EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00390 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:7794691-7795485 
TF binding sites/motifs
Number: 51             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:7795037-7795047TGAATGAAAG+3.09
blmp-1MA0537.1chrI:7794897-7794907AAATGGATGA+3.26
blmp-1MA0537.1chrI:7794959-7794969AAGATGAAGA+3.42
blmp-1MA0537.1chrI:7795278-7795288AGATTGAAAT+3.48
blmp-1MA0537.1chrI:7794768-7794778TATCACTTTT-3.6
blmp-1MA0537.1chrI:7795054-7795064AAAGCGATAA+4.02
ceh-22MA0264.1chrI:7795458-7795468TTCAAGTATA-3.23
ceh-22MA0264.1chrI:7794798-7794808TTTAAGTGGT-4.59
ceh-48MA0921.1chrI:7795168-7795176AATTGATT-3.03
ceh-48MA0921.1chrI:7795120-7795128TATTGAAC-3.13
ces-2MA0922.1chrI:7794696-7794704TTATAAAA+3.18
ces-2MA0922.1chrI:7795463-7795471GTATATAA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:7795442-7795450TTACGTCA+3.59
daf-12MA0538.1chrI:7795286-7795300ATTCAAACACACTG-3.34
dsc-1MA0919.1chrI:7795254-7795263CTCATTAAC+3.04
dsc-1MA0919.1chrI:7795254-7795263CTCATTAAC-3.04
dsc-1MA0919.1chrI:7795390-7795399TTAATTATG+3.21
dsc-1MA0919.1chrI:7795390-7795399TTAATTATG-3.21
elt-3MA0542.1chrI:7795133-7795140TTTATCA+3.23
eor-1MA0543.1chrI:7794939-7794953GAAATAATGAGAGA+3.59
eor-1MA0543.1chrI:7795042-7795056GAAAGATGCAAAAA+3.65
eor-1MA0543.1chrI:7794957-7794971TGAAGATGAAGAGA+3.8
eor-1MA0543.1chrI:7794965-7794979AAGAGATGCAGACA+6.17
fkh-2MA0920.1chrI:7794894-7794901TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:7795468-7795475TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrI:7794699-7794706TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:7794738-7794745TCAACAT+3.6
lim-4MA0923.1chrI:7795254-7795262CTCATTAA+3.46
lim-4MA0923.1chrI:7795391-7795399TAATTATG-3.6
lim-4MA0923.1chrI:7795390-7795398TTAATTAT+3
lin-14MA0261.1chrI:7795125-7795130AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:7795347-7795352AACGC+3.36
pal-1MA0924.1chrI:7795144-7795151TAATTTC-3.07
pal-1MA0924.1chrI:7794997-7795004TCATAAC+3.4
pal-1MA0924.1chrI:7795391-7795398TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrI:7795355-7795364ATTTGCTGA-3.01
pha-4MA0546.1chrI:7795286-7795295ATTCAAACA+3.03
pha-4MA0546.1chrI:7795233-7795242AAATAAATA+3.76
skn-1MA0547.1chrI:7794898-7794912AATGGATGACAAGT+4.95
sma-4MA0925.1chrI:7794971-7794981TGCAGACACG-3.44
sma-4MA0925.1chrI:7795013-7795023TTGACTGGGC+3.88
unc-62MA0918.1chrI:7794902-7794913GATGACAAGTT-3.81
unc-62MA0918.1chrI:7794992-7795003ACCTGTCATAA+4.53
unc-86MA0926.1chrI:7795086-7795093TATGGAT+3.14
vab-7MA0927.1chrI:7794943-7794950TAATGAG-3.19
vab-7MA0927.1chrI:7795255-7795262TCATTAA+3.88
vab-7MA0927.1chrI:7795391-7795398TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:7795142-7795152ATTAATTTCC+3.17
zfh-2MA0928.1chrI:7795139-7795149AGAATTAATT-3.22
zfh-2MA0928.1chrI:7795390-7795400TTAATTATGG-3.46
zfh-2MA0928.1chrI:7795389-7795399TTTAATTATG+3.73
Enhancer Sequence
CAAAATTATA AAAAAATTCG AATATTCGAA TTTATATGAC CAAGTGGTCA ACATTTAAAA 60
CATTTCTTCC AGTAATATAT CACTTTTGAT AATGATTTAG TGATTTTTTT AAGTGGTCTA 120
AAAGGTCGGT CAAAATCTCA AATCGTTCCA TCAGAATAGC CTGAAAAACG GGGGGGGGGG 180
GGCTTGTAGT ACCATTTTTC CAATAAAAAT GGATGACAAG TTGATATATA TTGCCAAGGT 240
AACAGATAGA AATAATGAGA GAGTATTGAA GATGAAGAGA TGCAGACACG ACAGCACATT 300
TACCTGTCAT AACTACTACA AATTGACTGG GCGGTATGGG GATGAATGAA TGAAAGATGC 360
AAAAAAGCGA TAAGTTTTCG GGCATGAGGA TAGGATATGG ATGATGGTCA TTTGGCACTT 420
TATGTGTGAT ATTGAACAGG GATTTATCAG AATTAATTTC CGGTTGTCTA TTTAGAGAAT 480
TGATTCCCAA AAAGTTTCAA ATTGTGATTT GCCAAAAATG TTATTTCCTG ATGGTGGACT 540
GAAAATAAAT ACATTTCTCG AACCTCATTA ACTTTTGGGT GGGGTCAAGA TTGAAATTCA 600
AACACACTGC AATACTGATG GTATTTCGAG TGAACTGTAT TTTTCAGTCA CAAGAGAACG 660
CAGTATTTGC TGAAAAGGGC TGAAACACAT CAAAAAAGTT TAATTATGGG GTTATTCAAG 720
TAATGTCGGA AAATTAAAAA GTGTAGAAAA ATTACGTCAC AACTGTATTC AAGTATATAA 780
AAACATGTAT TTAA 794