EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00235 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:2828732-2829628 
TF binding sites/motifs
Number: 46             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:2829431-2829441AAAATGAGTA+3.48
blmp-1MA0537.1chrI:2829600-2829610TCTCGATTTT-3.53
blmp-1MA0537.1chrI:2828861-2828871TTTCGATTTT-3.57
blmp-1MA0537.1chrI:2828842-2828852TCTCATTTTT-3.86
blmp-1MA0537.1chrI:2828958-2828968TCTCATTTTT-4.87
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:2828830-2828843TAGGGTTAATTAT+4.22
ceh-22MA0264.1chrI:2829210-2829220TTCAAGTACT-3.81
ces-2MA0922.1chrI:2829298-2829306TGCGTAAC-3.23
ces-2MA0922.1chrI:2829329-2829337TGCGTAAG-3.23
ces-2MA0922.1chrI:2829320-2829328TTATGTCA+3.27
ces-2MA0922.1chrI:2829053-2829061TACATAAT-3.34
ces-2MA0922.1chrI:2829052-2829060ATACATAA+3.43
ces-2MA0922.1chrI:2829321-2829329TATGTCAT-3.55
ces-2MA0922.1chrI:2829328-2829336TTGCGTAA+3.59
ces-2MA0922.1chrI:2829313-2829321TACGTCAT-3.7
daf-12MA0538.1chrI:2829185-2829199GAGCACACACAGAC-3.41
dsc-1MA0919.1chrI:2828835-2828844TTAATTATC+3.74
dsc-1MA0919.1chrI:2828835-2828844TTAATTATC-3.74
dsc-1MA0919.1chrI:2829572-2829581TTAATTAAT+3.84
dsc-1MA0919.1chrI:2829572-2829581TTAATTAAT-3.84
efl-1MA0541.1chrI:2829103-2829117TTTGGCGCCAAGTT+4.51
efl-1MA0541.1chrI:2829102-2829116TTTTGGCGCCAAGT-4.64
efl-1MA0541.1chrI:2829584-2829598AATTCCCGCGCTTT-5.69
elt-3MA0542.1chrI:2828747-2828754TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrI:2829261-2829275GGGATTCGGAGAGA+3.39
eor-1MA0543.1chrI:2829269-2829283GAGAGACGCAGATG+5.41
fkh-2MA0920.1chrI:2829478-2829485TAAAAAA+3.3
lim-4MA0923.1chrI:2828835-2828843TTAATTAT+3.24
lim-4MA0923.1chrI:2829572-2829580TTAATTAA+3.59
lim-4MA0923.1chrI:2828836-2828844TAATTATC-3.71
lim-4MA0923.1chrI:2829573-2829581TAATTAAT-3.75
lin-14MA0261.1chrI:2829290-2829295AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrI:2829284-2829289TGTTC-3.62
pal-1MA0924.1chrI:2828836-2828843TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrI:2829185-2829194GAGCACACA+3.04
skn-1MA0547.1chrI:2829596-2829610TTTGTCTCGATTTT-3.63
sma-4MA0925.1chrI:2829026-2829036ATTTCTAGCA+3.16
vab-7MA0927.1chrI:2829573-2829580TAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:2829573-2829580TAATTAA-3.22
vab-7MA0927.1chrI:2829317-2829324TCATTAT-3
vab-7MA0927.1chrI:2828836-2828843TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:2829575-2829585ATTAATTTAA+3.28
zfh-2MA0928.1chrI:2828835-2828845TTAATTATCT-3.48
zfh-2MA0928.1chrI:2829571-2829581TTTAATTAAT+3.84
zfh-2MA0928.1chrI:2828834-2828844GTTAATTATC+3.86
zfh-2MA0928.1chrI:2829572-2829582TTAATTAATT-4.38
Enhancer Sequence
TTCATTTTTC CAGATTTTTT CATGAAAACT CCGATTTTAA AGAGATTTTT CGGTAATTTT 60
CACAATTTTT AGTTAAAATT CTTCAAAACT CAATTTTATA GGGTTAATTA TCTCATTTTT 120
CCTTCAAAAT TTCGATTTTT GAAAGCGATT TTTCGCAAAT TTTCACAATT TTCAGTTAAA 180
AATATTTTAA AATTCAACTT TTATAGTGAT ATCCGAGTTC AAAACCTCTC ATTTTTTAGA 240
TTTTTCAATT GAAAATTCGA TTTTAAAGCG ATTTTTCGTA AAATTTTAAA AGGAATTTCT 300
AGCACCTCTA AAGGCCTGAA ATACATAATT TTTTAGATTT TTCCATTCAC AGATCTCAAA 360
AAAGGTCAAT TTTTGGCGCC AAGTTCAAAT TTCTCAGATC AATTTTGAAT ATTATCCAAT 420
TCTTAATCCT TTCGCACCCC TATACAGTCT ATTGAGCACA CACAGACGGA CCAACTTGTT 480
CAAGTACTCA CGACGGATTA GCACACAAGA TAACGGACCG AGATAGTATG GGATTCGGAG 540
AGACGCAGAT GGTGTTCGAA CACCGTTGCG TAACATCCTT TTACGTCATT ATGTCATTGC 600
GTAAGGCCCG GGACCATCAG GTCAATTCTT AGGGGTGTTT TGAAATTAGC ATGGATTTTT 660
TTAATAGAAA ATAGTGAAAA CCGGAAAAAA AATTGGTTAA AAATGAGTAA ATTTCATTTA 720
TAAAGTGTTA GAAATACTTT AAAATATAAA AAATGGCGAA AAATCGCTTT AAAATTGGTT 780
GAAATTCAAA ATAACACTGA AAATACTCAA ATTTGTCAAA AAAAAATATT TTAGCGATTT 840
TTAATTAATT TAAATTCCCG CGCTTTTGTC TCGATTTTGA ACTCCGCCCA TAAAAC 896