100348TGAGTGTGTGTATG+5.2
dsc-1MA0919.1chrI:8101032-8101041GTAATTAAC+4.03
dsc-1MA0919.1chrI:8101032-8101041GTAATTAAC-4.03
elt-3MA0542.1chrI:8099860-8099867GCTAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:8099831-8099838GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:8100918-8100925GATTAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:8100151-8100158GATAAAC-3.21
elt-3MA0542.1chrI:8100721-8100728GATAACA-4.15
eor-1MA0543.1chrI:8101161-8101175TTCTTTTTTTTTTG-3.52
eor-1MA0543.1chrI:8100577-8100591CTCTGCCGTTCTCC-3.53
eor-1MA0543.1chrI:8099975-8099989CTCTGATTTTTTGT-3.68
fkh-2MA0920.1chrI:8099739-8099746TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8100963-8100970TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:8101117-8101124TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:8100409-8100416TGTTTAA-3.48
fkh-2MA0920.1chrI:8100940-8100947TAAACAT+3.81
fkh-2MA0920.1chrI:8100952-8100959TGTTTAC-4.66
hlh-1MA0545.1chrI:8100404-8100414TCATTTGTTT-3.21
hlh-1MA0545.1chrI:8099854-8099864ACAATTGCTA-3.3
hlh-1MA0545.1chrI:8099902-8099912TCATTTGTCG-3.56
hlh-1MA0545.1chrI:8099853-8099863AACAATTGCT+4
lim-4MA0923.1chrI:8100593-8100601TAATGAAT-3.07
lim-4MA0923.1chrI:8101033-8101041TAATTAAC-3.07
lim-4MA0923.1chrI:8100654-8100662TAATTGTA-3.14
lim-4MA0923.1chrI:8101032-8101040GTAATTAA+4.64
lin-14MA0261.1chrI:8101083-8101088TGTTC-3.01
lin-14MA0261.1chrI:8099991-8099996TGTTC-3.14
lin-14MA0261.1chrI:8100217-8100222CGTTC-3.36
lin-14MA0261.1chrI:8100245-8100250TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:8100885-8100897ATGTTTCTTTTT+3.35
pal-1MA0924.1chrI:8100654-8100661TAATTGT-3.42
pal-1MA0924.1chrI:8101033-8101040TAATTAA+4.27
pha-4MA0546.1chrI:8100410-8100419GTTTAATCT-3.17
pha-4MA0546.1chrI:8101158-8101167ATTTTCTTT-3.17
pha-4MA0546.1chrI:8100046-8100055GTTTACTCT-3.21
pha-4MA0546.1chrI:8100398-8100407GTTTCCTCA-3.23
pha-4MA0546.1chrI:8100012-8100021ATTTGTAAA-3.28
pha-4MA0546.1chrI:8101093-8101102ATTTGTAAT-3.3
pha-4MA0546.1chrI:8100445-8100454ATGCAAATA+3.9
pha-4MA0546.1chrI:8100617-8100626GTGCAAATA+4.3
pha-4MA0546.1chrI:8100953-8100962GTTTACTTT-5.52
skn-1MA0547.1chrI:8100209-8100223TTTGTCTGCGTTCT-4.07
skn-1MA0547.1chrI:8100762-8100776TTCTTCAACATTTT-4.1
sma-4MA0925.1chrI:8100210-8100220TTGTCTGCGT+3.17
sma-4MA0925.1chrI:8100184-8100194GATAGACAAT-3.18
sma-4MA0925.1chrI:8100351-8100361GTGTCTATGA+3.37
sma-4MA0925.1chrI:8100315-8100325GCCAGACTTT-3.61
sma-4MA0925.1chrI:8100425-8100435ACTAGAAATT-3
unc-62MA0918.1chrI:8099956-8099967AGTTGTAATTT+3.13
unc-86MA0926.1chrI:8100446-8100453TGCAAAT-3.09
vab-7MA0927.1chrI:8100654-8100661TAATTGT-3.22
vab-7MA0927.1chrI:8101033-8101040TAATTAA+3.88
zfh-2MA0928.1chrI:8100807-8100817AAAATTAAAG-3.02
zfh-2MA0928.1chrI:8101105-8101115TGAATTAGTA-3.08
zfh-2MA0928.1chrI:8100652-8100662ATTAATTGTA+3.19
zfh-2MA0928.1chrI:8100649-8100659TGAATTAATT-3.36
zfh-2MA0928.1chrI:8101031-8101041GGTAATTAAC+3.53
zfh-2MA0928.1chrI:8101032-8101042GTAATTAACT-4.04
Enhancer Sequence
ACAAAAAGAA ACTTGTTTTT TTTCTTTAAA GTTTCTCGAA AACTCGGCAG ATTTTTTTCG 60
ATTTTTTTAA GTTGCAACTA CTTAGTTTAG TTATTTTGTT GTAGTGTTAA AATTCGAATT 120
TCCATCGAAC AATTGCTAAA ATAGATCCTT TTCAGACGTT GGTGTTGGTC GTTATGTCAT 180
TTGTCGAAAT CCACATGAAT GGTGATTCTA GTTCGATTTA TTGAACGACT AGTTGTAATT 240
TTTCAATTTC TCTGATTTTT TGTTATGTTC CACTTTCTCA TATGCTATTT GTAAATTGAT 300
AATCTTCCAG TTTTCCATGA GTTTACTCTA AAATTCGTCG ATTTCTAAAA AAATGCACTA 360
TCCACTTTTT CTTCGAGTAT TCCCAGGTAT TCTAGCTAAT GTAACAGTCC CCATAATTTC 420
CCGATGATAA ACGATCCCAT CTTAAAATTC CGTACCCTGA TAGACAATAG GCTCCACCCC 480
TTTTTTGTCT GCGTTCTCTA TTCTCTCCAC AATTCGCGGT GTTCCATTCT CGCACTTTCG 540
CCGCCTCACG CCCTCCGCGA CGAAAGACAA GAAGAGAACA ACCCGTAGGG CCAGACTTTG 600
ATGAAGAATG AGTGTGTGTA TGTGAGTGTC TATGAGATGT GTCTTCGGAT TGTAGGATCG 660
TTACTTATTT CTGTTTCCTC ATTTGTTTAA TCTGAAATTA CTAGAAATTG TATAATACCA 720
TGCAAATAAG GAGGCCACGT GTAGTTCGCT CTCAGGTTTT GTATGTACCA CCGTCAAGAA 780
AGTTTCCGAC CACCAAATCA CTAGATTTTT CATAGTTCTC AGTTGGATCC TTGTGTCTCA 840
GAATTCAACG ACTCTGCCGT TCTCCGTTAA TGAATTTACC AACAGTTTCA TGTGCAAATA 900
GTTATATAAG CTGGGGTTGA AGCTGAATTA ATTGTACTGA AACAGTTTCG TAAACTCATT 960
CTCGAAATTT CCAAAAGGTT TTGAGCTATT TACGTGATAA CATTTAAATT TTGGTAGAAT 1020
TCATTTTGAA ACGAAGTTCT TCAACATTTT ATAATTGTAT TTCCGTTCAA ACGTAGTTCT 1080
CAAAATTAAA GTTATTTTGT GGTATTTTTC AATCTGGCAA TAGTGGGTAA ATGTCTTCGT 1140
AACGCGTAAT AATATTATAA TGTTTCTTTT TTCTATATTC CGAAACGGTA TTGATTAAAA 1200
AAGGAAACTG CGCATAAACA TTACGTTGTT TACTTTTTGT TTTTGAAAAC TTAGATACTA 1260
CATGCAGAGT TGATTCATGT TAAACGTACT TTAGAATCTC TTTAAGGTAA TTAACTCACA 1320
GTTTCTACCA GTATTGTCCT TTCAAGAACT GAAAAACTGT TCCTCCTATT TGTAATTTTT 1380
GAATTAGTAT TTTTTTATTT AAGAGCACTA TATTTTTTTC CTATCGCTTA TTATTTTCTT 1440
TTTTTTTTGA AGTTAGAACT AATCTGTGAA AGTTCGTT 1478