EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00009 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:198207-198705 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:198499-198509AAGTTGATAA+3.28
blmp-1MA0537.1chrI:198564-198574CATCACTCTC-3.36
blmp-1MA0537.1chrI:198462-198472AAATTGAAAA+4.82
ceh-48MA0921.1chrI:198520-198528ATCGATTT+3.4
ceh-48MA0921.1chrI:198338-198346TTCGATAG+3.54
ceh-48MA0921.1chrI:198309-198317TATCGGAC-3.62
ceh-48MA0921.1chrI:198519-198527AATCGATT-3.67
ces-2MA0922.1chrI:198547-198555TTATACAA+4.13
che-1MA0260.1chrI:198263-198268GTTTC-3.06
che-1MA0260.1chrI:198247-198252GCTTC-3.7
elt-3MA0542.1chrI:198605-198612GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:198457-198464GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:198504-198511GATAAAA-4.31
fkh-2MA0920.1chrI:198506-198513TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:198332-198339TATACAT+3.12
fkh-2MA0920.1chrI:198281-198288TTTTTAC-3.19
fkh-2MA0920.1chrI:198534-198541TAAAAAA+3.4
lin-14MA0261.1chrI:198627-198632TGTTC-3.14
sma-4MA0925.1chrI:198211-198221ACTAGACAAA-3.51
unc-86MA0926.1chrI:198332-198339TATACAT+3.07
zfh-2MA0928.1chrI:198585-198595TAAATTAATG-3.26
Enhancer Sequence
ATAAACTAGA CAAAGTTCAA ATATATTCCC AACAGGGATG GCTTCACCCG TGACCCGTTT 60
CACCCGTTCA CCCATTTTTA CAAGGGAAGG TTCTGAACTC GTTATCGGAC TTCGTTACGC 120
CACTATATAC ATTCGATAGA GAATGGTTAC AGATGATCAC TCCAAAAAAT TTAGCTGCTT 180
CAGAGCAGGT TCGACCAAGT TACGACACTT TGAAGATGCC GAAAAAAAAA ATCATTGATG 240
CACCCCCTTT GAAAAAAATT GAAAATTTTC ACTGAAAATT TTTTTTTTCT GAAAGTTGAT 300
AAAAATAGTT GTAATCGATT TAAATAGTAA AAAACATATA TTATACAAGT TTTAGCCCAT 360
CACTCTCAAA AAAACCCTTA AATTAATGTA CATATCTTGA GAAAAATTCC AAAAAGTAGA 420
TGTTCATGTA GATCAATTTA AGGGAGAATT ATGAACTGAA ACTTGTATGG TATGATTTTT 480
CCATCATTTG CAACTATT 498