EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00341 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:5831007-5831895 
TF binding sites/motifs
Number: 53             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:5831146-5831156TTTCCATTAC-3.13
blmp-1MA0537.1chrI:5831537-5831547ATTCGCTTCT-3.15
blmp-1MA0537.1chrI:5831636-5831646TTTCTCCCCC-3.29
blmp-1MA0537.1chrI:5831611-5831621CTTCTTTTTT-4.07
blmp-1MA0537.1chrI:5831651-5831661TTTCCTTTTT-4.7
blmp-1MA0537.1chrI:5831137-5831147TTTCAATTTT-4.82
ceh-22MA0264.1chrI:5831781-5831791TTGAATTGGG-3.38
ceh-48MA0921.1chrI:5831558-5831566TATTGGTT-4
ces-2MA0922.1chrI:5831120-5831128TGTGTAAT-3.08
che-1MA0260.1chrI:5831541-5831546GCTTC-3.2
che-1MA0260.1chrI:5831726-5831731AAACC+3.36
dsc-1MA0919.1chrI:5831199-5831208TTAATTGAT+3.43
dsc-1MA0919.1chrI:5831199-5831208TTAATTGAT-3.43
elt-3MA0542.1chrI:5831382-5831389TTCATCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:5831015-5831022CTCATCA+3.35
elt-3MA0542.1chrI:5831616-5831623TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:5831802-5831809TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:5831258-5831265GATAACA-4.15
eor-1MA0543.1chrI:5831164-5831178ATCTATGTCTCGAA-3.42
eor-1MA0543.1chrI:5831281-5831295TTCTTATTCTTTTG-3.8
eor-1MA0543.1chrI:5831631-5831645GTCTTTTTCTCCCC-4.08
eor-1MA0543.1chrI:5831085-5831099AAGTGACATAGACA+4.15
eor-1MA0543.1chrI:5831705-5831719AAGAGACGCAGAAT+5.54
fkh-2MA0920.1chrI:5831460-5831467TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:5831554-5831561TTTTTAT-3.13
fkh-2MA0920.1chrI:5831463-5831470TTTTTAC-3.4
fkh-2MA0920.1chrI:5831223-5831230TCAACAA+3.66
lim-4MA0923.1chrI:5831200-5831208TAATTGAT-3.5
mab-3MA0262.1chrI:5831528-5831540TTCCGCACCATT-3.65
mab-3MA0262.1chrI:5831290-5831302TTTTGCAACAAT-4.74
pal-1MA0924.1chrI:5831666-5831673TTATGAT-3.09
pal-1MA0924.1chrI:5831885-5831892TTATTTC-3.12
pal-1MA0924.1chrI:5831127-5831134TCATTAA+3.26
pal-1MA0924.1chrI:5831572-5831579TTATTGT-3.46
pal-1MA0924.1chrI:5831316-5831323TTATTAC-4.57
pha-4MA0546.1chrI:5831121-5831130GTGTAATCA+3.01
pha-4MA0546.1chrI:5831208-5831217ATTTATTAA-3.3
pha-4MA0546.1chrI:5831559-5831568ATTGGTTTT-3.52
pha-4MA0546.1chrI:5831220-5831229AAATCAACA+3.64
pha-4MA0546.1chrI:5831690-5831699GAGCACATA+3
skn-1MA0547.1chrI:5831062-5831076AATTGATCACAATG+3.08
skn-1MA0547.1chrI:5831371-5831385ATTTTCGTCATTTC-3.11
sma-4MA0925.1chrI:5831736-5831746GACAGTCACG-3.07
sma-4MA0925.1chrI:5831091-5831101CATAGACAAT-3.19
sma-4MA0925.1chrI:5831325-5831335TTGACTGGGG+3.61
unc-62MA0918.1chrI:5831025-5831036AATTGTCAAAT+3.04
unc-62MA0918.1chrI:5831733-5831744ACTGACAGTCA-3.4
unc-86MA0926.1chrI:5831507-5831514TTACTAT-3.04
unc-86MA0926.1chrI:5831130-5831137TTAATAT-3.47
vab-7MA0927.1chrI:5831127-5831134TCATTAA+3.43
zfh-2MA0928.1chrI:5831250-5831260CAAATTATGA-3.01
zfh-2MA0928.1chrI:5831195-5831205AAAATTAATT-3.16
zfh-2MA0928.1chrI:5831198-5831208ATTAATTGAT+3.31
Enhancer Sequence
GCGACTATCT CATCACTAAA TTGTCAAATA TCTTTTATTG GGAAATCACA GATCAAATTG 60
ATCACAATGC GCATTGTCAA GTGACATAGA CAATTTTAAT GTGTTATGAA GTATGTGTAA 120
TCATTAATAT TTTCAATTTT TTCCATTACT AACAAATATC TATGTCTCGA AGTTTTTTTT 180
TTCCATTAAA AATTAATTGA TATTTATTAA GAAAAATCAA CAATCAGAAT TCGTTCTCGA 240
CTACAAATTA TGATAACAAG AACGTTCTTT TGATTTCTTA TTCTTTTGCA ACAATCGAGA 300
ATTTCTGATT TATTACCCTT GACTGGGGTC CAACCACCAT GTCGAATTAC ACCTTTTTCT 360
AAAAATTTTC GTCATTTCAT CACGTGATAT TCTATATACG TGATGATATA GTTTGACTTT 420
AGAAATCACA TTATTTTGAA AATAGTCTTT TTTTGTTTTT TACGCTGAAA TTTTGGAGAT 480
AGGAAATTCA AAATTCACGA TTACTATAAG ATTAAAACAA TTTCCGCACC ATTCGCTTCT 540
AAAAACGTTT TTATTGGTTT TTGTTTTATT GTTTCACATT CAAAAATTTC TCAAATTGTT 600
CCCCCTTCTT TTTTCAAAGC GGAGGTCTTT TTCTCCCCCC ACGTTTTCCT TTTTTGTAGT 660
TATGATGTGA GACTGATGCT ACAGAGCACA TAGATCTAAA GAGACGCAGA ATGAACAAGA 720
AACCCCACTG ACAGTCACGG CTAGGAAATA TTCGTGTCAG GATTATTTCG AAGTTTGAAT 780
TGGGTTTGAT ATATTTTTTT CATAAGTTTT AAAAATTATT AAGTTCTCAT ATAGAAGATT 840
GACGAGGTAT GGGGAATATA TTTAAATATC TCCAAAATTT ATTTCTTA 888