EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00013 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:220017-220945 
TF binding sites/motifs
Number: 68             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:220572-220582AAATCGATAT+3.12
blmp-1MA0537.1chrI:220499-220509TATCGATTTT-3.12
blmp-1MA0537.1chrI:220589-220599TATCGATTTT-3.12
blmp-1MA0537.1chrI:220247-220257AAAATGATGA+3.48
blmp-1MA0537.1chrI:220525-220535AAATTGATAA+3.86
blmp-1MA0537.1chrI:220265-220275AAAGTGATAA+4.37
blmp-1MA0537.1chrI:220725-220735AAAGTGAAAA+6.34
ceh-48MA0921.1chrI:220877-220885TATCGAAG-3.01
ceh-48MA0921.1chrI:220889-220897ATCAATTT+3.03
ceh-48MA0921.1chrI:220324-220332ATCGATGT+3.19
ceh-48MA0921.1chrI:220119-220127TATTGATT-4.21
ceh-48MA0921.1chrI:220358-220366TATTGATT-4.21
ceh-48MA0921.1chrI:220574-220582ATCGATAT+4.57
ceh-48MA0921.1chrI:220499-220507TATCGATT-4.57
ceh-48MA0921.1chrI:220589-220597TATCGATT-4.57
ceh-48MA0921.1chrI:220658-220666TATCGGTT-4.8
ces-2MA0922.1chrI:220581-220589TAACTTAA+3.12
ces-2MA0922.1chrI:220424-220432TTTTGTAA+3.19
ces-2MA0922.1chrI:220699-220707TACAGAAT-3.27
ces-2MA0922.1chrI:220425-220433TTTGTAAT-3.45
che-1MA0260.1chrI:220465-220470GCTTC-3.7
dsc-1MA0919.1chrI:220271-220280ATAATTACA+3.08
dsc-1MA0919.1chrI:220271-220280ATAATTACA-3.08
dsc-1MA0919.1chrI:220385-220394ATAATTACT+3.35
dsc-1MA0919.1chrI:220385-220394ATAATTACT-3.35
efl-1MA0541.1chrI:220171-220185CTTTGGCGGCCGAG-3.57
elt-3MA0542.1chrI:220656-220663TTTATCG+3.07
elt-3MA0542.1chrI:220806-220813TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrI:220480-220487GTTAAAA-3.14
elt-3MA0542.1chrI:220825-220832GGTAAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:220567-220574GATAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:220289-220296GATAAGG-4.05
elt-3MA0542.1chrI:220530-220537GATAAAA-4.31
fkh-2MA0920.1chrI:220569-220576TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:220914-220921TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:220147-220154AAAACAC+3.08
fkh-2MA0920.1chrI:220664-220671TTTTTAC-3.26
fkh-2MA0920.1chrI:220654-220661TTTTTAT-3.3
fkh-2MA0920.1chrI:220739-220746TAAAAAA+3.4
fkh-2MA0920.1chrI:220399-220406TCAACAG+3.55
lim-4MA0923.1chrI:220272-220280TAATTACA-3.22
lim-4MA0923.1chrI:220386-220394TAATTACT-3.39
mab-3MA0262.1chrI:220857-220869AGTCGCAAAATT-3.02
mab-3MA0262.1chrI:220641-220653TTGCTGCGGAAT+3.73
pal-1MA0924.1chrI:220272-220279TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrI:220386-220393TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrI:220447-220454TTATTGC-3.69
pal-1MA0924.1chrI:220755-220762CAATGAA+3
pal-1MA0924.1chrI:220638-220645TCATTGC-3
pha-4MA0546.1chrI:220120-220129ATTGATTTT-3.55
pha-4MA0546.1chrI:220359-220368ATTGATTTT-3.55
pha-4MA0546.1chrI:220550-220559GTTTGCCCA-4.08
skn-1MA0547.1chrI:220218-220232ATACCATGATAATG+3.72
skn-1MA0547.1chrI:220248-220262AAATGATGACCAAT+3.79
skn-1MA0547.1chrI:220297-220311ATATGATGAAGTTT+4.45
sma-4MA0925.1chrI:220185-220195TTTTCTAGGC+3.22
sma-4MA0925.1chrI:220142-220152CCTAGAAAAC-3.22
unc-86MA0926.1chrI:220382-220389TTAATAA-3.32
vab-7MA0927.1chrI:220272-220279TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrI:220386-220393TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrI:220227-220234TAATGAA+3.35
vab-7MA0927.1chrI:220272-220279TAATTAC+3.6
vab-7MA0927.1chrI:220386-220393TAATTAC+3.6
zfh-2MA0928.1chrI:220378-220388AAAATTAATA-3.08
zfh-2MA0928.1chrI:220271-220281ATAATTACAA-3.18
zfh-2MA0928.1chrI:220270-220280GATAATTACA+3.33
zfh-2MA0928.1chrI:220384-220394AATAATTACT+3.35
zfh-2MA0928.1chrI:220385-220395ATAATTACTT-3.43
Enhancer Sequence
CGGAGTGTCG TCGGATTCCG GTGTGTTGCT ACGGATCGTG TCGTCCATGC TCAGCTTCAT 60
CGTCGATTGA CGTCGCCGTT TTGTGGTGAT CTGAGCGAGA TTTATTGATT TTTAAAGGCG 120
CATGGCCTAG AAAACACAAC ACTTCGGCCA CGGACTTTGG CGGCCGAGTT TTCTAGGCCA 180
TGCTGCGGCA TTTAAAGGCA CATACCATGA TAATGAAGAT CGCCAATCCG AAAATGATGA 240
CCAATGCGAA AGTGATAATT ACAATCATCG ATGATAAGGA ATATGATGAA GTTTGCGTGG 300
AAATCGAATC GATGTACGCT TGTGACGTCA TTCCTGGAAA TTATTGATTT TTTTTTGGAA 360
AAAAATTAAT AATTACTTAC CGTCAACAGT AACACTCAAC GAGTCAATTT TGTAATCCGA 420
AATCATAGAG TTATTGCGTG AAAATGCGGC TTCCAACCTG AATGTTAAAA AAAAATCTAT 480
AATATCGATT TTTTGAAAGT TTTTCGAAAA ATTGATAAAA TTGACGATTG ATTGTTTGCC 540
CATAGAAACA GATAAAAATC GATATAACTT AATATCGATT TTTTTTTGTG CACCTTTAAA 600
GAGTACTGTA ACTTCAAACT TTCATTGCTG CGGAATTTTT TTATCGGTTT TTACAATTTT 660
TTGTACAGTT TCCGTCCAAT TTTACAGAAT TGAACAACAA CAGAAGGAAA AGTGAAAAAT 720
CGTAAAAAAT GTCCGCAGCA ATGAAAGTTT GAAGTTACAG TACTCTTTAA AGGCGCACAC 780
CTTTTTTGTT TTAACAAAAA TTTGTCGTGG TAAGACTGGG GACCGTTTTT TCGGCGGAGA 840
AGTCGCAAAA TTTCGGCTAA TATCGAAGAA AAATCAATTT CCAACAGCAG CGACACATAA 900
AAATTAGCAA AAAATTGTGA TTTTAGCC 928