EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00101 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:1349052-1350792 
TF binding sites/motifs
Number: 78             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:1349675-1349685AAAATGAATT+3.11
blmp-1MA0537.1chrI:1349517-1349527TCTCCTTCTC-3.35
blmp-1MA0537.1chrI:1350120-1350130AAAGGGAGTA+3.55
blmp-1MA0537.1chrI:1349062-1349072ATTCATTTTC-3.55
blmp-1MA0537.1chrI:1349121-1349131AAATCGAAAT+3.57
blmp-1MA0537.1chrI:1349612-1349622TTTCGATTTT-3.57
blmp-1MA0537.1chrI:1349302-1349312AAATCGAAAC+3.61
blmp-1MA0537.1chrI:1349434-1349444TTTCGATTTT-3.61
blmp-1MA0537.1chrI:1350501-1350511AAAGTGATGA+3.71
blmp-1MA0537.1chrI:1349954-1349964AAAAAGAAAT+3.97
blmp-1MA0537.1chrI:1350754-1350764CTTCTTTTTC-4.04
blmp-1MA0537.1chrI:1349649-1349659TTTCGATTTT-4.3
blmp-1MA0537.1chrI:1350332-1350342TTTCACTTTT-6.34
ceh-22MA0264.1chrI:1349902-1349912TTTGAGAGGT-3.25
ceh-48MA0921.1chrI:1350707-1350715TTCGATAC+3.07
ceh-48MA0921.1chrI:1349083-1349091TATCGAAA-3.29
ces-2MA0922.1chrI:1349329-1349337TTACGCAT+3.14
ces-2MA0922.1chrI:1349411-1349419TGCGTAAT-3.14
ces-2MA0922.1chrI:1350652-1350660TACAAAAT-3.19
ces-2MA0922.1chrI:1350651-1350659TTACAAAA+3.45
ces-2MA0922.1chrI:1350185-1350193TTTCGTAA+3.46
ces-2MA0922.1chrI:1350186-1350194TTCGTAAT-3.55
che-1MA0260.1chrI:1349183-1349188GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:1350645-1350650GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:1349280-1349285GTTTC-3.36
daf-12MA0538.1chrI:1350744-1350758CCTCAAACACCTTC-3.02
efl-1MA0541.1chrI:1349573-1349587AATGACGGAAAACT+3.12
efl-1MA0541.1chrI:1349156-1349170GTTTTCCGTCATTT-3.12
elt-3MA0542.1chrI:1349081-1349088TTTATCG+3.07
elt-3MA0542.1chrI:1350064-1350071TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:1349656-1349663TTTTTCA+3
elt-3MA0542.1chrI:1349948-1349955GAAAAAA-3
eor-1MA0543.1chrI:1349297-1349311GAGAAAAATCGAAA+3.28
eor-1MA0543.1chrI:1349435-1349449TTCGATTTTTCTCC-3.28
eor-1MA0543.1chrI:1349949-1349963AAAAAAAAAAGAAA+3.78
fkh-2MA0920.1chrI:1350516-1350523TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:1350512-1350519TAAATAA+3.07
fkh-2MA0920.1chrI:1350324-1350331TATTTAT-3.07
fkh-2MA0920.1chrI:1349201-1349208AAAACAA+3.23
fkh-2MA0920.1chrI:1349505-1349512TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrI:1349535-1349542TGTTTTC-3.23
fkh-2MA0920.1chrI:1349753-1349760TGTTTAA-3.28
fkh-2MA0920.1chrI:1350766-1350773TAAAAAA+3.3
hlh-1MA0545.1chrI:1349270-1349280CCAATTGCGG-3.39
hlh-1MA0545.1chrI:1349466-1349476CGCAGTTGGC+3.78
lim-4MA0923.1chrI:1350094-1350102ACAATTAA+3.28
lin-14MA0261.1chrI:1350738-1350743AACAC+3.62
lin-14MA0261.1chrI:1350167-1350172TGTTC-3.62
mab-3MA0262.1chrI:1350297-1350309GTGTTGCAATGT+3.72
mab-3MA0262.1chrI:1349431-1349443TTGTTTCGATTT+3.7
mab-3MA0262.1chrI:1350483-1350495GACCGCAATATT-3.9
pal-1MA0924.1chrI:1350648-1350655TCATTAC-3.17
pal-1MA0924.1chrI:1350442-1350449CCATAAA+3.21
pal-1MA0924.1chrI:1350394-1350401TTATGGT-3.21
pal-1MA0924.1chrI:1350224-1350231TTATGGC-3.32
pal-1MA0924.1chrI:1350095-1350102CAATTAA+3.42
pal-1MA0924.1chrI:1350612-1350619CCATAAA+3.51
pal-1MA0924.1chrI:1350729-1350736TAATAAA+3.63
pha-4MA0546.1chrI:1350492-1350501ATTTATTAA-3.3
pha-4MA0546.1chrI:1350342-1350351GAATAAATA+3.68
pha-4MA0546.1chrI:1350509-1350518GAATAAATA+3.68
pha-4MA0546.1chrI:1350325-1350334ATTTATTTT-3.76
skn-1MA0547.1chrI:1350049-1350063AAATTCAGCGTTTT-4.03
skn-1MA0547.1chrI:1350502-1350516AAGTGATGAATAAA+4.54
sma-4MA0925.1chrI:1349974-1349984AATAGACATT-3.08
sma-4MA0925.1chrI:1350528-1350538TCCAGACGTT-3.52
unc-62MA0918.1chrI:1350264-1350275AGCTGTAAAAT+3.32
unc-62MA0918.1chrI:1350568-1350579TTTTACAGCTG-3.32
unc-86MA0926.1chrI:1349717-1349724TGACTAA-3.37
unc-86MA0926.1chrI:1350508-1350515TGAATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrI:1349061-1349068TATTCAT+3.87
vab-7MA0927.1chrI:1350095-1350102CAATTAA+3.22
vab-7MA0927.1chrI:1350648-1350655TCATTAC-3.29
vab-7MA0927.1chrI:1350190-1350197TAATGAG-3.54
zfh-2MA0928.1chrI:1349939-1349949TTTAATTTTG+3.02
zfh-2MA0928.1chrI:1349841-1349851TTTAATTTAA+3.11
zfh-2MA0928.1chrI:1350097-1350107ATTAATTTTC+3.12
zfh-2MA0928.1chrI:1350094-1350104ACAATTAATT-3.19
Enhancer Sequence
CGAGAAAAAT ATTCATTTTC AGAATAAATT TTATCGAAAA ATAACCAAAA TGTATTTTTT 60
TTAAACCAAA AATCGAAATT TCGGCTATAT TAAAACTTTT AATAGTTTTC CGTCATTTTT 120
CGAGGCACCA CGTTTCCAAG ATCTAGTCGA AAACAAGATC TACGAGAAGA AGATCTACCA 180
AAACAAGATC TACGTTTTTA GGTTCTGGCA CCGCCGTGCC AATTGCGGGT TTCGCAGTTT 240
TCTCGGAGAA AAATCGAAAC ACAACGATGC TCCGATATTA CGCATCGCGC GTTATTTAGC 300
GTTTTCCAGA AGTTTTTCTT TAAAAAAATG ATTTTCTGAA TGCTAAACAA CGGGCGTGAT 360
GCGTAATATC GGAGCATCGT TGTTTCGATT TTTCTCCAAG AAAACTGCGA AAACCGCAGT 420
TGGCACGGTG CCAAATCCTG AAAACGTAGA TCTTGTTTTC GTAGATCTCC TTCTCGTAGA 480
TCTTGTTTTC GACTAGATCT TGAAAACGTG GTGCCTCGAA AAATGACGGA AAACTATTAA 540
AAGTTTTAAT ATAGCCGAAA TTTCGATTTT TGGTTAAAAA AAAACATTTT GGTGATTTTT 600
CGATTTTTTC AAAATTTATT TTGAAAATGA ATTTTTCTCG TCAAAAAATT ACATTTTGAG 660
AGCTATGACT AAAAATTTTA AAGTAAAATC CAAAAATTAT ATGTTTAAGA AAGCTTAAAA 720
ATTAAAAAAT TTAAGCTAAT TTTAATTTTT TTCTAACAAT TTCAGTTTTG AAGTTAAAAA 780
ATTCAATTCT TTAATTTAAA AAAAAAATAA GTTTTGAATT TAAAAAATTT AAAAAAAAAG 840
CTCAAAAGTT TTTGAGAGGT TCAAAATTCC GGAAAAATGG TTAAAGCTTT AATTTTGAAA 900
AAAAAAAGAA ATAATGCACC TAAATAGACA TTAAAACGTG TTATAAACTA CCAAAATGTA 960
CGAAAAACGG TTAAATAAAA GTTCACGATA TTCGGAAAAA TTCAGCGTTT TTTTTGTCAA 1020
AAATTTTGAA CCCCGCTGTA AAACAATTAA TTTTCTTTGA AATTTTTAAA AGGGAGTACC 1080
GAAATTTGAG ACTTTGATTT TTTAGACTCA AAATGTGTTC CAAAACTACC GAATTTCGTA 1140
ATGAGACGTT CTGGAAATTT CTTTAAAGAA AGTTATGGCG GCTCAAAGTT TTGAAAATAA 1200
TGGTCAATTT TCAGCTGTAA AATCAAAATT TTTTCCAACT TCTCGGTGTT GCAATGTCTT 1260
GAACTTAACT TTTATTTATT TTTCACTTTT GAATAAATAT TGTGATATTT TACTAGACGT 1320
ATAGTCGTTG ATTTAAGTAC ATTTATGGTC AGTGGGGCAC AAAATGTAAC GTTTATTTGT 1380
GCCCCAAAGA CCATAAATGT ACTTAAATCA ACGAATAAAC GCCTAATAAA AGACCGCAAT 1440
ATTTATTAAA AAGTGATGAA TAAATAAAAA TTAGGTTCCA GACGTTGCGA CACCGAGAAG 1500
TTGGAAAATA TTTTGATTTT ACAGCTGAAA ATGGGCCTTA TTTTGCCGAA CTTTGAACCG 1560
CCATAAATCT TTTTTTTGAG AAATTTTCAG AACGTTTCAT TACAAAATTC GGTAGTTTTG 1620
GACCAATTTT GGTCTAAAAA GGTAAAGTCT CAAGTTTCGA TACTCCACCT TTAAGTATAA 1680
TAAAGGAACA CACCTCAAAC ACCTTCTTTT TCAATAAAAA AAAACAGATT TACTCAACAT 1740