EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00276 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:3760939-3761640 
TF binding sites/motifs
Number: 57             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:3761183-3761193TAAAAGAAAA+3.29
blmp-1MA0537.1chrI:3761167-3761177AAATTGATGA+3.38
blmp-1MA0537.1chrI:3761551-3761561CTTCTATTTT-3.89
blmp-1MA0537.1chrI:3761593-3761603TCTCATTTTT-4.88
blmp-1MA0537.1chrI:3761301-3761311AAAGGGAAAA+5.25
ceh-22MA0264.1chrI:3761314-3761324TTGAAGGGGG-3.16
ceh-48MA0921.1chrI:3761258-3761266TATTGAGC-3.11
ceh-48MA0921.1chrI:3761090-3761098ATCGATTT+3.4
ceh-48MA0921.1chrI:3761381-3761389TATCGATG-3.56
ceh-48MA0921.1chrI:3761089-3761097AATCGATT-3.67
ces-2MA0922.1chrI:3761179-3761187TATGTAAA-3.64
ces-2MA0922.1chrI:3761253-3761261TTCGTTAT-3
ces-2MA0922.1chrI:3761178-3761186TTATGTAA+4.68
che-1MA0260.1chrI:3761510-3761515AAACC+3.36
dsc-1MA0919.1chrI:3761214-3761223CTAATGAAT+3.11
dsc-1MA0919.1chrI:3761214-3761223CTAATGAAT-3.11
dsc-1MA0919.1chrI:3761281-3761290ATAATTAAA+3.39
dsc-1MA0919.1chrI:3761281-3761290ATAATTAAA-3.39
efl-1MA0541.1chrI:3761146-3761160TTTCACGGAAAAAT+3.33
efl-1MA0541.1chrI:3761482-3761496TTTTCCCGCCAGAG-6
elt-3MA0542.1chrI:3761591-3761598TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:3761144-3761151TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:3761390-3761397GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:3761348-3761362GTTTCTGACTCTAA-3.35
eor-1MA0543.1chrI:3761592-3761606TTCTCATTTTTTCG-3.36
eor-1MA0543.1chrI:3760944-3760958AAAAGACAGAAAGT+3.59
eor-1MA0543.1chrI:3761187-3761201AGAAAACAAAGACA+3.79
fkh-2MA0920.1chrI:3761010-3761017TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:3761557-3761564TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:3761208-3761215TAAAAAC+3.13
fkh-2MA0920.1chrI:3761189-3761196AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:3761569-3761576TGTATAC-3.45
fkh-2MA0920.1chrI:3760985-3760992TAAAAAA+3.4
lim-4MA0923.1chrI:3761214-3761222CTAATGAA+3.11
lim-4MA0923.1chrI:3761281-3761289ATAATTAA+3.71
lim-4MA0923.1chrI:3761215-3761223TAATGAAT-3
lim-4MA0923.1chrI:3761282-3761290TAATTAAA-3
lin-14MA0261.1chrI:3761121-3761126TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:3761194-3761206AAAGACAACATT-3.6
pal-1MA0924.1chrI:3761013-3761020TTATGAT-3.29
pal-1MA0924.1chrI:3761282-3761289TAATTAA+3.54
pha-4MA0546.1chrI:3760991-3761000ATGTAAACC+3.12
pha-4MA0546.1chrI:3761186-3761195AAGAAAACA+3.27
skn-1MA0547.1chrI:3761168-3761182AATTGATGAATTAT+4.47
sma-4MA0925.1chrI:3760948-3760958GACAGAAAGT-3
unc-62MA0918.1chrI:3761263-3761274AGCTGTAAGAA+3.61
unc-86MA0926.1chrI:3761204-3761211TTAATAA-3.32
unc-86MA0926.1chrI:3761421-3761428TATTAAT+3.47
unc-86MA0926.1chrI:3761540-3761547TGAATAT-3.87
unc-86MA0926.1chrI:3761453-3761460TGCCTAT-4.1
vab-7MA0927.1chrI:3761445-3761452TCATTGG-3.08
vab-7MA0927.1chrI:3761215-3761222TAATGAA+3.82
vab-7MA0927.1chrI:3761282-3761289TAATTAA+4.09
zfh-2MA0928.1chrI:3761422-3761432ATTAATTTTT+3.08
zfh-2MA0928.1chrI:3761039-3761049AATAATTTGT+3.09
zfh-2MA0928.1chrI:3761280-3761290GATAATTAAA+3.53
zfh-2MA0928.1chrI:3761281-3761291ATAATTAAAC-3.65
Enhancer Sequence
GTCTTAAAAG ACAGAAAGTA CAGTTCCAAT ATGCCGAATG AAACTGTAAA AAATGTAAAC 60
CATTTTCTAA ATTTTTATGA TTTTATTTTT AATTTTGAAA AATAATTTGT CAGATTTTTC 120
CGTAAAGAAA AGTTAAAATA AATTTTGAAT AATCGATTTT TAGACCAATT CCAGTTTCAG 180
CGTGTTCATT TTCGATGATC AAGTTTTTTT CACGGAAAAA TCTCTGAAAA ATTGATGAAT 240
TATGTAAAAG AAAACAAAGA CAACATTAAT AAAAACTAAT GAATTTATAA AACGCAAATT 300
CTACATTTTA CATTTTCGTT ATTGAGCTGT AAGAATTTAT AGATAATTAA ACTTTGAAGG 360
GAAAAGGGAA AAATATTGAA GGGGGAGTAG AGTTTGTGGG GAAATATATG TTTCTGACTC 420
TAATTTTGCC CCTGATGCCG AATATCGATG TGAAAAAATT CAAAAAAATT TCCCTGATTT 480
TATATTAATT TTTAAAATCC GAAAATTCAT TGGATGCCTA TATGTGAGTT TTCAAACGCT 540
GAATTTTCCC GCCAGAGACG CCCCGCCCAC GAAACCGTGC CGCAAGTGTG GGTTTACGAG 600
ATGAATATTT TCCTTCTATT TTTATTTGAT TGTATACCGA TTTTCGTCGA TTTTTCTCAT 660
TTTTTCGCTG TTTTATATGG AAATTTTTGT TATTTCTCTT A 701