EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00050 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:677484-678365 
TF binding sites/motifs
Number: 55             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:677502-677512AAAATGATAA+4.03
ceh-48MA0921.1chrI:677517-677525TATCGAAA-3.07
ceh-48MA0921.1chrI:677975-677983TTCAATAT+3.27
ceh-48MA0921.1chrI:678166-678174ACCGATAA+4.8
ceh-48MA0921.1chrI:677969-677977TATCGATT-5.22
ces-2MA0922.1chrI:677744-677752TGCGTACT-3.07
ces-2MA0922.1chrI:677861-677869TTATAAAA+3.18
ces-2MA0922.1chrI:677873-677881TTATAAAA+3.18
ces-2MA0922.1chrI:677612-677620TTTATAAT-3.18
ces-2MA0922.1chrI:678265-678273TTTATAAT-3.18
che-1MA0260.1chrI:677713-677718GTTTC-3.06
daf-12MA0538.1chrI:677736-677750TCGGTGTTTGCGTA+3.22
dsc-1MA0919.1chrI:677857-677866TTAATTATA+3.05
dsc-1MA0919.1chrI:677857-677866TTAATTATA-3.05
elt-3MA0542.1chrI:677584-677591TTTGTCA+3.07
elt-3MA0542.1chrI:677902-677909GACAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:678128-678135GATCAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:678169-678176GATAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:677507-677514GATAATA-3.81
fkh-2MA0920.1chrI:678171-678178TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:678231-678238TGTTGAA-3.04
fkh-2MA0920.1chrI:677909-677916AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:677577-677584TGTTTTT-3.09
fkh-2MA0920.1chrI:677876-677883TAAAAAA+3.3
fkh-2MA0920.1chrI:677610-677617TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:677951-677958TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:677982-677989TCAACAT+3.51
lim-4MA0923.1chrI:677858-677866TAATTATA-3.37
lim-4MA0923.1chrI:677554-677562CTAATCAA+3.41
lim-4MA0923.1chrI:677931-677939TGATTAGG-3.41
lim-4MA0923.1chrI:677857-677865TTAATTAT+3
lin-14MA0261.1chrI:678102-678107AACAG+3.01
mab-3MA0262.1chrI:677692-677704ATGTTGCAAAAA+4.7
pal-1MA0924.1chrI:677858-677865TAATTAT-3.54
pha-4MA0546.1chrI:677741-677750GTTTGCGTA-3.18
pha-4MA0546.1chrI:677535-677544ATACAAATA+3.67
pha-4MA0546.1chrI:677979-677988ATATCAACA+3.6
skn-1MA0547.1chrI:677843-677857AAATAATGACGAAT+3.07
skn-1MA0547.1chrI:677636-677650TTCGTCATTATTTC-3.07
skn-1MA0547.1chrI:677503-677517AAATGATAATATTA+3.15
skn-1MA0547.1chrI:677978-677992AATATCAACATTTT-4.91
skn-1MA0547.1chrI:677895-677909TAATCATGACAAAA+5.09
skn-1MA0547.1chrI:677584-677598TTTGTCATGATTAT-5.09
sma-4MA0925.1chrI:677999-678009CTTTCTAGCT+3.17
sma-4MA0925.1chrI:677486-677496ACCAGAAAGT-3.39
unc-86MA0926.1chrI:677809-677816TGCAAAT-3.09
unc-86MA0926.1chrI:677720-677727TGAATAC-3.68
vab-7MA0927.1chrI:677555-677562TAATCAA+3.13
vab-7MA0927.1chrI:677931-677938TGATTAG-3.13
vab-7MA0927.1chrI:677846-677853TAATGAC+3
vab-7MA0927.1chrI:677640-677647TCATTAT-3
vab-7MA0927.1chrI:677858-677865TAATTAT-4.09
zfh-2MA0928.1chrI:677857-677867TTAATTATAA-3.29
zfh-2MA0928.1chrI:677705-677715TTTAATTCGT+3.42
zfh-2MA0928.1chrI:677856-677866TTTAATTATA+3.72
Enhancer Sequence
GAACCAGAAA GTTGAACAAA AATGATAATA TTATATCGAA AAATGGAACA AATACAAATA 60
ATTTTTAGGC CTAATCAAAT TTCCTCCGGA TATTGTTTTT TTTGTCATGA TTATATGTGT 120
CTAAATTTTT TATAATGTGT TTTATAACAA AATTCGTCAT TATTTCCTTC ATTTCAAGCA 180
AAATTTAACA GTTCGAGCTT AAAAATAGAT GTTGCAAAAA ATTTAATTCG TTTCGATGAA 240
TACGGTATAC GGTCGGTGTT TGCGTACTTT GGCGTTTGCG TATGAAGCAT CCTATTTGAC 300
GCACGAAACT TTCAATGAAA TTTAATGCAA ATTCTGCATC GAAAAGGACA TTACGATGGA 360
AATAATGACG AATTTAATTA TAAAACACAT TATAAAAAAT TTAAAAACAT ATAATCATGA 420
CAAAAAAAAC AATGTCCGGA AAAAATTTGA TTAGGCCTAA AATTTATTTT TTATTTTTTT 480
CCATTTATCG ATTCAATATC AACATTTTTG TTCGACTTTC TAGCTCAAAA TTCATAGAAA 540
CTCACGATGG ACATGAAATG ATCACTTTTC AGGAAATATT TTAGGCCAGA TACGTCTATT 600
TCGATCCAGG ATACAAGGAA CAGGCAGCTT TCATGATTTT CTATGATCAA AAAATTAAAA 660
GACCCTATGC TCAACTTGAA AAACCGATAA AAATAGTCAA ATGACCTCAA TTCCATGAAG 720
AAATTCTTGT TGAGAGATAT TACTGTTTGT TGAATGTCGA TCATACTCGT GCGAACTAAG 780
TTTTATAATA GCCTTCGATG AGGCTCGCCG ACTTTCGCAT AGCTGGTGTA GTGGTAGTGA 840
GCACACTTTG CATCCTACAG GTCCCAGGTT CGAACTTCGT C 881