EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00353 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:6228923-6230066 
TF binding sites/motifs
Number: 56             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:6229001-6229011TTTCAATTAT-3.23
blmp-1MA0537.1chrI:6229735-6229745TTTCTTTTTT-4.95
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:6229198-6229211TTATTTTACTTTA+4.24
ceh-22MA0264.1chrI:6229921-6229931ACACTCAAAA+3.25
ces-2MA0922.1chrI:6229402-6229410TTTTGTAA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:6229823-6229831TTACCCAA+3.25
ces-2MA0922.1chrI:6229768-6229776TACATAAT-3.34
ces-2MA0922.1chrI:6229943-6229951TTACAGAA+3.55
daf-12MA0538.1chrI:6229554-6229568CTACAAAAACATAC-3.11
dsc-1MA0919.1chrI:6229351-6229360GTAATTATG+3.07
dsc-1MA0919.1chrI:6229351-6229360GTAATTATG-3.07
elt-3MA0542.1chrI:6229437-6229444TTTATCA+3.23
elt-3MA0542.1chrI:6229988-6229995GAAAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrI:6229303-6229310CTTGTCA+3.45
elt-3MA0542.1chrI:6229164-6229171GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:6229989-6230003AAAAGAACCAAAGA+3.8
fkh-2MA0920.1chrI:6229766-6229773TATACAT+3.12
fkh-2MA0920.1chrI:6229752-6229759TGTATAT-3.35
fkh-2MA0920.1chrI:6229762-6229769TGTATAT-3.35
fkh-2MA0920.1chrI:6229042-6229049TAAACAC+3.37
fkh-2MA0920.1chrI:6229328-6229335TAAACAA+3.48
fkh-2MA0920.1chrI:6229319-6229326TAAACAA+4.66
lim-4MA0923.1chrI:6229026-6229034ACAATTAA+3.32
lim-4MA0923.1chrI:6229351-6229359GTAATTAT+3.42
lim-4MA0923.1chrI:6229771-6229779ATAATTAT+3
lin-14MA0261.1chrI:6230029-6230034AACAT+3.14
pal-1MA0924.1chrI:6229960-6229967TCATAAA+3.29
pal-1MA0924.1chrI:6229352-6229359TAATTAT-3.33
pal-1MA0924.1chrI:6229027-6229034CAATTAA+3.42
pal-1MA0924.1chrI:6229820-6229827TTATTAC-4.57
pha-4MA0546.1chrI:6229862-6229871GTTTGAATT-3.03
pha-4MA0546.1chrI:6229316-6229325TGGTAAACA+3.45
pha-4MA0546.1chrI:6229569-6229578GTGTAAATA+4.36
skn-1MA0547.1chrI:6229189-6229203GTATGAAGATTATT+3.84
skn-1MA0547.1chrI:6229868-6229882ATTTTCAGCGTTAT-4.3
sma-4MA0925.1chrI:6229219-6229229TCCAGAAAAA-3.46
sma-4MA0925.1chrI:6229589-6229599ACCAGACATA-4.21
snpc-4MA0544.1chrI:6229286-6229297TGTCGGCAGCT+3.89
unc-62MA0918.1chrI:6229283-6229294AGATGTCGGCA+3.12
unc-62MA0918.1chrI:6229293-6229304AGCTGTATTTC+3.13
unc-62MA0918.1chrI:6229262-6229273AGTTGTCAAAA+3.37
unc-62MA0918.1chrI:6229302-6229313TCTTGTCATGA+3
unc-86MA0926.1chrI:6229766-6229773TATACAT+3.07
vab-7MA0927.1chrI:6229004-6229011CAATTAT-3.15
vab-7MA0927.1chrI:6229352-6229359TAATTAT+3.19
vab-7MA0927.1chrI:6229027-6229034CAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:6229772-6229779TAATTAT+3.29
vab-7MA0927.1chrI:6229772-6229779TAATTAT-3.29
vab-7MA0927.1chrI:6229352-6229359TAATTAT-3.6
zfh-2MA0928.1chrI:6229026-6229036ACAATTAAAA-3.02
zfh-2MA0928.1chrI:6229542-6229552TAAATTAACC-3.24
zfh-2MA0928.1chrI:6229770-6229780CATAATTATT+3.33
zfh-2MA0928.1chrI:6229771-6229781ATAATTATTA-3.34
zfh-2MA0928.1chrI:6229350-6229360CGTAATTATG+3.42
zfh-2MA0928.1chrI:6229351-6229361GTAATTATGG-3.4
zfh-2MA0928.1chrI:6229227-6229237AAAATTAGTT-3
Enhancer Sequence
AGTCCCTCAC TTGGCACTGC TCATGCTCTA CAACCAAAAA ATCAGGTTAC TTACTTCGAA 60
TATATTTTTT CGAGCATTTT TCAATTATTA CAAATGTAAA ATCACAATTA AAATATATTT 120
AAACACGATA TCAAGATTCA AGGAAAAAAA TCTTCACTTG CGAGAAATAC TCTAGGTATA 180
GTCGTACACT ATTCAAGTTC AATCTCTCAT AACTTTTTTG CTGAATTTTT CAGAACAACG 240
TGAAAAAACA CACATGATCG CAAGTAGTAT GAAGATTATT TTACTTTAAA AACACTTCCA 300
GAAAAAAATT AGTTTTCGAG ATACGGGCAA ATCAGTAAAA GTTGTCAAAA CGGGCTCACG 360
AGATGTCGGC AGCTGTATTT CTTGTCATGA CAATGGTAAA CAACTTAAAC AACTGAATAC 420
AAGTAGACGT AATTATGGAC AATATTTCTT TAGTTGAACT TTTTTCGATA GCATGCCCAT 480
TTTGTAAGTT GTGCTCGTTT GAAAAATTTG TAAATTTATC AAAAATCAAA AATTGGATAG 540
AATTATGGCC GGCACTGTAT TTGATACTGG AAAAATCACT GAGAACCTTT ACCAAGCGCA 600
TCCTTCAAAG ATGCGATGTT AAATTAACCT CCTACAAAAA CATACTGTGT AAATATTAAC 660
TACTCTACCA GACATACGAG AATTAAAACT CAAGTGAAAC TACTATGTAG ACTTCTTACT 720
GGTTCTTCAC ATTTCTCTAA TTTAAATCAG TTCGTCAAAT TCTCTAATTC TATTGAGCGG 780
TCCATGATTC TGGCTATATT TGGAAAATGA GCTTTCTTTT TTTGATGATT GTATATTTTT 840
GTATATACAT AATTATTAGA CGCTAGGTAG TTGTAAACCA GCACCAAGAA GACGTATTTA 900
TTACCCAACT CACCCTAAAA ACTATTCTCT CGGGAATCTG TTTGAATTTT CAGCGTTATC 960
GTTGTAGTTT TACGACCATG TGTGGAGATG TACAAAATAC ACTCAAAACT GAGCTGAAAA 1020
TTACAGAACG TGGACTATCA TAAAGGATAG GAGTAAAATT GGACTGAAAA GAACCAAAGA 1080
AGCATGGTCG TCCACTTGCC AGAGAGAACA TTCGTCGCAC AAGCAATGGG AACCGGATTT 1140
TGG 1143