EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00233 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:2745582-2746724 
TF binding sites/motifs
Number: 58             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:2746000-2746010TCTCCATTAC-3.06
blmp-1MA0537.1chrI:2746694-2746704GAGGAGAAAT+3.15
blmp-1MA0537.1chrI:2746692-2746702GAGAGGAGAA+3.22
blmp-1MA0537.1chrI:2745994-2746004CTTCATTCTC-3.65
blmp-1MA0537.1chrI:2746066-2746076TCTCAATTTC-3.76
ceh-48MA0921.1chrI:2746032-2746040ATCAATTT+3.03
ceh-48MA0921.1chrI:2746610-2746618TATTGAGT-3.03
ceh-48MA0921.1chrI:2745643-2745651CATCGATC-3.05
ceh-48MA0921.1chrI:2745872-2745880TATTGGTT-3.69
ces-2MA0922.1chrI:2746006-2746014TTACACCA+3.01
ces-2MA0922.1chrI:2746240-2746248ATATATAA+3.12
ces-2MA0922.1chrI:2745868-2745876TATATATT-3.12
ces-2MA0922.1chrI:2746234-2746242TTCATAAT-3.25
ces-2MA0922.1chrI:2746241-2746249TATATAAT-3.3
daf-12MA0538.1chrI:2746124-2746138AGTGGGGTTGCATT+3.01
daf-12MA0538.1chrI:2746261-2746275AGGGTGTTTGTTCG+4.62
dsc-1MA0919.1chrI:2746193-2746202GCAATTAGA+3.06
dsc-1MA0919.1chrI:2746193-2746202GCAATTAGA-3.06
dsc-1MA0919.1chrI:2745985-2745994GTAATTAGT+3.95
dsc-1MA0919.1chrI:2745985-2745994GTAATTAGT-3.95
efl-1MA0541.1chrI:2746680-2746694AACTCCCGTGGGGA-3.24
efl-1MA0541.1chrI:2745612-2745626TAAGCCGCCAAAAT+3.39
efl-1MA0541.1chrI:2745800-2745814TAAGCCGCCAAAAT+3.39
efl-1MA0541.1chrI:2746650-2746664TTTTTGCGCGACGG-3.95
elt-3MA0542.1chrI:2745951-2745958GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:2746104-2746111GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:2746472-2746479GTTATCA+3.2
elt-3MA0542.1chrI:2745775-2745782GATAACT-3.2
elt-3MA0542.1chrI:2746455-2746462TTTTTCA+3
eor-1MA0543.1chrI:2746065-2746079GTCTCAATTTCCTA-3.37
fkh-2MA0920.1chrI:2746162-2746169TAAAAAA+3.3
lim-4MA0923.1chrI:2746169-2746177TAATTGGA-3.1
lim-4MA0923.1chrI:2745986-2745994TAATTAGT-3.31
lim-4MA0923.1chrI:2746193-2746201GCAATTAG+3.88
lim-4MA0923.1chrI:2746245-2746253TAATTATG-3
lim-4MA0923.1chrI:2745985-2745993GTAATTAG+4.11
lin-14MA0261.1chrI:2745653-2745658AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:2746318-2746323AACAT+3.14
pha-4MA0546.1chrI:2746266-2746275GTTTGTTCG-3.58
skn-1MA0547.1chrI:2745989-2746003TTAGTCTTCATTCT-4.77
sma-4MA0925.1chrI:2745973-2745983CCTAGAAAAA-3.01
sma-4MA0925.1chrI:2746394-2746404ATTTCTAGTA+3
unc-62MA0918.1chrI:2745712-2745723AATTGTCAACT+3.1
unc-62MA0918.1chrI:2746041-2746052TCATGTCATTG+3.44
unc-86MA0926.1chrI:2746498-2746505TATGAAT+3.58
vab-7MA0927.1chrI:2745986-2745993TAATTAG+3.02
vab-7MA0927.1chrI:2746169-2746176TAATTGG-3.03
vab-7MA0927.1chrI:2746245-2746252TAATTAT+3.29
vab-7MA0927.1chrI:2746245-2746252TAATTAT-3.29
vab-7MA0927.1chrI:2746194-2746201CAATTAG-3.38
vab-7MA0927.1chrI:2745986-2745993TAATTAG-4.31
zfh-2MA0928.1chrI:2746699-2746709GAAATTAGTC-3.01
zfh-2MA0928.1chrI:2745739-2745749AATAATTTGC+3.06
zfh-2MA0928.1chrI:2746167-2746177AATAATTGGA+3.13
zfh-2MA0928.1chrI:2746243-2746253TATAATTATG+3.26
zfh-2MA0928.1chrI:2746244-2746254ATAATTATGA-3.27
zfh-2MA0928.1chrI:2745985-2745995GTAATTAGTC-3.75
zfh-2MA0928.1chrI:2745984-2745994CGTAATTAGT+3.82
Enhancer Sequence
TTTTTTGATA TCTTCCAAAA ACCTAAGATA TAAGCCGCCA AAATAAATGA GGGACATGGT 60
GCATCGATCG GAACATAGAG AAGTGTAACT TTGGCAGCTC ACATCTTGGT TGTCTTTGGT 120
TTTACAGAAA AATTGTCAAC TAACAAACTA TTTTGGAAAT AATTTGCTAC AGGTTTGTAG 180
TTAAAATTTT CTTGATAACT ACAAATTGAG CTGAGATATA AGCCGCCAAA ATATATGAGC 240
CACATGGTGC ATCGACCCGA ACTAGAGAAG TTTAACTTTG GGAGCTTATA TATTGGTTGC 300
CGTAGGGGTT CTCAAAAATT TTCAAACCAT TGGAAAGAAC CTAGATATGC GCCTCCAAAT 360
CGCAGCGATG AGAAAATGCA CGAGGTCCTA ACCTAGAAAA ACCGTAATTA GTCTTCATTC 420
TCCATTACAC CACCACCACC CCTTATTCGA ATCAATTTTT CATGTCATTG TCTCCCCCCC 480
CTTGTCTCAA TTTCCTACAG TGGGAACCGC CTGGTGACGA CTGACAAAAT AGCGACAAAA 540
GAAGTGGGGT TGCATTTCCT TCCACGATAT ATAGATAGAA TAAAAAATAA TTGGAGCACA 600
TGGGATGAGG GGCAATTAGA AGCTCGTTTT TCATAGTTTA TCCCTAGTTC CTTTCATAAT 660
ATATAATTAT GACAGAAGGA GGGTGTTTGT TCGGCGATCA GAAATTATGG TGTATTGTTC 720
AATTTTTAAA AATTTGAACA TTGCAAATGG CAAGTTCGTA CTCAGAAACT TGGTGCATGG 780
ACCATTTTTT AGAGGAAAGT TTGTCCTTAA AAATTTCTAG TAATATTAAA ACAGATTCGT 840
TGAAAACCTG AGCAAAATTG TTGAGCAAAT TTTTTTTTCA GCTGTAGGAA GTTATCAAAG 900
GCTTACTGAA ATACATTATG AATAGATTTT CGCGAAAATT GAACAAAAAC CTTTGCAGTT 960
TAAAAGCATG GTGCATCGAC TAACCCCAAT TGGAAGTCTT CCTATGATTC TCTACAGTAG 1020
CTTTCCCATA TTGAGTGTTA GTAATCACTA CAAACATACA ATATGAACTT TTTGCGCGAC 1080
GGAAGGAAAA GGCCAAAAAA CTCCCGTGGG GAGAGGAGAA ATTAGTCACA AAGTCAGATT 1140
GA 1142