EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00106 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:1368644-1369342 
TF binding sites/motifs
Number: 42             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:1368984-1368994AGATTGAGTA+3.11
blmp-1MA0537.1chrI:1368953-1368963AGAAAGATGA+3.17
blmp-1MA0537.1chrI:1368956-1368966AAGATGAATA+3.1
blmp-1MA0537.1chrI:1368966-1368976GGAGAGAGAG+3.78
blmp-1MA0537.1chrI:1368964-1368974TAGGAGAGAG+3
blmp-1MA0537.1chrI:1368968-1368978AGAGAGAGAG+4.43
blmp-1MA0537.1chrI:1369137-1369147TTTCGTTTTT-4.52
blmp-1MA0537.1chrI:1369157-1369167TTTCGTTTTT-4.55
ceh-48MA0921.1chrI:1368889-1368897TATTGATA-3.12
ceh-48MA0921.1chrI:1368726-1368734ACCGATTT+3.22
che-1MA0260.1chrI:1369064-1369069GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrI:1368840-1368854AATGTGTCTGTTTT+4.44
efl-1MA0541.1chrI:1369120-1369134GTTTTCCGCCTGTT-3.69
elt-3MA0542.1chrI:1368893-1368900GATAGAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:1368927-1368934GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:1369204-1369211GCTAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:1369180-1369187GATAAAT-3.23
elt-3MA0542.1chrI:1368904-1368911GATAAGA-4.66
eor-1MA0543.1chrI:1368959-1368973ATGAATAGGAGAGA+3.29
eor-1MA0543.1chrI:1369158-1369172TTCGTTTTTTCTTA-3.31
eor-1MA0543.1chrI:1368843-1368857GTGTCTGTTTTTTT-3.39
eor-1MA0543.1chrI:1369155-1369169TTTTTCGTTTTTTC-3.43
eor-1MA0543.1chrI:1368845-1368859GTCTGTTTTTTTTC-4.33
eor-1MA0543.1chrI:1368965-1368979AGGAGAGAGAGAGT+4.57
eor-1MA0543.1chrI:1368944-1368958CAAAGACAGAGAAA+4.58
fkh-2MA0920.1chrI:1368829-1368836TTTTTAT-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:1369182-1369189TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:1369119-1369126TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrI:1369222-1369229TAAAAAA+3.4
lin-14MA0261.1chrI:1368898-1368903AACAG+3.01
lin-14MA0261.1chrI:1369017-1369022AACAT+3.14
pha-4MA0546.1chrI:1369131-1369140GTTTTCTTT-3.27
pha-4MA0546.1chrI:1368834-1368843ATTTGCAAT-3.51
pha-4MA0546.1chrI:1369183-1369192AAATAAATA+3.67
skn-1MA0547.1chrI:1368920-1368934CGTCGATGACAAAA+4.11
sma-4MA0925.1chrI:1368843-1368853GTGTCTGTTT+3.48
sma-4MA0925.1chrI:1369064-1369074GTTTCTAGGC+3.4
snpc-4MA0544.1chrI:1369083-1369094GGGGCCGACAA-3.57
snpc-4MA0544.1chrI:1368668-1368679AGTCGGGCGCC+4.11
unc-62MA0918.1chrI:1368742-1368753CGAGACATTTC-3.07
unc-86MA0926.1chrI:1369322-1369329TACATAT-3.06
zfh-2MA0928.1chrI:1368646-1368656AAAATTAGTT-3
Enhancer Sequence
GAAAAATTAG TTTTCAGCTC CAGAAGTCGG GCGCCGCGCC GGCGGTGCGG TCCAGGATAC 60
CGTGCAAAAT ATTTTAAAAA AAACCGATTT TTTCCGTTCG AGACATTTCC TCAAAAATTT 120
CAAATTCTCC CAACCCCGGT GGTCGATTGA CCGGATGACG TGGAGAGTTC GTTTTTTCGT 180
AACTATTTTT ATTTGCAATG TGTCTGTTTT TTTTCCACCA CTGCCCCCTT TCCTCCCACG 240
CATGCTATTG ATAGAACAGT GATAAGAGAA TGTGGACGTC GATGACAAAA TTGCATGTTT 300
CAAAGACAGA GAAAGATGAA TAGGAGAGAG AGAGTTCAAA AGATTGAGTA AAAGGATTAA 360
TAGAAAATTA GGGAACATGA AGCACTGCAA CTTTTTCCTC ACGAGGGACG AGGAAAAGTG 420
GTTTCTAGGC CATGGCCGAG GGGCCGACAA GTTTCAGCGG CCATTTATCT TGCTTTGTTT 480
TCCGCCTGTT TTCTTTCGTT TTTCACTGAT TTTTTTCGTT TTTTCTTAAT AAAACTGATA 540
AATAAATATT TTTCGCAGAT GCTAAAACAA TTTCCAAGTA AAAAAAGCAT GTATTCAGTG 600
GGCAAGCAGC GGTGAAAGTG GGCATTGTAA TATGATGGAT TACGGGAATA CAAAACCTAA 660
ACTTTTTCTG AAACATGATA CATATGCTGC TTAGATGC 698