EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00352 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:6226526-6228523 
TF binding sites/motifs
Number: 108             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:6227886-6227896TATCCATTTT-3.19
blmp-1MA0537.1chrI:6227872-6227882AAATCGAATA+3.24
blmp-1MA0537.1chrI:6226754-6226764TTTCAATTCC-3.35
blmp-1MA0537.1chrI:6228332-6228342CATCAATTTC-3.37
blmp-1MA0537.1chrI:6228307-6228317TTTCTTTTTC-3.93
blmp-1MA0537.1chrI:6227802-6227812AAAAAGAAGA+4.07
blmp-1MA0537.1chrI:6227844-6227854AAATCGAAAA+4.3
blmp-1MA0537.1chrI:6227069-6227079TTTCGATTTT-4.3
blmp-1MA0537.1chrI:6227927-6227937TTTCGATTTT-4.3
blmp-1MA0537.1chrI:6227921-6227931TTTCGTTTTC-4.49
blmp-1MA0537.1chrI:6228110-6228120AAAATGAAAA+5.14
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:6227582-6227595TTATGAAGACAAT-3.59
ceh-22MA0264.1chrI:6227188-6227198GCACTTTAGA+3.24
ceh-48MA0921.1chrI:6228257-6228265ATCAATTT+3.03
ceh-48MA0921.1chrI:6226708-6226716AATTGATT-3.03
ceh-48MA0921.1chrI:6227771-6227779TATTGATG-3.16
ceh-48MA0921.1chrI:6227023-6227031TTCGATAT+3.52
ceh-48MA0921.1chrI:6226854-6226862ATCAATAT+3.74
ces-2MA0922.1chrI:6227113-6227121TACTTTAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:6228240-6228248TTATATGA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:6226636-6226644TACATCAT-3.32
ces-2MA0922.1chrI:6227596-6227604TATTTAAT-3.54
ces-2MA0922.1chrI:6228090-6228098TTAGATAA+3.64
ces-2MA0922.1chrI:6228236-6228244TATATTAT-4.08
che-1MA0260.1chrI:6228319-6228324GTTTC-3.36
che-1MA0260.1chrI:6228388-6228393GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrI:6228140-6228154CAGCAAGTGCACTC-3.11
daf-12MA0538.1chrI:6228212-6228226TGTGTGTGTATTTA+3.22
daf-12MA0538.1chrI:6228210-6228224GATGTGTGTGTATT+3.76
dsc-1MA0919.1chrI:6227497-6227506ATAATTAAA+3.33
dsc-1MA0919.1chrI:6227497-6227506ATAATTAAA-3.33
efl-1MA0541.1chrI:6228175-6228189TCGGGAGGCAAAAC+3.27
efl-1MA0541.1chrI:6226684-6226698GTGGGCGGCAATTG+4.48
efl-1MA0541.1chrI:6228078-6228092GAACGCGGGAAATT+6.05
elt-3MA0542.1chrI:6226912-6226919TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:6227778-6227785GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:6227465-6227472TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:6227162-6227169TATAAGA-3.29
elt-3MA0542.1chrI:6228115-6228122GAAAAGA-3.31
elt-3MA0542.1chrI:6227775-6227782GATGAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:6226851-6226858CTGATCA+3.45
elt-3MA0542.1chrI:6227005-6227012CTTGTCA+3.45
elt-3MA0542.1chrI:6227386-6227393CTAATCA+3.58
elt-3MA0542.1chrI:6227893-6227900TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:6227103-6227110GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:6227674-6227681GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:6228093-6228100GATAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:6227607-6227614TTTATCA+4.31
eor-1MA0543.1chrI:6227805-6227819AAGAAGAACAAAGA+3.52
eor-1MA0543.1chrI:6227803-6227817AAAAGAAGAACAAA+3.61
eor-1MA0543.1chrI:6228051-6228065AAGAAACAAAAAAA+3.65
fkh-2MA0920.1chrI:6228095-6228102TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:6226877-6226884AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:6227349-6227356AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:6227158-6227165TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrI:6227614-6227621TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:6226666-6226673TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:6227632-6227639TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrI:6227547-6227554TCAACAA+3.66
fkh-2MA0920.1chrI:6226977-6226984TGTTTAC-4.05
fkh-2MA0920.1chrI:6227525-6227532TGTTTAC-4.05
fkh-2MA0920.1chrI:6227765-6227772TGTTTAT-4.31
hlh-1MA0545.1chrI:6226846-6226856AACATCTGAT+3.15
hlh-1MA0545.1chrI:6227151-6227161ACAAATGTTT-3.17
hlh-1MA0545.1chrI:6226847-6226857ACATCTGATC-3.23
hlh-1MA0545.1chrI:6228381-6228391CCAGTTGGCT-3.35
hlh-1MA0545.1chrI:6226690-6226700GGCAATTGCC+3.57
hlh-1MA0545.1chrI:6226691-6226701GCAATTGCCG-3.57
hlh-1MA0545.1chrI:6227150-6227160AACAAATGTT+3.74
lim-4MA0923.1chrI:6227386-6227394CTAATCAA+3.21
lim-4MA0923.1chrI:6227497-6227505ATAATTAA+3.57
lim-4MA0923.1chrI:6227498-6227506TAATTAAA-3
lin-14MA0261.1chrI:6226804-6226809AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:6227336-6227341AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:6228079-6228084AACGC+3.36
lin-14MA0261.1chrI:6227021-6227026CGTTC-3.36
lin-14MA0261.1chrI:6226797-6226802TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:6228195-6228207ACGTTGCCAAGT+4.68
pal-1MA0924.1chrI:6227611-6227618TCATAAA+3.29
pal-1MA0924.1chrI:6227498-6227505TAATTAA+3.54
pha-4MA0546.1chrI:6227110-6227119ATTTACTTT-3.02
pha-4MA0546.1chrI:6227937-6227946CTGCAAACA+3.11
pha-4MA0546.1chrI:6228128-6228137GTGCAAAAA+3.17
pha-4MA0546.1chrI:6227816-6227825AGACCAACA+3.42
pha-4MA0546.1chrI:6227879-6227888ATACAAATA+3.67
pha-4MA0546.1chrI:6227766-6227775GTTTATATT-3.83
pha-4MA0546.1chrI:6226978-6226987GTTTACATT-5.07
pha-4MA0546.1chrI:6227526-6227535GTTTACTTT-5.52
skn-1MA0547.1chrI:6228029-6228043AAGTGTTGAAAACT+3.69
skn-1MA0547.1chrI:6227582-6227596TTATGAAGACAATT+3.88
skn-1MA0547.1chrI:6228327-6228341AAATTCATCAATTT-4.11
skn-1MA0547.1chrI:6227771-6227785TATTGATGAGAAAA+4.59
sma-4MA0925.1chrI:6228337-6228347ATTTCTGTAT+3.04
sma-4MA0925.1chrI:6228271-6228281ACCAGAAAAA-3.18
unc-62MA0918.1chrI:6228117-6228128AAAGACAGCAA-3.24
unc-62MA0918.1chrI:6228135-6228146AAAGACAGCAA-3.24
unc-86MA0926.1chrI:6228292-6228299TACATAT-3.06
unc-86MA0926.1chrI:6227886-6227893TATCCAT+3.14
unc-86MA0926.1chrI:6227418-6227425TTCCTAA-3.37
unc-86MA0926.1chrI:6227228-6227235TAGTCAT+3.51
unc-86MA0926.1chrI:6226672-6226679TATGAAT+3.87
unc-86MA0926.1chrI:6226953-6226960TATTCAT+3.87
unc-86MA0926.1chrI:6227506-6227513TATTCAT+3.87
vab-7MA0927.1chrI:6227387-6227394TAATCAA+3.13
vab-7MA0927.1chrI:6227498-6227505TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrI:6228483-6228493AAAATTAACT-3.1
zfh-2MA0928.1chrI:6227496-6227506AATAATTAAA+3.54
zfh-2MA0928.1chrI:6227497-6227507ATAATTAAAT-3.72
Enhancer Sequence
GTGGAAAGCT TTTCACTACA AAGTTGTTCT TCACAATGAG AACTACCAAA TTTTAGTTGG 60
TCATTTTGTT ATAGAAATTT TTCGCACGGA GATATAGGCT GATCTTATTT TACATCATAC 120
CAGTTCTAAC ATACCTACGT TTTTTATATG AATCAAGGGT GGGCGGCAAT TGCCGTTCGG 180
CAAATTGATT TGTCGACAAA TTCGGCAAAT TGCCGATTTG CCGGAATATT TCAATTCCGG 240
CAATTTGCCG ATTTGCCGGA ATATGAACTC GTGTTCTGAA CATTAGATCT GGACTAACAT 300
CAAATTTTGC ACTTCTCTTT AACATCTGAT CAATATTTGA GAAATTTCTA AAAAACAACT 360
TTTTCGAAAG TTTTGCACGG TATTTTTTTC TCAAAAAATC GGAAAAGTTA TTTCAAAAAT 420
TATCAAATAT TCATCAGATT TTGTAGAAAT ATGTTTACAT TGTTGTTGCT ACAAAATTTC 480
TTGTCAAATT CGTTGCGTTC GATATAGTAT GAACCAAAAT GGCAACCAAA AAAAGGTGCC 540
ATTTTTCGAT TTTCGATGTT TTTCAGAAAA AAAATCTGAA AAAAATTTAC TTTATCTCGA 600
CCTTAACACT ACTTTATCTC GACCAACAAA TGTTTTTATA AGAAACACTC AACTACAAAA 660
TTGCACTTTA GATTAAAATG AACAACTTTA TAGTTGATCA CATAGTCATG AAATATTTTT 720
CCACGGAGAT ATAGGTATCC GAAGTGAATT CGTTTTTTTG AACTTAGGGG TTCTACTAGA 780
CCTCAGGTTT TCGTCTGAAA TCGTGTGCAG AACATTGAGA CTAAAAACAA CCAAACAAAA 840
ATTGCACTTT TCTAAAAGAT CTAATCAAAA TTTGAAAAGT TTTCAAAAAA AATTCCTAAA 900
AAAATTTTGA AAAAGTTTTG TGAGGGACCC TTTGAATTTT TTGTCAAAAA TCGGAAAAAA 960
AAATTTCAAA AATAATTAAA TATTCATCAG ATATAAATAT GTTTACTTTA ATGTTTTTGC 1020
ATCAACAAGC ATAATTGTGT CTTTATTCAA ACTGATTTAT GAAGACAATT TATTTAATCC 1080
TTTTATCATA AAAAATTTTT GAATATTTTT TACAGATTTT ATAGCAAAAT ATAACTCTAA 1140
AAAGTACTGA AAAAAAAGTT TGTCACCTGG AAACTTTGGA GACTTTGTCT CCTCAAAGTT 1200
TGTCATCTCG GAGACCGGGC TTTTTTTTGA ATCTAATTTT GTTTATATTG ATGAGAAAAA 1260
CATAATATTT TCCACAAAAA AGAAGAACAA AGACCAACAT TTTATGCTAA TTTTTGAAAA 1320
ATCGAAAATT TTTTCGAAAT ATTGGAAAAT CGAATACAAA TATCCATTTT TTCAAAAATC 1380
AAAACATCCC AATTTTTTCG TTTTCGATTT TCTGCAAACA TCGAAAAACC GACACCCTTG 1440
GTAGGAACTA GCAAAATTGT GTTGCTCTAT AAAGTTAAGC AGTTTTTAAA AAAATAGTGG 1500
GGAAAGTGTT GAAAACTACT CCTCTAAGAA ACAAAAAAAT TTTTGAAAAA TTGAACGCGG 1560
GAAATTAGAT AAAAATGCCG TTGAAAAATG AAAAGACAGC AAGTGCAAAA AAGACAGCAA 1620
GTGCACTCCG CCTAACTGTT TTGGAAGTTT CGGGAGGCAA AACTCGCCAA CGTTGCCAAG 1680
TAGTGATGTG TGTGTATTTA AGTTAGCTGT TATATTATAT GAAAAATACA AATCAATTTC 1740
AAAAAACCAG AAAAAATCGT AAGGAATACA TATTTCTTAA ATTTCTTTTT CAGGTTTCCC 1800
GAAATTCATC AATTTCTGTA TTGTCTCTCT AAACTCTCCA GCCTTGATTT ACATGCCAGT 1860
TGGCTTCAGG CTGGTGACCC CCCCCCCCCC CTCCCCCACT GTCCGAGACT TAGGTCCTAT 1920
TACAGATTGT AAACTAAACT TTGAACCCCA TATTTGGAAA ATTAACTACC AGGTCAGGCT 1980
AAACAAATCC TCAAGAC 1997