EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00252 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:3201023-3201689 
TF binding sites/motifs
Number: 44             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:3201527-3201537CTTCTCCTTC-3.13
blmp-1MA0537.1chrI:3201529-3201539TCTCCTTCTC-3.95
blmp-1MA0537.1chrI:3201397-3201407AGAATGAGAA+4.17
blmp-1MA0537.1chrI:3201409-3201419TTTCATTTTT-5.14
ces-2MA0922.1chrI:3201445-3201453TGTTTAAT-3.04
ces-2MA0922.1chrI:3201496-3201504TATTTTAT-3
che-1MA0260.1chrI:3201381-3201386AAACG+3.06
che-1MA0260.1chrI:3201550-3201555GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:3201056-3201061GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrI:3201168-3201182AAAGTGTATGCGTT+3.22
daf-12MA0538.1chrI:3201174-3201188TATGCGTTTTTGGT+3.73
elt-3MA0542.1chrI:3201514-3201521TTTCTCA+3.02
elt-3MA0542.1chrI:3201475-3201482GATACAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:3201668-3201675TTTATCA+3.21
elt-3MA0542.1chrI:3201261-3201268GATAAAC-3.21
elt-3MA0542.1chrI:3201281-3201288CTTGTCA+3.45
elt-3MA0542.1chrI:3201648-3201655GACAAGA-3.45
eor-1MA0543.1chrI:3201555-3201569AAGAGAAATAGCCA+3.16
eor-1MA0543.1chrI:3201367-3201381GGCTATTTCTCTTG-3.16
eor-1MA0543.1chrI:3201329-3201343AAGAGATACAGCGG+3.24
eor-1MA0543.1chrI:3201593-3201607CGCTGTATCTCTTG-3.24
eor-1MA0543.1chrI:3201528-3201542TTCTCCTTCTCGAG-4.02
fkh-2MA0920.1chrI:3201146-3201153TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:3201452-3201459TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:3201445-3201452TGTTTAA-3.48
fkh-2MA0920.1chrI:3201285-3201292TCAACAT+3.6
fkh-2MA0920.1chrI:3201644-3201651TGTTGAC-3.6
fkh-2MA0920.1chrI:3201152-3201159TATACAG+3
pal-1MA0924.1chrI:3201500-3201507TTATTAC-4.57
pha-4MA0546.1chrI:3201292-3201301GTTAACATA-3.03
pha-4MA0546.1chrI:3201635-3201644GTGTTAACA+3.05
pha-4MA0546.1chrI:3201282-3201291TTGTCAACA+3.33
pha-4MA0546.1chrI:3201645-3201654GTTGACAAG-3.33
skn-1MA0547.1chrI:3201641-3201655ACATGTTGACAAGA+4.42
skn-1MA0547.1chrI:3201281-3201295CTTGTCAACATGTT-4.42
sma-4MA0925.1chrI:3201126-3201136TATAGACAGG-3.33
snpc-4MA0544.1chrI:3201586-3201597TGTCTTCCGCT+4.45
snpc-4MA0544.1chrI:3201339-3201350GCGGAAGACAC-4.45
unc-62MA0918.1chrI:3201127-3201138ATAGACAGGCC-3.13
unc-62MA0918.1chrI:3201422-3201433ACTTACAGTTC-3.48
unc-86MA0926.1chrI:3201110-3201117TGCATAC-3.03
unc-86MA0926.1chrI:3201468-3201475TGCATGT-3.18
unc-86MA0926.1chrI:3201466-3201473TATGCAT+4.66
vab-7MA0927.1chrI:3201518-3201525TCATGAA+3.29
Enhancer Sequence
TCCCGTCAAA ACTTATGGGC CTCACCACGA TGGGTTTCAC TCACAACTCT CACTAACGTT 60
GGTTGTGGCG TTACAGACTA CAAAGACTGC ATACACTACA AACTATAGAC AGGCCCCCTA 120
CTATTTTTAT ATACAGTGGT GGCCAAAAGT GTATGCGTTT TTGGTTTTTG CTAATTCTTC 180
ATAATTTTCA AATGAGTATA ACTCATAAAC TAAGCACTAT AGAAAGAAAA ATTTAACTGA 240
TAAACTGTTG CTTAGAATCT TGTCAACATG TTAACATATG ATTCAACATT TCAAAAAATT 300
CAGGTCAAGA GATACAGCGG AAGACACCTC GCGAGTCCAT TTTTGGCTAT TTCTCTTGAA 360
ACGCCTGTAG CTCGAGAATG AGAAGTTTTC ATTTTTTAAA CTTACAGTTC TATTCTACAG 420
GTTGTTTAAT AAAAAAACGA CTATATGCAT GTGATACAAA AATATTTGCA GATTATTTTA 480
TTACTAAAAC TTTTCTCATG AAAACTTCTC CTTCTCGAGC TACAGGCGTT TCAAGAGAAA 540
TAGCCAAAAA TGGACTCGCG AGGTGTCTTC CGCTGTATCT CTTGACCTGA ATTTTTTGAA 600
ATGTTGAATC ATGTGTTAAC ATGTTGACAA GATTCTAAGC AACAGTTTAT CAGTTAAATT 660
TTTCTC 666